Thí nghiệm xác định độc lực của vi khuẩn và định danh chủng vi khuẩn

Một phần của tài liệu Xác định các tác nhân gây bệnh trên cá cảnh biển tại thủy cung Vinpearl, bước đầu thử nghiệm khả năng kháng khuẩn của một số thực vật trên tác nhân gây bệnh cho cá (Trang 33)

đích gây bệnh

Các chủng vi khuẩn được chọn ngẫu nhiên trong các nhĩm vi khuẩn phân lập được từ cá cảnh biển bệnh với nhiều hình thái trên mơi trường TCBS, đặc điểm sinh lý và sinh hĩa khác nhau. Các chủng vi khuẩn được chọn sẽ đem nuơi tăng sinh trên mơi trường thạch nghiêng NA (cĩ bổ sung 3% NaCl) trong 24 ± 2h ở 28O

C. Trước khi tiêm cảm nhiễm, chuẩn bị dịch huyền phù vi khuẩn bằng cách dùng que cấy lấy khuẩn lạc cho vào dung dịch 1% NaCl đã tiệt trùng để pha lỗng dịch vi khuẩn sao cho độ đục đạt mức McF là 0,5 (được đo bằng máy Densimat – Bio Mérieux, Pháp) sẽ tương đương khoảng 2,5×108 CFU/ml (đã được kiểm chứng tổng số vi khuẩn bằng phương pháp đếm đĩa).

Thí nghiệm cảm nhiễm được thực hiện tại phịng thí nghiệm Vi sinh, Viện CNSH&MT, trường Đại học Nha Trang trong hệ thống 4 bể kính cĩ thể tích 10 lít. Trước khi cảm nhiễm, nước biển sau khi lấy về trong các thùng lớn 60 lít sẽ được khử trùng bằng Chlorine (nồng độ 30ppm), đồng thời các bể nuơi cũng phải được khử trùng bằng Chlorine và rửa lại bằng nước sạch. Sau đĩ cho nước vào bể khoảng 8 lít/bể, lắp hệ thống sục khí liên tục trong 3 ngày để loại bỏ hết Chlorine cịn sĩt lại (vì dư lượng của Chlorine cĩ thể gây độc cho cá nên sau khi đã kiểm tra với bộ kit Cl chuyên dụng, nếu nhận thấy Chlorine vẫn cịn tồn tại trong nước thì cần trung hịa với Natri thiosulfate).

Cá được chọn tiến hành cảm nhiễm vi khuẩn là cá Khoang cổ đỏ (Tomato clownfish - Amphiprion frenatus) (Hình 2.3) cĩ trọng lượng khoảng 1,2 – 1,4g/con, khỏe mạnh được nuơi tại Viện Hải dương học Nha Trang. Cá cĩ màu sắc tươi sáng, phản ứng linh hoạt và khơng cĩ các tổn thương bên ngồi. Cá được bố trí và chia ngẫu nhiên 20 con/bể và để cá thích nghi khoảng 5 ngày cho quen dần với mơi trường nước thí nghiệm. Các nghiệm thức gồm: (1) lơ đối chứng, tiêm dung dịch 1% NaCl vơ trùng; (2 - 5) tiêm vi khuẩn ở nồng độ pha lỗng khác nhau. Mỗi nghiệm thức được lặp lại 2 lần. Lưu ý, trước khi gây cảm nhiễm, lấy ngẫu nhiên 4 con cá từ 4 bể để kiểm tra ký sinh trùng và phân lập vi khuẩn từ khoang bụng để xác định cá hồn tồn khơng bị nhiễm bất cứ tác nhân nào trước cảm nhiễm.

Tiến hành tiêm vào khoang bụng của mỗi con cá 0,05ml dung dịch huyền phù vi khuẩn (Hình 2.3) với các nồng độ pha lỗng khác nhau từ 2.5x108 đến 106 CFU/ml. Theo dõi liên tục biểu hiện của cá trong khoảng 10 ngày; trong quá trình nuơi, nước trong bể được thay 20% mỗi ngày bằng nước biển đã xử lý và được kiểm tra lại các thơng số như: nhiệt độ, pH, NO2-, NH3/NH4+ nhằm đảm bảo khơng ảnh hưởng đến sức sống của cá. Những con cá cĩ dấu hiệu lờ đờ hoặc vừa mới chết trong khoảng 1 - 2h sẽ được thu nhận và tái kiểm tra hình thái khuẩn lạc vi khuẩn trên TCBS. Sau đĩ, xác định giá trị LD50 dựa trên tỷ lệ cá chếttheo phương pháp của Wardlaw (1985).

