Khoá học vi sinh vật học môi trường

Khố học: Vi sinh vật học mơi trường By: PGS TS GV Cao cấp Ngơ Tự Thành Khố học: Vi sinh vật học môi trường By: PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành Online: < http://voer.edu.vn/content/col10507/1.1/ > Thư viện Học liệu Mở Việt Nam This selection and arrangement of content as a collection is copyrighted by PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành It is licensed under the Creative Commons Attribution 3.0 license (http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/) Collection structure revised: July 18, 2011 PDF generated: July 18, 2011 For copyright and attribution information for the modules contained in this collection, see p 23 Table of Contents Tổng quan khoá học Chi tiết môn học 3 Lịch học 11 Tài liệu cần đọc 15 Bài giảng, ghi chép lớp 17 Bài tập, chủ đề thảo luận 19 Tiểu luận cuối khoá 21 Index 22 Attributions 23 iv Chương Tổng quan khố học Tên mơn học: Vi sinh vật học mơi trường Đối tượng học: • Sinh viên ngành sinh học, công nghệ sinh học, công nghệ mơi trường, ngành liên quan • Học viên cao học nghiên cứu sinh ngành nói Giáo viên: PGS TS Giảng viên cao cấp Ngô Tự Thành Nội dung tóm tắt • Phần I Những khái niệm vi sinh vật Trong phần cung cấp hiểu biết vi sinh vật như: vi sinh vật gì, đặc tính chung chúng, vai trò chúng tự nhiên đời sống sản xuất người, cấu tạo chức hai loài tế bào vi sinh vật (procaryot eucargot), dinh dưỡng, sinh trưởng trao đổi chất vi sinh vật, chu trình sinh địa hóa với tham gia vi sinh vật • Phần II Giới thiệu số nhóm vi sinh vật Ở đây, ba lãnh giới vi sinh vật nói chung mà vi sinh vật thuộc lãn giới giới thiệu, dạng nhóm quan trọng Ba lãnh giới là: vi khuẩn, cổ khuẩn sinh vật có nhân thật • Phần III Vi sinh vật xử lý môi trường ô nhiễm Trong phần chủ đề sau đề cập: • • • • • • • • • • • Những ô nhiễm môi trường Phân hủy sinh học, hư hỏng sinh học, xử lý sinh học, phục hồi sinh học Màng sinh học Sự trao đổi chất Khả vi sinh vật phân hủy số nhóm chất Sự phân hủy sinh học số chất hữu đặc biệt Những nhân tố ảnh hưởng đên phân hủy sinh học Xử lý in situ ex situ Phục hồi sinh học, pha rắn, pha bùn, pha khí Xử lý sinh học chất thải rắn hữu Xử lý nước thải This content is available online at CHƯƠNG TỔNG QUAN KHOÁ HỌC Qua việc chủ đề đây, môn học nhằm cung cấp cho người học vấn đề vi sinh vật học hóa học liên quan đến cử lý sinh học môi trường ô nhiễm nguyên lý kỹ thuật xử lý sinh học • Phần IV Vi sinh vật bảo vệ mơi trường Trong phần này, vai trị vi sinh vật việc bảo vệ môi trường thể qua khả thay chúng sản phẩm hóa học vốn dùng lâu gây hại cho môi trường Những khả thay thể qua: • • • • Thuốc trừ sâu sinh học Polyme sinh học Nhiên liệu sinh học Phân sinh học Chương Chi