TIẾP CẬN CHẨN ĐOÁN CÁC BẤT THƯỜNG DI TRUYỀN BẰNG NGS: GIẢI PHÁP TOÀN DIỆN TỪ CNV-seq, PANEL GEN, ĐẾN CES. BS. Nguyễn Vạn Thông

TIẾP CẬN CHẨN ĐOÁN CÁC BẤT THƯỜNG DI TRUYỀN BẰNG NGS: GIẢI PHÁP TOÀN DIỆN TỪ CNV-seq, PANEL GEN, ĐẾN CES BS Nguyễn Vạn Thông Khoa GPB-TB- Di truyền Bệnh viện Hùng Vương Nội dung • Các loại bất thường di truyền – Bất thường nhiễm sắc thể – Bất thường CNV – Bất thường đơn gen • Chỉ định xét nghiệm – Sơ sinh, sau sinh – Carrier screening Các thời điểm sàng lọc Sàng lọc trước mang thai Chẩn đốn phơi tiền làm tổ Sàng lọc/chẩn đốn trước sinh Sàng lọc sơ sinh -10 Mb RAD: QF-PCR/ FISH Karyotype NST 1% CNV-seq / Microarray CNV 1% BoBs Prenatal 50 400 kb FISH microdeletion, MLPA Đơn gen Đơn gen 1% Panel gen CES (G4500) Nu WES Độ phân giải WGS Target Whole genome Tiếp cận di truyền Trước Phenotype Tiền sử Khám lâm sàng Thường gặp Hiếm gặp Xét nghiệm di truyền Genotype Kết Hạn chế kỹ thuật Chi phí cao Tiếp cận di truyền Ngày Phenotype Xét nghiệm di truyền Genotype Kết Micro array NGS -10 Mb RAD: QF-PCR/ FISH Karyotype NST 1% CNV-seq / Microarray CNV 1% BoBs Prenatal 50 400 kb FISH microdeletion, MLPA Đơn gen Đơn gen 1% Panel gen CES (G4500) Nu WES Độ phân giải WGS Target Whole genome Hội chứng Di-George • • • • • • • • • Vi đoạn NST 22q11.2 Chiếm 1/4000 Bất thường tim mạch máu lớn Chẻ vịm hầu Mặt hình hạnh nhân, mũi rộng, tai nhỏ, đầu nhỏ Suy giảm miễn dịch, dể nhiễm trùng Suy tuyến cận giáp Chậm phát triển tâm thần nhẹ đến trung bình 6-28% từ bố mẹ (Digilio,2003) Di-George Syndrome - FISH CES-WES-WGS WES tỷ Nu 20.000 gen Giảm chi phí sequencing Tương quan kiểu gen kiểu hình cao Giảm thời gian phân tích CES 4.000 – 5.000 gen Tiếp cận đa chuyên khoa Tim mạch Hô hấp Da liễu Tai Mũi Họng Mắt CES Thần kinh Thận Chuyển hóa G4500 Miễn Dịch Nội tiết Tiêu hóa – Gan mật Huyết học Ung Thư Những khó khăn phân tích WES • Phân tích trio (bố, mẹ, thai) • Giới hạn mối liên quan phenotype – genotype bất thường siêu âm hình thái • Thơng tin lâm sàng đầy đủ: clinical genetic • Tư vấn sau kết khó khăn Tiếp cận trẻ dị tật, chậm phát triển trí tuệ, vận động, tự kỷ, động kinh, rối loạn chuyển hóa X-fragile CNV-seq CES (G4500) WES Karyotype máu Người mang gen thể ẩn gì? Carrier screening COL7A1:c.6081delC (p.Pro2029Leufs): Dị hợp 4500 genes 4500 genes Ly thượng bì bóng nước (Epidermolysis bullosa) 41 Sàng lọc sơ sinh Lợi điểm sàng lọc sơ sinh gen – Thu mẫu trước xuất viện • Có thể lấy mẫu 24 đầu • Có kết sớm trước có biến chứng – Có thể thực trẻ sinh non, NICU – Thu mẫu máu gót chân • Panel gene thực máu cuống rốn nguồn DNA khác – xét nghiệm thay cho nhiều loại xét nghiệm: • • • • Sinh hóa/miễn dịch Khối phổ Điện di Hb Xét nghiệm đột biến gen xác định Disorder Included on Baby Genes ~3,100 pathogenic markers 71 Conditions 99 Genes Test G4500 cho sàng lọc sơ sinh, sàng lọc trước mang thai Tim mạch Hô hấp Da liễu Tai Mũi Họng Mắt CES Thần kinh Thận Chuyển hóa G4500 Miễn Dịch Nội tiết Tiêu hóa – Gan mật Huyết học Ung Thư Thơng tin mang • Các bất thường di truyền – Bất thường NST (1%) – Bất thường CNV (1%) – Bất thường đơn gen (1%) • Cách tiếp cận làm tăng khả phát bất thường • Karyotype máu cịn vai trị giá thành thấp • Chẩn đốn CNV đầu tay – Chậm phát triển trí tuệ, vận động, tự kỷ, dị tật • Vai trị CES sau sinh, sàng lọc sơ sinh, sàng lọc trước mang thai XIN CHÂN THÀNH CÁM ƠN