Sau khi xác định được chủng vi khuẩn đích gây bệnh, tính nhạy cảm với O129 (2,4-diamino-6,7-di-isopropyl-pteridine phosphate) và hoạt tính hemolysis (làm tan máu) trên mơi trường NA bổ sung 5% máu cừu, ủ ở 24 ± 2h, 28oC của vi khuẩn sẽ được xác định.

Thơng qua các đặc tính sinh lý, sinh hĩa đã xác định ở bước sàng lọc sơ bộ; kết hợp với sử dụng Kit API-20E (Bio Mérieux, Pháp) (Phụ lục 1) để định danh vi khuẩn mục tiêu bằng phần mềm của kit API-20E (theo hướng dẫn của nhà sản xuất) và phần mềm ABIS trực tuyến (http://www.tgw1916.net/bacteria_logare.html).

Hình 2.3. Cá Khoang cổ đỏ (trái) và thao tác tiêm vi khuẩn vào cá (phải) 2.4.4 Lập kháng sinh đồ

Phương pháp lập kháng sinh đồ được xác định theo phương pháp của Huys (2002). Vi khuẩn được phục hồi trên mơi trường NA (cĩ bổ sung 3% NaCl) ở 28OC trong 24 ± 2h; đồng thời được kiểm tra tính thuần bằng cách quan sát sự đồng nhất về hình thái khuẩn lạc và màu sắc trên mơi trường TCBS.

Các khuẩn lạc sau khi nuơi cấy và kiểm tra sẽ được pha thành dịch huyền phù với chỉ số McF là 0,5. Dùng tăm bơng vơ trùng nhúng vào dịch vi khuẩn, cấy trang đều lên bề mặt của đĩa thạch MHA (Himedia, Ấn Độ) với bề dày thạch theo tiêu chuẩn 20 ± 1mm, lặp lại thao tác từ 2 - 3 lần. Sau 15 phút, 8 khoanh giấy được tẩm trước với 8 loại kháng sinh lần lượt là Tetracycline (TE/30µg), Chloramphenicol (C/30µg), Amoxicilin (AMC/25µg), Cefadroxil (CD/30µg), Doxycyclin (D/30µg), Rifampicin (RA/5µg), Cefalexin (CL/30µg) và Cefixime (CFM/5µg) cùng khoanh giấy tẩm dung dịch 1% NaCl (đối chứng) được đặt lên mặt thạch đã được cấy dịch vi khuẩn sao cho phải tiếp xúc hồn tồn với mặt thạch và đem ủ ở 28O

C trong 24h ± 2h. Mỗi chủng vi khuẩn được lặp lại thí nghiệm 3 lần. Dịng vi khuẩn E. coli ATCC 25922 được sử dụng làm chủng tham chiếu.

Đường kính vịng vơ khuẩn bao gồm đường kính của khoanh giấy kháng sinh được đo bằng thước với đơn vị là mm. Dựa vào chuẩn đường kính vịng vơ khuẩn theo tiêu chuẩn của The Clinical and Laboratory Standards Institute (2007)

(CLSI - Tiêu chuẩn cơ sở lâm sàng và phịng thí nghiệm) để xác định dịng vi khuẩn mục tiêu kháng, nhạy hay trung gian với kháng sinh thử nghiệm (Phụ lục 2).

2.4.5 Thử nghiệm khả năng kháng khuẩn của thực vật 2.4.5.1 Chiết xuất dịch chiết thơ từ thực vật 2.4.5.1 Chiết xuất dịch chiết thơ từ thực vật

Đối với các loại thực vật: trầu khơng, trà xanh, ổi, trứng cá, cộng sản (cỏ lào), bạc hà, lơ hội, húng quế và diếp cá sử dụng bộ phận lá nên sẽ chọn những lá bánh tẻ, tươi, khơng cĩ dấu hiệu bệnh. Sau đĩ rửa sạch, để ráo nước tự nhiên ở nhiệt độ phịng, xay thật nhuyễn bằng máy xay, vắt lấy dịch ép và ly tâm ở 7.000 vịng trong 5 phút. Dịch nổi thu được được bảo quản nơi thống mát ở nhiệt độ phịng trước khi tiến hành thí nghiệm khơng quá 60 phút.

Đối với tỏi, nghệ vàng, nghệ xanh và nghệ đen sử dụng bộ phận củ nên sẽ chọn những củ chắc và đều. Bỏ vỏ, rửa sạch để ráo nước tự nhiên ở nhiệt độ phịng. Tương tự với cách xử lý các loại lá trên, củ cũng được đem xay nhuyễn, vắt lấy dịch ép và ly tâm để thu dịch ép thơ.

