PCR sequencing

pcr sequencing protocols

pcr sequencing protocols

... Purification of PCR Products from Agarose Gels for Direct Sequencing Frank C Brosius III, Lawrence B Holzman, and Xinan Cao Introduction The advent of direct sequencing of polymerase chain reaction (PCR) ... (e.g., 1-4) Many of these protocols are described in detail in this volume An unrelated, but equally frustrating obstacleto the sequencing of PCR products ariseswhen multiple...

Ngày tải lên: 11/04/2014, 10:02

218 306 0
Báo cáo khoa học: " Identification and prevalence of Ehrlichia chaffeensis infection in Haemaphysalis longicornis ticks from Korea by PCR, sequencing and phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene" docx

Báo cáo khoa học: " Identification and prevalence of Ehrlichia chaffeensis infection in Haemaphysalis longicornis ticks from Korea by PCR, sequencing and phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene" docx

... predominant species of tick and often found in association with humans and animals in Korea [18] The prevalence of E chaffeensis infection in 4.3% ticks observed in this study indicate that H longicornis ... study showing the genetic analysis of E chaffenesis in H longicornis ticks collected in Korea Our findings suggests that E chaffeensis may be w...

Ngày tải lên: 07/08/2014, 18:21

5 353 0
Analysis, sequencing and in vitro expression of PCR products

Analysis, sequencing and in vitro expression of PCR products

... numbers of samples are involved (Section 5.4) Analysis, sequencing and in vitro expression of PCR products 93 5.4 Direct DNA sequencing of PCR products Once a PCR product has been cloned into a ... primer in excess continues to allow linear accumulation of one strand of DNA suitable for subsequent DNA sequencing Analysis, sequencing and in vitro...

Ngày tải lên: 25/10/2013, 22:20

24 494 0
Báo cáo sinh học: " A general method for nested RT-PCR amplification and sequencing the complete HCV genotype 1 open reading frame" potx

Báo cáo sinh học: " A general method for nested RT-PCR amplification and sequencing the complete HCV genotype 1 open reading frame" potx

... amplicon Table (see additional file 1: HCVMethodPaperTable1.xls) and Table (see additional file 2: HCVMethodPaperTable2.xls) list amplification and sequencing primers for genotypes 1a and 1b Table ... in the same set Primer "A1 L3. 2" is a sequencing primer for genotype 1a, amplicon 1, of sense polarity, "3 " indicates it is the third sequencing primer fo...

Ngày tải lên: 19/06/2014, 08:20

9 445 0
báo cáo hóa học:" A general method for nested RT-PCR amplification and sequencing the complete HCV genotype 1 open reading frame" pdf

báo cáo hóa học:" A general method for nested RT-PCR amplification and sequencing the complete HCV genotype 1 open reading frame" pdf

... amplicon Table (see additional file 1: HCVMethodPaperTable1.xls) and Table (see additional file 2: HCVMethodPaperTable2.xls) list amplification and sequencing primers for genotypes 1a and 1b Table ... 7: Amplification efficiency for patients' amplicons Genotype 1a Amplicon Amplification efficiency Average efficiency A1 9 5a A2 A3 98 93 96.2 A4 x 10 0 A4 y 95 A2...

Ngày tải lên: 20/06/2014, 04:20

9 442 0
Báo cáo y học: "Analysis of bacterial DNA in synovial tissue of Tunisian patients with reactive and undifferentiated arthritis by broad-range PCR, cloning and sequencing" pps

Báo cáo y học: "Analysis of bacterial DNA in synovial tissue of Tunisian patients with reactive and undifferentiated arthritis by broad-range PCR, cloning and sequencing" pps

... using broad-range PCR and/ or reverse transcription PCR systems to search for bacterial DNA and RNA in synovial samples from patients with various forms of arthritis, including ReA [12,14,17] By ... bacterial DNA in synovial samples We extracted DNA from ST samples from 28 patients with arthritis We found bacterial DNA in 21 (75%) of these patien...

Ngày tải lên: 09/08/2014, 10:23

14 501 0
Báo cáo y học: "Broad-range PCR, cloning and sequencing of the full 16S rRNA gene for detection of bacterial DNA in synovial fluid samples of Tunisian" pps

Báo cáo y học: "Broad-range PCR, cloning and sequencing of the full 16S rRNA gene for detection of bacterial DNA in synovial fluid samples of Tunisian" pps

... PCR positivity by the broad-range PCR amplification system PCR was positive in 20 of the 27 (74.10%) patients indicating the presence of bacterial 16S rDNA within the synovial samples Of note, PCR ... between the presence of a particular bacterial DNA and clinical symptoms Discussion In the present study we used broad-range PCR amplification, cloning, a...

