Khóa luận tốt nghiệp đề tài nghiên cứu đặc tính sinh học phân tử các chủng marek lưu hành tại việt nam trong năm 2022

BÁO CÁO KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP BÁO CÁO KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP Đề tài Nghiên cứu đặc tính sinh học phân tử các chủng Marek lưu hành tại Việt Nam trong năm 2022 Sinh viên thực hiện Lớp Mã sinh viên Giảng vi.

BÁO CÁO KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP Đề tài: Nghiên cứu đặc tính sinh học phân tử chủng Marek lưu hành Việt Nam năm 2022 Sinh viên thực hiện: Vũ Thu Hằng Lớp: TYC-K62 Mã sinh viên: 623105 Giảng viên hướng dẫn: PGS.TS Lê Văn Phan Bộ môn: VI SINH VẬT TRUYỀN NHIỄM Nội dung báo cáo Đặt vấn đề Kết thảo luận 01 02 03 04 Nội dung, nguyên liệu phương pháp nghiên cứu Kết luận kiến nghị PHẦN I: ĐẶT VẤN ĐỀ 1.1 Tính cấp thiết đề tài Bệnh xuất số trang trại công ty chăn nuôi gà lớn năm 2021 Nghiên cứu đặc tính sinh học phân tử chủng Marek lưu hành Tỷ lệ mắc bệnh tử vong cao Việt Nam năm 2022 Các nghiên cứu giám sát lưu hành chủng vi rút Marek thực địa nước hạn chế 1.2 Mục đích đề tài Khảo sát xác định đặc điểm sinh học phân tử số chủng Marek gây bệnh gà số tỉnh miền Bắc Việt Nam năm 2022 PHẦN II: NỘI DUNG, NGUYÊN LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Đối tượng, thời gian địa điểm Đối tượng nghiên cứu Thời gian Những mẫu bệnh phẩm gà nghi mắc bệnh Marek gây thu thập Tháng 03/2022 – 08/2022 năm 2022 Địa điểm Phòng Virus - Phịng thí nghiệm trọng điểm cơng nghệ sinh học thú y - khoa Thú y - Học viện Nông Nghiệp Việt Nam 2.2 Nội dung nghiên cứu Chẩn đoán bệnh Marek Giải trình tự phân tích mẫu bệnh phẩm trình tự vùng gen Meq phương pháp PCR chủng gây bệnh Marek Thu thập mẫu bệnh phẩm gà nghi mắc bệnh Marek 2.3 Phương pháp nghiên cứu Thu thập xử lý mẫu bệnh phẩm Dựa theo TCVN 8400-30: 2015 Phươ ng pháp tách chi ết DNA Kit Patho Gene-spin TM DNA/RNA Phươ ng pháp PCR Sử dụng cặp mồi Ola Hassanin/2013 Phương pháp điện di Gel agarose Phươ ng pháp giải trình tự Công ty 1st BASE – Malaysia DNAstar - Bioedit Phương pháp PCR Bảng Thông tin cặp mồi sử dụng nghiên cứu Tên mồi Trình tự mồi (5’ – 3’) Meq-F ATG TCT CAG GAG CCA GAG CCG Kích thước (bp) Tác giả (Ola Hassanin et al., 1020bp Meq-R GGG TCT CCC GTC ACC TGG 2013) PHẦN III: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 Kết thu thập mẫu bệnh phẩm để chẩn đoán vi rút gây bệnh Marek (MD) STT Tên mẫu Loại bệnh phẩm Loại gà Địa điểm Thời gian thu thập VNUA Gan, lách, não Gà đẻ Bắc Giang 29/03/202 VNUA Gan, lách Gà đẻ Vĩnh Phúc 10/04/2022 VNUA Tuyến ức Gà thịt Bắc Giang 16/04/2022 VNUA Gan, lách, túi Fabricius Gà đẻ Thái Nguyên 17/04/2022 VNUA Da lông Gà thịt Vĩnh Phúc 10/05/2022 Bảng Thông tin mẫu thu th ập đ ược s d ụng nghiên c ứu 3.2 Kết chẩn đoán vi rút gây bệnh Marek phương pháp PCR Chú thích: Sản phẩm PCR dương tính có kích thước 1020bp; Giếng M: DNA ladder kb; Giếng - 5: Các mẫu bệnh phẩm tương ứng với mẫu bệnh phẩm mô tả bảng 4.1; (+) : Đối chứng dương sử dụng chủng vi rút Marek từ vacxin nhược độc thị trường CIV-988; (-) : Đối chứng âm sử dụng nước tinh khiết Hình Kết ph ản ứng PCR 3.2 Kết chẩn đoán vi rút gây bệnh Marek phương pháp PCR