2.4.5.2 Thử nghiệm khả năng kháng khuẩn

Tiến hành thử nghiệm dịch chiết thực vật trên vi khuẩn phân lập được theo phương pháp thạch lỗ của Bộ mơn Dược liệu – Trường Đại học Dược Hà Nơi, 1998. Dùng tăm bơng vơ trùng nhúng vào dịch huyền phù vi khuẩn đã chuẩn bị trước với chỉ số McF 0,5 cấy trang đều trên bề mặt thạch MHA (với bề dày thạch 20 ± 1mm) đã được đục 5 lỗ với đường kính 5mm/lỗ trước đĩ, để khơ tự nhiên. Sau khoảng 2 phút, nhỏ vào mỗi lỗ tương ứng với tên thực vật đã đánh dấu khoảng 40µl dịch chiết thơ thực vật. Với lỗ trung tâm nhỏ vào nước muối sinh lý vơ trùng để làm đối chứng. Đem ủ trong tủ ấm ở 37O

C với chủng E.coli ATCC 25922 và 28OC với các chủng vi khuẩn phân lập từ mẫu bệnh phẩm cá cảnh biển tại Vinpearl, đồng thời với 2 chủng Vibrio TNX-X1 và YR-X2 gây bệnh trên cá ngựa (được phân lập xác định độc tính tại phịng thí nghiệm CNSH – Viện CNSH&MT). Xác định đường kính vịng trịn kháng khuẩn sau 24 ± 2h. Thí nghiệm được lặp lại 3 lần trên các mẫu thực vật tại 3 thời điểm (ngày) khác nhau.

3 CHƢƠNG III: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 KẾT QUẢ

3.1.1 Kiểm định chỉ tiêu nấm và ký sinh trùng

Cùng những quan sát về trạng thái cũng như các biểu hiện bên ngồi và thơng qua các thí nghiệm kiểm tra thì mẫu cá bệnh thu được hồn tồn khơng bị nhiễm tác nhân ký sinh trùng và nấm.

3.1.2 Phân lập vi khuẩn và định danh sơ bộ

Từ vết thương trên da, mẫu bệnh phẩm trong gan và thận của 20 cá bệnh đã phân lập được 30 chủng vi khuẩn. Sau 24 ± 2h ủ ở nhiệt độ 28OC quan sát thấy hình thái các khuẩn lạc thu được đều cĩ kích thước nhỏ khoảng từ 1 - 2mm, màu trắng đục hoặc trắng, bề mặt trơn láng trên mơi trường NA (cĩ bổ sung 3% NaCl).

Thơng qua hình thái khuẩn lạc trên mơi trường TCBS, các phân tích về đặc điểm sinh lý và sinh hĩa, 30 chủng vi khuẩn phân lập được chia thành 4 nhĩm chính và đều cĩ một số đặc điểm chung như: vi khuẩn kỵ khí tùy ý, oxidase dương tính, cĩ khả năng sử dụng đường glucose, khơng sinh H2S và khơng sinh hơi trên mơi trường KIA, hồn tồn khơng sinh trưởng ở nhiệt độ thấp (4O

C) (Phụ lục 3).

Nhĩm 1 (5 chủng): nhĩm vi khuẩn cĩ hình thái khuẩn lạc trong, đường kính 1 – 1,5mm; hầu hết đều khơng sinh trưởng và phát triển được ở nhiệt độ 42OC và trong mơi trường cĩ nồng độ muối cao.

Nhĩm 2 (5 chủng): nhĩm vi khuẩn cĩ hình thái khuẩn lạc màu xanh, trịn bĩng, đường kính 2 – 2,5mm; cĩ khả năng sinh trưởng và phát triển ở mức nhiệt độ và nồng độ muối khác nhau.

Nhĩm 3 (9 chủng): nhĩm vi khuẩn cĩ hình thái khuẩn lạc màu vàng, trịn bĩng, đường kính 2 – 2,5mm; tất cả đều phát triển được ở nhiệt độ 42OC nhưng khả năng chịu muối lại khơng giống nhau.

Nhĩm 4 (11 chủng): nhĩm vi khuẩn cĩ hình thái khuẩn lạc màu vàng, hơi nhăn, tâm cĩ dạng vịng, đường kính 1.5 – 2mm; hầu hết đều khơng sinh trưởng và phát triển được ở nhiệt độ 42OC và trong mơi trường cĩ nồng độ muối cao.

Theo khĩa phân loại của Bergy (Breed và cs., 1957), các nhĩm vi khuẩn trên cĩ khả năng là Vibrio spp. hoặc Aeromonas spp. (dương tính với oxidase và cĩ khả năng sử dụng đường glucose) (Phụ lục 4).