tiết môn học 2.1 PHẦN I NHỮNG KHÁI NIỆM CƠ BẢN VỀ VI SINH VẬT 2.1.1 Chương VI SINH VẬT TRONG TỰ NHIÊN VÀ TRONG ĐỜI SỐNG, SẢN XUẤT CỦA CON NGƯỜI • Khái niệm mở đầu vi sinh vật • Vi sinh vật chủng loại phát sinnh sinh giới • Những đặc tính chung vi sinh vật · · · · · · · · · · Về kích thước, hình dạng Về tỉ lệ s/v Về tiếp xúc với mơi trường Về tố độ hấp thu chuyển hóa Về sinh trưởng sinh sản Về đa dạng trao đổi chất Về khả thích ứng cá thể Về thihs ứng di truyền Về tồn chúng trái đất Đối với nghiên cứu sinh học • Vai trị vi sinh vật tự nhiên • Vai trị vi sinh vật đời sống sản xuất người 2.1.2 Chương : CẤU TRÚC VÀ CHỨC NĂNG CỦA TẾ BÀO PROCARYOT 2.1 Mở đầu 2.2 Khái quát cấu trúc tế bào procaryot 2.2.1 Kích thước, hình dạng xếp tế bào 2.2.2 Sự tổ chức tế bào procaryot 2.3 Các màng tế bào procaryot 2.3.1 Đại cương 2.3.2 Màng sinh chất 2.3.3 Các hệ thống màng lòng khối sinh chất Câu hỏi 2.4 Khối chất nguyên sinh This content is available online at CHƯƠNG CHI TIẾT MÔN HỌC 2.4.1 Đại cương 2.4.2 Các thể ẩn nhập ( Inclusion Bodies) Bạn có biết? bạn nghĩ gì? Các nam châm sống 2.4.3 Các ribosom (Ribosomes) Câu hỏi 2.5 Nucleoit (Nucleoid) 2.6 CÁc plasmid ( Plasmids) 2.7.Thành tế bào procaryot 2.7.1 Đại cương 2.7.2 Cấu trúc peptidoglycan 2.7.3 Thành tế bào vi khuẩn gram dương 2.7.4 Thành tế bào vi khuẩn gram âm 2.7.5 Cơ chế nhuộm Gram 2.7.6 Thành tế bào bảo vệ chống áp suất thẩm thấu bất lợi Câu hỏi 2.8 tiết protein tế bào procaryot 2.8.1 Đại cương 2.8.2 Sự tiết protein theo kiểu phụ thuộc Sec 2.8.3 Sự tiết protein theo kiểu II 2.8.4 Sự tiết protein theo kiểu I (kiểu ABC) 2.1.3 Chương : CẤU TRÚC VÀ CHỨC NĂNG CỦA TẾ BÀO EUCARYOT 3.1 Mở đầu 3.2 Khái quát cấu trúc tế bào eucaryot 3.3.khối sinh chất Câu hỏi 3.4 Lưới nội chất 3.5 Bộ máy Golgi 3.6 Lysosom nhập bào Câu hỏi 3.7 Các ribosom Câu hỏi 3.8 Các ty thể 3.9 Các lạp thể Bạn có biết? Bạn nghĩ gì? Nguồn gốc tế bào eucaryot Câu hỏi 3.10 Nhân tế bào vai trị trọng phân bào Câu hỏi 3.11 Những cấu trúc bên gnoaif màng tế bào 3.12 Cilia flagella Câu hỏi 3.13.So sánh tế bào procaryot tế bào eucaryot 2.1.4 Chương : DINH DƯỠNG CỦA VI SINH VẬT 4.1 Mở đầu Câu hỏi 4.2 Thành phần nguyên tố tế bào liên quan đến nhu cầu dinh dưỡng 4.2.1 Thành phần nguyên tố tế bào Chương Lịch học Tóm tắt lịch học: 45 tiết : tiết/buổi = buổi Buổi 1: Chương 1-4, Buổi 2: Chương 5-7, Buổi 3: Chương 8-11, Buổi 4: Chương 11-12 Buổi 5: Chương 14-15, Buổi 6: Chương 16-17, Buổi 7: Chương 18-20, Buổi 8: Chương 21-22 Buổi 9: Chương 23-26 Chi tiết lịch học: Chủ đề (chương) Nội dung tóm tắt Chương VI SINH VẬT TRONG TỰ NHIÊN VÀ TRONG ĐỜI SỐNG, SẢN XUẤT CỦA CON NGƯỜI • Vi sinh vật chủng loại phát sinh sinh giới; đặc tính chung vi sinh vật; vai trị chúng tự nhiên người Chương CẤU TRÚC VÀ CHỨC NĂNG CỦA TẾ BÀO PROCARYOT Chương CẤU TRÚC VÀ CHỨC NĂNG CỦA TẾ BÀO EUCARYOT • Ở chương mơ tả cấu trúc hai loại tế bào nói phân tích chức cấu trúc ấy, nhấn mạnh khác hai loại tế bào qua cấu trúc nêu continued on next page This content is available online at 11 12 Chương CHƯƠNG LỊCH HỌC DINH DƯỠNG CỦA VI SINH VẬT • Thành phần hóa học tế bào lien quan đến nhu cầu dinh dưỡng • Nhu cầu dinh dưỡng nhu cầu dinh dưỡng bổ sung • Phân loại mơi trường dinh dưỡng • Các kiểu dinh dưỡng • Sự vận chuyển chất dinh dưỡng vào tế bào Chương SINH TRƯỞNG CỦA VI SINH VẬT • • • • • Chương Các kiểu sinh trưởng tế bào Sinh trưởng quần thể vi khuẩn Biểu diễn sinh trưởng Sinh trưởng gián đoạn sinh trưởng liên tục Kiểm soát sinh trưởng ˆ CỦA TRAO CÁC CON ĐƯỜNG TRUNG TAM ĐỔI CHẤT Ở VI SINH VẬT • Trao đổi chất trao đổi lượng • Các đường trung tâm • Điều hịa trao đổi chất Chương CÁC CHU TRÌNH SINH-ĐỊA HĨA • Tuần hồn vật chất • Các chu trình C,N,S,P Chương GIỚI THIỆU BA LÃNH GIỚI SINH VẬT VỚI MỘT SỐ NHÓM VI SINH VẬT- Các lãnh giới vi khuẩn, cổ khuẩn eucarya Chương MỘT SỐ NHĨM VI KHUẨN- Các nhóm vi khuẩn đường ruột, xạ khuẩn, Bacillus, Chương 10 MỘT SỐ NHĨM CỔ KHUẨN- Các nhóm Thermoproteus, Pyrolobus, Pyrodictium, Thermoplasma, continued on next page 13 Chương 11 ˆ THẬTMỘT SỐ NHĨM VI SINH VẬT CĨ NHAN Các nhóm nấm mốc, tảo, động vật nguyên sinh, Chương 12 NHỮNG KHÁI NIỆM MỞ ĐẦU VỀ XỬ LÝ SINH HỌC- Sự ô nhiễm môi trường- Phân hủy sinh học xử lý sinh học- Màng sinh học- Sự đồng trao đổi chất ˆ HỦY KHẢ NĂNG CỦA VI SINH VẬT PHAN Chương 13 Chương 14 Chương 15 MỘT SỐ NHÓM CHẤT- Các chất tự nhiên phi tự nhiên- Các nhóm chất: Cacbonhydrat, protein, lipid, ˆ HỦY SINH HỌC MỘT SỐ CHAT ˆ HỮU SỰ PHAN CƠ ĐẶC BIỆT- Các hydratcacbon- Các hợp chất béo halogen hóa- Các hợp chất thơm halogen hóa ˆ TỐ ẢNH HƯỞNG ĐẾN SỰ NHỮNG NHAN ˆ PHAN HỦY SINH HỌC- Những nhân tố thuộc môi trường- Những nhân tố thuộc vi sinh vật Chương 16 PHỤC HỒI IN SITU ĐỐI VỚI NƯỚC NGẦM- Các phương pháp: thấm lọc; bơm để xử lý tái tuần hoàn; phun khơng khí Chương 17 PHỤC HỒI IN SITU ĐỐI VỚI ĐẤT- Các phương pháp: hút từ đất, thông khí cách sinh học Chương 18 PHỤC HỒI SINH HỌC PHA RẮN- Các phương pháp: làm đất, ủ đống Chương 19 PHỤC HỒI SINH HỌC PHA BÙN- Tiền xử lý- Các kiểu nồi phản ứng- Xử lý Chương 20 PHỤC HỒI SINH HỌC PHA KHÍ- Các lọc sinh học- Các lọc sinh học chảy giọt Chương 21 XỬ LÝ SINH HỌC CHẤT THẢI RẮN HỮU CƠThành phần hóa học chất thải rắn hữu cơ- Các trình vi sinh vật học xử lý chất thải rắn hữu cơ- Các phương pháp: làm đất, ủ đống, chôn lấp continued on next page 14 Chương 22 Chương 23 Chương 24 CHƯƠNG LỊCH HỌC XỬ LÝ NƯỚC THẢI- Các đặc trưng nước thải- Các mức độ yêu cầu xử lý nước thải- Xử lý bậc một, bậc hai bậc ba ˆ SINH HỌC “THUỐC TRỪ SAU” Chương 25 POLYME SINH HỌC ˆ SINH HỌC PHAN Chương 26 NHIÊN LIỆU SINH HỌC Table 3.1 Chương Tài liệu cần đọc - Vi sinh vật học (Nguyễn Lân Dũng), VOER trang 458-494; 519; - Brock Biology of Microorganisms (M.T Madigan, J.M Martinko), Eleventh Edition, 2006; trang 909913 This content is available online at 15 16 CHƯƠNG TÀI LIỆU CẦN ĐỌC Chương Bài giảng, ghi chép lớp • Danh mục file PowerPoint giảng lớp (Đang cập nhật) • Danh mục ghi chép lớp sinh viên (đang cập nhật) This content is available online at 17 18 CHƯƠNG BÀI GIẢNG, GHI CHÉP TRÊN LỚP Chương Bài tập, chủ đề thảo luận - Những đặc tính chung vi sinh vật - Vai trò vi sinh vật tự nhiên người - So sánh tế bào procaryot eucaryot - Nhu cầu dinh dưỡng nhu cầu dinh dưỡng bổ sung - Các kiểu dinh dưỡng - Các chế vận chuyển chất dinh dưỡng vào tế bào - Phân biệt sinh trưởng vi sinh vật với sinh trưởng động vật thực vật - Phân biệt sinh trưởng tế bào vi sinh vật quần thể vi sinh vật - Phân tích giai đoạn sinh trưởng gián đoạn - Nguyên lý sinh trưởng liên tục - Phân tích khác đường trao đổi chất sau đây: đường phân, pentosephosphate, KDPG, Krebs - Điều hòa trao đổi chất - Ý nghĩa tuần hồn vật chất - Phân tích chu trình cacbon nitơ tự nhiên - Phân tích khác giữa: phân hủy sinh học, hư hỏng sinh học, xử lý sinh học, phục hồi sinh học - Vai trò màng sinh học - Vai trò đồng trao đổi chất - Phân tích nhân tố ảnh hưởng đến phân hủy sinh học - Phân biệt phân tích xử lý in situ ex situ - Phân tích vai trị vi sinh vật bảo vệ môi trường This content is available online at 19 20 CHƯƠNG BÀI TẬP, CÁC CHỦ ĐỀ THẢO LUẬN Chương Tiểu luận cuối khoá Danh sách chủ đề để làm tiểu luận cuối khóa học: - Màng sinh học (biofilm) - Sự đồng trao đổi chất (cometabolism) - Lọc sinh học (biofilter) - Lọc sinh học chảy giọt (biotrickling filter) - Polyme sinh học (biopolymer) - Phân sinh học (biofertilizer) - Nhiên liệu sinh học (biofuel) This content is available online at 21 22 INDEX Index of Keywords and Terms Keywords are listed by the section with that keyword (page numbers are in parentheses) Keywords not necessarily appear in the text of the page They are merely associated with that section Ex apples, ➜ 1.1 (1) Terms are referenced by the page they appear on Ex apples, B giảng, ➜ 5(17) G ghi chép, ➜ 5(17) L lecture notes, ➜ 5(17) lịch học, ➜ 3(11) M môi trường, ➜ 1(1), ➜ 4(15) T thảo luận, ➜ 6(19) tiểu luận, ➜ 7(21) V vi sinh vật, ➜ 4(15) Vi sinh vật học, ➜ 1(1) Vi sinh vật học môi trường, ➜ 2(3), ➜ 3(11), ➜ 5(17), ➜ 6(19), ➜ 7(21) ATTRIBUTIONS Attributions Collection: Khoá học: Vi sinh vật học môi trường Edited by: PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành URL: http://voer.edu.vn/content/col10507/1.1/ License: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/ Module: "Giới thiệu tóm tắt môn học Vi sinh vật học môi trường" Used here as: "Tổng quan khoá học" By: PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành URL: None Pages: 1-2 Copyright: License: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/ Module: "Nội dung chi tiết môn học – Vi sinh vật học môi trường" Used here as: "Chi tiết môn học" By: PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành URL: None Pages: 3-9 Copyright: License: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/ Module: "Lịch học môn Vi sinh vật học môi trường" Used here as: "Lịch học" By: PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành URL: None Pages: 11-14 Copyright: License: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/ Module: "Tài liệu cần đọc" By: PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành URL: None Page: 15 Copyright: License: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/ Module: "Bài giảng lớp, ghi chép lớp - Vi sinh vật học môi trường" Used here as: "Bài giảng, ghi chép lớp" By: PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành URL: None Page: 17 Copyright: License: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/ Module: "Các chủ đề thảo luận (Discussion) - Vi sinh vật học môi trường" Used here as: "Bài tập, chủ đề thảo luận" By: PGS TS GV Cao cấp Ngô Tự Thành URL: None Page: 19 Copyright: License: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/ 23 24 Module: "Tiểu luận cuối khoá - Vi sinh vật học môi trường" Used here as: "Tiểu luận cuối khố" By: PGS TS GV Cao cấp Ngơ Tự Thành URL: None Page: 21 Copyright: License: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/ ATTRIBUTIONS Khố học: Vi sinh vật học mơi trường Mơn học gồm phần 26 chương Tên môn học: Vi sinh vật học môi trường Đối tượng học: - Sinh viên ngành sinh học, công nghệ sinh học, công nghệ môi trường, ngành liên quan; Học viên cao học nghiên cứu sinh ngành nói Giáo viên: PGS TS Giảng viên cao cấp Ngô Tự Thành About Thư viện Học liệu Mở Việt Nam Rhaptos is a web-based collaborative publishing system for educational material ... ATTRIBUTIONS Khoá học: Vi sinh vật học môi trường Môn học gồm phần 26 chương Tên môn học: Vi sinh vật học môi trường Đối tượng học: - Sinh vi? ?n ngành sinh học, công nghệ sinh học, công nghệ môi trường, ... quan khố học Tên mơn học: Vi sinh vật học mơi trường Đối tượng học: • Sinh vi? ?n ngành sinh học, công nghệ sinh học, cơng nghệ mơi trường, ngành liên quan • Học vi? ?n cao học nghiên cứu sinh ngành... Qua vi? ??c chủ đề đây, môn học nhằm cung cấp cho người học vấn đề vi sinh vật học hóa học liên quan đến cử lý sinh học môi trường ô nhiễm nguyên lý kỹ thuật xử lý sinh học • Phần IV Vi sinh vật