Bài giảng Xét nghiệm gen trong sàng lọc và chẩn đoán trước sinh: Giá trị lâm sàng và giới hạn do TS. Nguyễn Hoài Nghĩa biên soạn trình bày các nội dung chính sau: Bất thường di truyền trong sinh sản; Siêu âm có thể phát hiện tất cả các bệnh đơn gen; Phát hiện người mang gen bệnh thể ẩn;...
XÉT NGHIỆM GEN TRONG SÀNG LỌC VÀ CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH: GIÁ TRỊ LÂM SÀNG VÀ GIỚI HẠN TS Nguyễn Hoài Nghĩa (Đại học Y Dược TpHCM – Viện di truyền y học) BẤT THƯỜNG DI TRUYỀN: SÀNG LỌC VÀ CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH Nguyên nhân gây bất thường bẩm sinh (M Verp Genetic counseling and screening Springer-Verlag, 1993) Siêu âm Đột biến gen Bất thường nhiễm sắc thể Sàng lọc tiền khơng xâm lấn NIPT Sinh hóa/ siêu âm Khó khăn: phần lớn thơng tin lâm sàng từ siêu âm khơng đặc thù cho nhóm bệnh Khảo sát nhiều gen lúc hinhanhykhoa.com tỉ nucleotide 20,000 gen (WGS: whole genome sequencing) protein B exon ATTGAATGGCATCCGAT TAGACGTTACCGTACGG TCGAAAATTGGATACGG AGTCCCGTAAAGGCCTA Gen B Gen A protein A CÁC CHIẾN LƯỢC GIẢI TRÌNH TỰ Exome chiếm 1% gen, chứa 85% đột biến gây bệnh 20,000 gen (WES: whole exome sequencing) ATTGAATGGCATCCGAT T GG TCGAAA Đến nay, 4,500 gen biết gây bệnh (OMIM) (CES: clinical exome sequencing = G4500) GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI Giải trình tự Sanger Giải trình tự hệ (Next-generation sequencing = Massive parallel sequencing) đoạn DNA/ phản ứng Hàng triệu đoạn DNA /mỗi phản ứng Chi phí: $2.400/1Mb Chi phí: $0.5/1Mb MiniSeq (50 triệu DNA -7.5 Gb) NextSeq (800 triệu DNA -120 Gb) Thai 14 tuần, nguy sàng lọc sinh hóa: 1/315 Kết NIPT, khơng phát bất thường số lượng NST Thai 20 tuần ngày: siêu âm cho thấy ruột tăng sáng độ II, dãn nhẹ bể thận trái, mặt cắt vùng sọ profile dẹt, ý đột biến xương/sụn Chọc ối Kết chẩn đốn từ dịch ối Kết CNVseq: khơng phát bất thường NST Kết giải trình tự 4,503 gen (G4500): đột biến gen POGZ (HC White-Sutton) GIỚI HẠN CỦA XÉT NGHIỆM GEN: TỈ LỆ CHẨN ĐOÁN Tỉ lệ chẩn đoán 100% 50% G4500-trio 33% 25% G4500 (phát đột biến điểm) CNVseq (phát bất thường số lượng NST) SIÊU ÂM CÓ THỂ PHÁT HIỆN TẤT CẢ CÁC BỆNH ĐƠN GEN? NIPT Sinh hóa/ siêu âm Siêu âm Phần lớn bệnh đơn gen không phát siêu âm ? Đột biến gen Bất thường nhiễm sắc thể GEN BỆNH THỂ ẨN: VÍ DỤ Ly thượng bì bóng nước (bệnh lặn) (Epidermolysis bullosa) Kết giải trình tự 4,503 gen (G4500) COL7A1:c.6081delC (p.Pro2029Leufs): dị hợp Cha mang gen bệnh thể ẩn Mẹ mang gen bệnh thể ẩn Cha mẹ hồn tồn bình thường mang đột biến dị hợp gen COL7A1 GEN BỆNH THỂ ẨN: VÍ DỤ (bệnh lặn) Cha mẹ hồn tồn bình thường mang đột biến dị hợp gen IGHMBP2 hinhanhykhoa.com PHÁT HIỆN NGƯỜI MANG GEN BỆNH THỂ ẨN Xác định nguy di truyền gen bệnh từ cha mẹ cho 80% trẻ bị bệnh đơn gen sinh từ cha mẹ hồn tồn bình thường Hiệp hội sản phụ khoa Hoa Kì (ACOG): thơng tin sàng lọc gen bệnh thể ẩn nên cung cấp cho tất thai phụ để lựa chọn Phát cha mẹ mang gen bệnh thể ẩn Siêu âm Bất Đột biến thường gen NST NIPT Sinh hóa/ siêu âm LỰA CHỌN BỆNH CHO XÉT NGHIỆM GEN THỂ ẨN Gene GJB2 Tần suất người mang gen bệnh thể ẩn 1/5 Thiếu máu tán huyết alpha HBA1 HBA2 1/20 Thiếu máu tán huyết beta Bệnh Wilson HBB ATP7B 1/87 1/32 Ly thượng bì bóng nước COL7A1 LAMB3 1/262 Bệnh xơ nang CTFR 1/277 Tăng galactose máu GALT 1/208 Phenylketon niệu PAH 1/68 10 Rối loạn dự trữ glycogen (Pompe) GAA 1/63 11 Thiếu máu Fanconi nhóm A FANCA 1/182-1/330 12 Bệnh thận đa nang thể lặn PKHD1 1/119 Bệnh (*) STT Điếc bẩm sinh Nếu xét nghiệm Thalassemia: bỏ sót người mang gen bệnh thể ẩn Nếu xét nghiệm nhiều bệnh: gây lo lắng Hiệp hội di truyền Hoa Kì (ACMG): bệnh có tần suất thể mang >1/100 bệnh nặng hinhanhykhoa.com TƯ VẤN DI TRUYỀN - PGS.TS.BS Đỗ Thị Thanh Thủy (ĐHYD TpHCM, Viện di truyền y học) - TS.BS Nguyễn Thị Quỳnh Thơ (Viện di truyền y học) - BS Nguyễn Vạn Thông (BV Hùng Vương) - TS Đỗ Ngọc Hân (Viện di truyền y học) - TS Giang Hoa (Viện di truyền y học) - BS Nguyên Hữu Nguyên (Viện di truyền y học) - BS Đỗ Phước Huy (Viện di truyền y học) - BS Nguyễn Trần Thanh Thảo (Viện di truyền y học) - TS Nguyễn Hoài Nghĩa (ĐHYD TpHCM) Tư vấn kết = Bác sĩ + chuyên gia di truyền CHÂN THÀNH CẢM ƠN! hinhanhykhoa.com ... Kết chẩn đoán từ dịch ối Kết CNVseq: không phát bất thường NST Kết giải trình tự 4,503 gen (G4500): đột biến gen POGZ (HC White-Sutton) GIỚI HẠN CỦA XÉT NGHIỆM GEN: TỈ LỆ CHẨN ĐỐN Tỉ lệ chẩn. .. TRUYỀN: SÀNG LỌC VÀ CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH Nguyên nhân gây bất thường bẩm sinh (M Verp Genetic counseling and screening Springer-Verlag, 1993) Siêu âm Đột biến gen Bất thường nhiễm sắc thể Sàng lọc. .. truyền y học) - TS.BS Nguyễn Thị Quỳnh Thơ (Viện di truyền y học) - BS Nguyễn Vạn Thông (BV Hùng Vương) - TS Đỗ Ngọc Hân (Viện di truyền y học) - TS Giang Hoa (Viện di truyền y học) - BS Nguyên