Protein đệm M là một trong các hợp phần chính cấu tạo của hạt virus cúm A/H5N1, gồm 2 loại: protein nền M1 và protein nội màng M2, được tạo ra bởi 2 khung đọc mở khác nhau của cùng 1 phân đoạn RNA.
- Protein nền M1
Là thành phần chính của virus, phân tử lượng tính toán của M1 là 28x103 Da
(quan sát thực tế: 25x103) có chức năng bao bọc RNA tạo nên phức hợp RNP và
tham gia vào quá trình “nảy chồi” của virus. Với 3000 phân tử/virion, các protein nền này sẽ lót phần bên trong màng bao lipid của virion [11], [45], [49].
- Protein nội màng – kênh ion M2
Protein M2 là chuỗi polypeptide bé, có khối lượng phân tử theo tính toán là 11x103 Da (trên thực tế là 15x103 Da).
Với khoảng 20 – 60 phân tử/virion, tham gia vào cấu tạo vỏ capsit của virus (protein nội màng) cùng với các phân tử HA và NA. Protein M2 là protein nội màng - kênh ion (ion channel) điều chỉnh độ pH trong virion (Hình 1.10) cần thiết cho khả năng lây nhiễm của virus, chịu trách nhiệm “cởi áo” virus trình diện hệ gen ở bào tương tế bào chủ trong quá trình xâm nhiễm trên vật chủ [54].
Bên cạnh đó, protein M2 còn tham gia quá trình gắn các protein HA và NA của virus lên màng tế bào nhiễm, thông qua điều chỉnh pH bộ máy Golgi, đích của các thuốc ức chế virus: amantadin và rimantadin [49], [54].
Protein M2 liên quan đến sự thích ứng của virus trên vật chủ mới cũng như sự lây truyền giữa các loài. Hai đột biến thay thế amino acid leucin thành isoleucin ở vị trí 26 và serin thành asparagin tại vị trí 31, Leu26Ile và Ser31Asn, trong chuỗi polypeptide M 2, liên quan đến sự kháng thuốc Amantadine , đã được phát hiện ở virus A/H5N1 [40].
Hình 1.10. Sự thay đổi pH nhờ protein kênh ion M2 trong quá trình “cởi áo” của