Ngày tải lên: 09/08/2014, 14:22

11 462 0
Báo cáo y học: "Analyzing and minimizing PCR amplification bias in Illumina sequencing libraries" pps

Báo cáo y học: "Analyzing and minimizing PCR amplification bias in Illumina sequencing libraries" pps

... PCR enzymes and chemical ingredients in amplification reactions Finally, we validated the qPCR results by Illumina sequencing Our optimized protocol amplifies sequencing libraries more evenly ... during library preparation does not necessarily yield unbiased Illumina sequencing reads, presumably due to bias introduced further downstream in the sequencing process Discus...

Ngày tải lên: 09/08/2014, 22:23

14 346 0
Báo cáo y học: " Comparative evaluation of INNO-LiPA HBV assay, direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP for genotyping of clinical HBV isolates" pot

Báo cáo y học: " Comparative evaluation of INNO-LiPA HBV assay, direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP for genotyping of clinical HBV isolates" pot

... Ali et al., Comparative evaluation of INNO-LiPA HBV assay, direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP for genotyping of clinical HBV isolates Virology Journal 2010, 7:111 Page of ... Genotype A in all 13 mixed Genotype A and D strains of HBV On the other hand, despite being costly or technically demanding, LiPA and direct DNA sequencing yi...

Ngày tải lên: 12/08/2014, 04:20

5 370 0
Kỹ thuật PCR:

Kỹ thuật PCR:

... Dùng kỹ thuật PCR cho ribotyping: Kỹ thuật PCR ribotyping ứng dụng cặp mồi đặc hiệu để nhân vùng gene ARN (thuộc ribosom hay ARN vận chuyển) Tuy nhiên, thực tế kỹ thuật yêu cầu kinh nghiệm, kỹ thuật ... dịch khung xảy với số lượng tương ứng khoảng 40 000 nucleotid + Một số kỹ thuật PCR khác: Một số kỹ thuật phát triển sở kỹ thuật PCR có ý nghĩa quan trọng cho định...

Ngày tải lên: 18/08/2012, 23:37

25 1,8K 18
Kỹ thuật PCR

Kỹ thuật PCR

... nucleotid + Một số kỹ thuật PCR khác: Một số kỹ thuật phát triển sở kỹ thuật PCR có ý nghĩa quan trọng cho định danh định typ vi sinh vật nested PCR (PCR lồng), revert transtriptase PCR (sao chép ... Dùng kỹ thuật PCR cho ribotyping: Kỹ thuật PCR ribotyping ứng dụng cặp mồi đặc hiệu để nhân vùng gene ARN (thuộc ribosom hay ARN vận chuyển) Tuy nhiên, thực tế k...

Ngày tải lên: 15/09/2012, 15:49

25 1,6K 6
 Luận văn :Định lượng kháng nguyên Cyfra 21-1 bằng kỹ thuật Real-time PCR

Luận văn :Định lượng kháng nguyên Cyfra 21-1 bằng kỹ thuật Real-time PCR

... xây dựng phương pháp định lượng kháng nguyên kỹ thuật - Real-time PCR kỹ thuật phage display - Đã ứng dụng kỹ thuật định lượng kháng nguyên để xác định nồng độ Cyfra2 1-1 số mẫu huyết nhận từ ... dòng lực với kháng nguyên Cyfra 21-1 giếng Do đó, giá trị OD có ý nghĩa xác định bán định lượng nồng độ kháng nguyên Cyfra 21-1 Như vậy, giếng khay ELIS...

Ngày tải lên: 29/10/2012, 13:26

47 841 1
Phương pháp PCR

Phương pháp PCR

... tốc độ nhanh chưa thấy độ xác cao thực máy chu kỳ nhiệt (máy PCR) Kỹ thuật PCR Karry Mullis phát minh 1985 Các yêu cầu cần thiết cho PCR mồi (primer) tổng hợp oligonucleotide ( mồi có khong ... nhiều loài sinh vật tồn cách hàng chục triệu nm PCR for Cloning PCR for Medical Diagnostics Diagnosis of Sickle-Cell Anemia (hồng cầu liềm) by PCR ... PCR Khuụn ADN c bin i thnh si n (94 0...

Ngày tải lên: 29/10/2012, 14:02

18 643 7
Ứng dụng kỹ thuật PCR - RFLP xác định các kiểu gen thụ thể prolactin trên giống heo Yorkshire

Ứng dụng kỹ thuật PCR - RFLP xác định các kiểu gen thụ thể prolactin trên giống heo Yorkshire

... tăng khối lƣợng ngày cá thể heo có diện gen thụ thể prolactin cao cá thể diện gen Các nghiên cứu gen thụ thể prolactin dừng lại mức xác định mối tƣơng quan diện gen thụ thể prolactin với tăng suất ... gen thụ thể prolactin Cả ba kiểu gen thụ thể prolactin xuất giống Yorkshire Tần số kiểu gen BB chiếm tỉ lệ cao (50 %), kiểu gen...

Ngày tải lên: 29/10/2012, 14:13

52 1,4K 3
w