Axítamin
Cấu trúc chung của một phân tử axít amin, với
nhóm amin ở bên trái và nhóm axít cacbonxylic
ở bên phải. Nhóm R tùy vào từng axítamin cụ
thể.
Trong hóa học, một amino acid hay axítamin
là một phân tử chứa cả nhóm amin và axít
cacboxylic. Trong hóa sinh, thuật ngữ này còn
để chỉ alpha amino acids: những axítamin mà
trong đó nhóm amin và cacbonxylic gắn vào
cùng một carbon, nên gọi là α–carbon.
Phần dư còn lại của một axítamin là phần mà
sau khi đã loại bỏ phân tử nước (một H
+
ra khỏi
nitơ và một OH
-
khỏi cacbon) và tạo thành liên
kết peptít.
Mục lục
1 Tổng quan
2 Cấu trúc tổng quát
o 2.1 Các dạng đồng phân
3 Liên kết ngoài
Tổng quan
Amino acid là đơn vị cấu trúc cơ bản của
protein. Chúng tạo thành các xích polymer ngắn
gọi là peptide hay polypeptides để rồi tạo thành
cấu trúc gọi là protein. Quá trình tạo thành từ
mRNA làm mẫu gọi là dịch mã, là một phần của
tổng hợp protein.
Phenylalanine là một trong amino acid chuẩn.
Có 20 loại amino acids được mã hóa bởi mã di
truyền chuẩn và được gọi là proteinogenic hay
amino acids chuẩn. Việc kết hợp các amino
acid này tạo ra protein thiết yếu cho việc cấu
thành cơ thể người. Có ít nhất hai loại khác
được mã hóa bởi DNA theo một cách khác
(không chuẩn):
Selenocysteine kết hợp với một vài protein ở
UGA codon, thường gọi là stop codon.
Pyrrolysine được sử dụng bởi một vài
methanogen trong các enzyme mà được
dùng để sản xuất ra methane. Nó được mã
hóa giống với của selenocysteine nhưng mà
bằng codon UAG.
Các loại amino acid khác chứa trong proteins
thường được tạo thành bởi bằng cách chỉnh sửa
sau khi dịch mã. Việc chỉnh sửa này thường rất
cần thiết cho chức năng của protein.
Trong Proline chỉ có proteinogenic amino acid
là có các nhóm cyclizes nằm trên khung xương:
nó liên kết với nhóm α-amino, vì thế cũng chỉ
có proteinogenic amino acid là có chứa amin
thứ cấp ở vị trí này. Đôi khi Proline còn được
gọi là imino acid, nhưng mà acid này không
tuân theo các quy tắc nomenclature.
Có hơn 100 amino acid đã được tìm thấy trong
tự nhiên. Một trong số chúng đã được tìm thấy
trong các meteorite, đăc biệt trong các dạng
được biết nhiều như carbonaceous chondrite. Vi
sinh vật và thực vật có thể sản xuất ra các amino
acid bất thường mà thường được tìm thấy trong
các peptid kháng thể (ví dụ như nisin hoặc
alamethicin). Lanthionine là một alanine dimer
có cầu nối sulfide, thường được tìm thấy chung
với các unsaturated amino acid trong lantibiotics
(là cac peptide kháng thể của microbial origin).
1-Aminocyclopropane-1-carboxylic acid (ACC)
là một disubstituted cyclic amino acid nhỏ và là
một chất trung gian quan trọng trong việc tạo ra
các hormone ethylene thực vật.
Ngoài việc tổng hợp protein, các amino acid còn
có các vai trò sinh học quan trọng khác. Glycine
và glutamate là các neurotransmitter cũng như
cac amino acids chuẩn mực khác trong các
protein. Nhiều amino acid được dùng để tổng
hợp các phân tử khác, ví dụ như:
tryptophan là tiền chất của chất truyền thần
kinh serotonin
glycine là một trong số các chất phản ứng
trong quá trìng tổng hợp porphyrins như
làheme
arginine được dùng để tổng hợp hormone
nitric oxide
Phần lớn các amino acids không chuẩn mực
cũng có một số chức năng sinh học quan trọng:
Gamma-aminobutyric acid là một chất truyền
thần kinh khác nữa, carnitine được sử dụng
trong việc chuyển lipid vào bên trong cell,
ornithine, citrulline, homocysteine,
hydroxyproline, hydroxylysine, and sarcosine.
Một vài trong số 20 amino acids tiêu chuẩn
được gọi là các amino acid thiết yếu do chúng
không thể được tổng hợp bởi body từ các
compounds khác thông qua các phản ứng hóa
học, mà được gắn trong gỗ. Ở người, các amino
acid thiết yếu là lysine, leucine, isoleucine,
methionine, phenylalanine, threonine,
tryptophan, valine. Histidine và arginine nói
chung được xem như là cần thiết ở trẻ con, do ở
cơ thể trẻ con không có khả năng tổng hợp ra
chúng.
Cụm từ "branched-chain amino acids (các
amino acid trục phân nhánh)" đôi khi được dùng
để nói tới các aliphatic amino acid: leucine,
isoleucine and valine.
Cấu trúc tổng quát
Cấu trúc tổng quát của proteinogenic alpha
amino acids:
R
|
H
2
N-C-COOH
|
H
Trong đó R là trục đặc biệt quan trọng đối với
mỗi amino acid. Các amino acid thường được
phân loại dựa theo đặc tính hóa học của trục (R)
thành 4 nhóm. The side chain can make them
behave like a weak acid, a weak base, a
hydrophile, if they are polar, and hydrophobe if
they are nonpolar.
Các dạng đồng phân
Hầu hết các amino acid đều có 2 dạng đồng
phân lập thể đồng phân lập thể, là D và L. Dạng
L gồm những amino acid có vai trò quan trọng
có trong các protein. Còn dạng D chỉ gồm một
số amino acid trong các protein có trong các
sinh vật sống dưới nước, ví dụ ốc hình nón.
Chúng cũng có nhiều các thành phần vách tế
bào proteoglycan của bacteria. Đồng phân dạng
D của aspartic acid có trong một số protein là
kết quả của quá trình biến đổi sau dịch mã tự
phát kết hợp với sự hóa già protein hoặc giống
như là sản phẩm phụ của quá trình biến đổi
enzyme được xúc tác bởi protein L-isoaspartyl
methyltransferase.
. Axít amin
Cấu trúc chung của một phân tử axít amin, với
nhóm amin ở bên trái và nhóm axít cacbonxylic
ở bên phải. Nhóm R tùy vào từng axít amin. một amino acid hay axít amin
là một phân tử chứa cả nhóm amin và axít
cacboxylic. Trong hóa sinh, thuật ngữ này còn
để chỉ alpha amino acids: những axít