STT Tên mẫu Loại bệnh phẩm Loại gà Địa điểm Thời gian thu th ập Kết VNUA Gan, lách Gà đẻ Bắc Giang 29/03/2022 + VNUA Gan, lách Gà đẻ Vĩnh Phúc 10/04/2022 + VNUA Tuyến ức Gà thịt Bắc Giang 16/04/2022 - VNUA Gan, lách, túi Fabricius Gà đẻ Thái Nguyên 17/04/2022 + VNUA Da lông Gà thịt Vĩnh Phúc 10/05/2022 + Bảng 4.2 Thơng tin kết ch ẩn đốn bệnh Marek ph ản ứng PCR 3.3 Kết phân tích trình tự vùng gen Meq Hình 4.2 Kết giải trình tự nucleotide acid amin vùng gen Meq c ch ủng vi rút thu th ập đ ược 3.3 Kết phân tích trình tự vùng gen Meq     Tỷ lệ tương đồng nucleotide (%) STT Ký tự 10 11 12 VNUA   100 99,22 99,02 84,63 84,63 98,92 84,63 84,54 84,54 99,9 VNUA 100   99,22 99,02 84,63 84,63 98,92 84,63 84,54 84,54 99,9 AF493551 98,23 98,23   99,8 84,8 84,8 98,73 84,63 84,54 84,71 99,12 AY243334 97,64 97,64 99,41   84,63 84,8 98,73 84,46 84,38 84,88 98,92 AY362707 83,67 83,67 84,67 84,17   99,83 84,21 99,67 99,67 99,75 84,54 AY362708 83,67 83,67 84,67 84,67 99,5   84,38 99,5 99,5 99,92 84,54 AY362725 97,35 97,35 97,05 97,05 82,91 83,17   84,21 84,13 84,29 98,82 EF523771 83,92 83,92 84,17 83,67 98,99 98,49 82,91   99,67 99,42 84,54 10 EF523773 83,67 83,67 84,17 83,67 99,25 98,74 82,91 99,25   99,42 84,46 11 EU032468 83,42 83,42 84,42 84,92 99,25 99,75 82,91 98,24 98,49   84,46 12 HQ638141 99,71 99,71 97,94 97,35 83,42 83,42 97,05 83,67 83,42 83,17 Bảng Sự t ương đồng trình t ự Amino acid nuclotide giTỷ ữalệcác ch ủđồng ng l hành tacid ại Vi ệt Nam ch ủng tham chi ếu tương vều amino (%)   3.4 Kết phân tích phả hệ chủng vi rút gây bệnh Marek Hình 4.3 Cây ph ả hệ (phylogenetic tree) d ựa trình t ự vùng gen Meq c vi rút gây bệnh Marek PHẦN IV: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ KẾT LUẬN  Bằng kỹ thuật PCR chẩn đoán 4/5 mẫu b ệnh phẩm c gà KIẾN NGHỊ  Tiếp tục thu thập mẫu từ gà nghi mắc bệnh Marek địa dương tính với vi rút Marek  phương khác nước để phục vụ điều tra dịch tễ học, giải trình Kết giải trình tự gen phân tích trình t ự vùng gen Meq c vi rút tự để sớm phát biến đổi kiểu gen chẩn đoán, xác Marek cho thấy chủng vi rút Marek nghiên cứu có m ức độ định bệnh sớm tương đồng với trình tự nuclotide dao đ ộng t 99,9% trình tự aa dao động từ 99.71%  Kết phân tích phả hệ cho thấy chủng vi rút gây b ệnh Marek nghiên cứu nằm nhánh v ới chủng vi rút đ ộc l ực cao DY01 Trung Quốc  Phân lập vi rút Marek phục vụ việc nghiên cứu, phát triển s ản xuất loại vacxin phòng bệnh hiệu quả, kiểm soát tốt dịch bệnh kịp thời hạn chế thiệt hại kinh tế cho người chăn nuôi CẢM ƠN THẦY CÔ GIÁO VÀ CÁC BẠN ĐÃ LẮNG NGHE ! ... Nghiên cứu đặc tính sinh học phân tử chủng Marek lưu hành Tỷ lệ mắc bệnh tử vong cao Việt Nam năm 2022 Các nghiên cứu giám sát lưu hành chủng vi rút Marek thực địa nước hạn chế 1.2 Mục đích đề. .. 1.2 Mục đích đề tài Khảo sát xác định đặc điểm sinh học phân tử số chủng Marek gây bệnh gà số tỉnh miền Bắc Việt Nam năm 2022 PHẦN II: NỘI DUNG, NGUYÊN LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Đối tượng,... vấn đề Kết thảo luận 01 02 03 04 Nội dung, nguyên liệu phương pháp nghiên cứu Kết luận kiến nghị PHẦN I: ĐẶT VẤN ĐỀ 1.1 Tính cấp thiết đề tài Bệnh xuất số trang trại công ty chăn nuôi gà lớn năm