TIỂU LUẬN identifying miRNA, targets and functions

Identiíýing miRNA, targets and íunctions Thành viên Lê Văn Hiếu Trung Trương Văn Nam Nguyễn Văn Thắng Giới thiệu Nhiều thập kỷ trơi qua, y học giới có nỗ lực không ngừng đạt nhiều thành tựu vượt bậc chiến chống lại bệnh hiểm nghèo ung thư, bệnh truyền nhiễm, tim mạch Tuy nhiên, ung thư mối đe doạ gây tử vong hàng đầu việc chẩn đoán điều trị chưa kịp thời hữu hiệu Việc phát phân tử microRNA chức chúng điều hoà biểu gen khám phá bật ngành di truyền học năm qua • Khái niệm miRNA Acid ribonucleic (ARN hay RNA) - Là phân tử polyme có nhiều vai trị sinh học mã hóa, dịch mã, điều hòa biểu gene - RNA DNA acid nucleic, với lipid, protein cacbohydrat, tạo thành bốn loại đại phân tử sở cho dạng sống Trái Đất MicroRNA - Là phân tử RNA khơng mã hố, độ dài khoảng 18-25 nucleotides (nts) có vai trị quan trọng việc điều hoà biểu gen sau phiên mã DN A mRN A Protei n Chức T^ĩ’ Ấ *Ẳ • /V /\ Á 1 «Ă 4-r 11 r 1J Á F F • ' - Ức chê biêu nhiều gen đích băng cách tương tác với vùng không dịch mã (3’-UTR) RNA thông tin (mRNA) tương ứng miARN thực chức băng cách bắt cặp bổ sung với trình tự bên mARN làm câm gen đặc hiệu mARN thông qua ba cách sau: • Phân cắt mạch mARN thành phần • Làm ngắn poly A mARN, gây tính bền vững mARN • Giảm hiệu dịch mã mARN thành protein miARN đóng vai trị quan trọng hầu hêt q trình sinh lý, sai sót điều hịa băng miARN dẫn đên nhiều bệnh ung thư, hội chứng trao đổi chất rối loạn thối hóa thần kinh Kê từ Victor Ambros phát miR giun, lin-4 vào năm 1993 , đên có 20.000 miR xác định động vật, thực vật virus, '■ 2.000 miR người có thê điều hồ đên 60% tồn hệ gen người MicroRNA ung thư - Ung thư chiếm 34% tổng số bệnh liên quan đến rối loạn biểu miR người - Các bệnh miễn dịch nhiễm trùng (15%), tim mạch (7%) loại bệnh khác Thành tựu bật •• - Làm đích sinh học nghiên cứu ung thư: thử nghiệm lâm sàng MRX34 bệnh nhân ung thư gan Vấn đề đặt - Trường hợp khơng có phương pháp tiếp cận sinh học thông lượng cao để xác định mục tiêu miRNA - Một số phương pháp tính tốn: • miRanda • mirSVR • PicTar • RNA22 •• Dự đoán mục tiêu miRNA •• - Thuật tốn: RNA22 - Lồi: - Mô tả ngắn gọn phương pháp dự đoán: sử dụng mẫu phát từ miRNA trưởng thành biết để dự đốn vị trí mục tiêu miRNA theo trình tự - Tool: RNA22 visualization tool SGIECĨ SpGCĨCSu í Mus Musculus Selecttypeottargeted RNA: ímRNA v) Select m i RN A and ta rget RN A d ata ba ses: í m ÌR Base 13 {Nov 2O11},ENSEMBLÓ5 {Dec 2011} a nd RNA22 V2Ữ Subm.Lt Chnic&5 Reset Mus Musculus, mRNA, miRBase 18 (Nov 2011), ENSEMBL 65 (Dec 2011) and RNA22v2.0 Top 500 accessed transcripts TI P! lí you plan on workl ng vvitli those options otten, yoư can bookmarkthis url Tlìis way you won't have to select the sa me options again i n the fưtu re What: Retrievelist ottranscrĩpts thatrna22 predlctsaretargeted bythe prmrided nniRNA ỉdentifier(s) Filten Predictions wlll behltered s uslngthese Ẹiltering Options Enter: mỉRNA tdentìfĩer(s)(e.& mrĩiu-miR-3057-3p mmu-miR-3O58-5p mmii-miR-3058-3pmmu-mĩR-3057-5p) 5ubmìt help What: Retrieve and View all of predictìons torthe provìded ENSEMBLgene id Enter: ENSEMBL Gene/ơení/fier(e.&ENSMUSG00000000093) I submìt help What: Retrieve and View all of predíctìons torthe provìcled ENSEMBLtranscript id Options: View Predìctiữns as ©cDNAmap OTable Enter: ENSEMBL Transcript identifjer(e^ ENSMUSTỮ0000000896) I 5ubmitJ help Briefly elaborate on what you want to discuss Add a main point Add a main point Briefly elaborate on what you want to discuss Briefly elaborate on what you want to discuss Write your topic or idea Write a COLUMN NAME Double click to add text Write a COLUMN NAME Write a COLUMN NAME Write a COLUMN NAME Write a COLUMN NAME Write your topic or idea Add a main point Brieíly elaborate on what you want to discuss Add a main point Brieíly elaborate on what you want to discuss Write your topic or idea Item 20% Briefly elaborate on what you want to discuss 20% Write your Briefly elaborate on what you want to discuss topic or idea Insert a parting or call-to-action message here Use these design resources in your Canva Presentation Happy designing! Resource Page Don't forget to delete this page before presenting Resource Page Use these design resources in your Canva Presentation Happy designing! Don't forget to delete this page before presenting Resource Page Find the magic and fun in presenting with Canva Presentations Press the following keys while on Present mode! B for blur C for confetti D for a drumroll O for bubbles Q for quiet X to close Don't forget to delete this page before presenting Any number from 0-9 for a timer ... RN A and ta rget RN A d ata ba ses: í m ÌR Base 13 {Nov 2O11},ENSEMBLÓ5 {Dec 2011} a nd RNA22 V2Ữ Subm.Lt Chnic&5 Reset Mus Musculus, mRNA, miRBase 18 (Nov 2011), ENSEMBL 65 (Dec 2011) and RNA22v2.0... 5ubmìt help What: Retrieve and View all of predictìons torthe provìded ENSEMBLgene id Enter: ENSEMBL Gene/ơení/fier(e.&ENSMUSG00000000093) I submìt help What: Retrieve and View all of predíctìons... tiếp cận sinh học thông lượng cao để xác định mục tiêu miRNA - Một số phương pháp tính tốn: • miRanda • mirSVR • PicTar • RNA22 •• Dự đốn mục tiêu miRNA •• - Thuật tốn: RNA22 - Lồi: - Mô tả ngắn