3.1.3 Xác định độc lực của vi khuẩn và định danh vi khuẩn mục tiêu 3.1.3.1 Thí nghiệm xác định độc lực của vi khuẩn 3.1.3.1 Thí nghiệm xác định độc lực của vi khuẩn

Tiến hành cảm nhiễm ngẫu nhiên 6 chủng vi khuẩn thu từ 4 nhĩm: D1-2 (nhĩm 1) và D1-6 (nhĩm 2); nhĩm vi khuẩn cĩ hình thái khuẩn lạc vàng trên mơi trường TCBS (nhĩm 3 và 4) cĩ tần suất xuất hiện trên cá bệnh cao hơn, do đĩ sẽ chọn hai chủng vi khuẩn trong mỗi nhĩm là D2-10 và D3-1 (nhĩm 3), D1-8 và D2-2 (nhĩm 4).

Kết quả gây cảm nhiễm trên cá Khoang cổ đỏ (Amphiprion frenatus) khỏe với các nghiệm thức tiêm vi khuẩn cho thấy chỉ cĩ chủng vi khuẩn D1-8 (nhĩm 4) (Hình 3.1) cĩ khả năng gây chết cá với biểu hiện hoạt động lờ đờ, bỏ ăn và chết sau thời gian cảm nhiễm ngắn nhưng khơng xuất hiện các tổn thương trên da và vây.

Ngồi ra, các chỉ tiêu mơi trường như: nhiệt độ, pH, NO2- và NH3/NH4+ vẫn ở mức cho phép trong suốt quá trình cảm nhiễm.

Kết quả cảm nhiễm được trình bày trong Bảng 3.1. Các chủng cịn lại lần lượt là D1-2, D1-6, D2-10, D3-1 và D2-2 được xác định khơng phải tác nhân gây bệnh (ở nồng độ tiêm 1,25x107 CFU/cá, cá vẫn khỏe mạnh sau 10 ngày theo dõi).

Bảng 3.1. Kết quả cảm nhiễm chủng D1-8 trên cá Khoang cổ đỏ (A. frenatus) Nồng độ Nồng độ tiêm (CFU/ml) Nồng độ tiêm (CFU/cá thể) Lần 1 (% cá chết) Lần 2 (% cá chết) Trung bình (% cá chết) 2.5x108 1,25 x107 85% 85% 85% 1.25 x108 6,25 x106 60% 55% 57,5% 6.25 x107 3,13 x106 30% 20% 25% 3.13 x107 1,56 x106 0% 0% 0%

Khi tiêm chủng D1-8 cĩ nồng độ 1,25x107 CFU/cá, cá bắt đầu chết sau 24h cảm nhiễm và số lượng cá chết tăng nhanh dần từ ngày thứ 2 trở đi với tỷ lệ cá chết tích lũy cao nhất đạt 85%. Bên cạnh đĩ, khi tiêm vi khuẩn ở mật độ 6,25x106 CFU/cá cũng đã làm chết cá với tỷ lệ khá cao 57,5% sau 5 ngày cảm nhiễm. Tuy nhiên, tỷ lệ chết tích lũy lại đạt khá thấp ở mức nồng độ pha lỗng tiếp theo 3,13x106 CFU/cá khi chỉ cịn lại 25% sau 9 ngày cảm nhiễm và cá hồn tồn khơng chết do cảm nhiễm ở nồng độ pha lỗng cuối cùng 1,56x106 CFU/cá (Hình 3.3).

Mặt khác, kết quả cịn cho thấy độc lực của chủng D1-8 khá thấp khi giá trị LD50 chỉ đạt khoảng 5,5x106 CFU/cá (Hình3.2).

Hình 3.2. Biểu đồ xác định chỉ số LD50 của chủng D1-8

Hình 3.3. Biểu độ xác định tỷ lệ chết tích lũy theo ngày của chủng D1-8 3.1.3.2 Định danh vi khuẩn bằng test sinh lý và sinh hĩa

Kết quả định danh bằng Kit API-20E khơng định danh được chủng D1-8 (unacceptable profile). Kết hợp các đặc điểm sinh hĩa được thực hiện từ Kit API- 20E (Hình 3.5) và các đặc điểm sinh lý, sinh hĩa khác (Bảng 3.2) nhập vào phần

mềm ABIS trực tuyến, kết quả cho thấy chủng vi khuẩn gây bệnh D1-8 tương đồng với các chủng Aeromonas caviae (82%), Aeromonas taiwanensis (82%),

Aeromonas molluscorum (85%) và Aeromonas media (80%) cĩ trên cơ sở dữ liệu. Ngồi ra độc tính của D1-8 cịn được xác định qua khả năng làm tan huyết khi nuơi trên mơi trường thạch máu (Hình 3.4).

Hình 3.4. Khả năng làm tan huyết của chủng D1-8

Bảng 3.2. Đặc điểm sinh lý và sinh hĩa của chủng vi khuẩn D1-8 Chỉ tiêu Chủng D1-8 Chỉ tiêu Chủng D1-8

Nhuộm Gram - ONPG +

Hình dạng Que ngắn ADH +

Mơi trường TCBS Vàng LDC -

Di động + ODC +

Lactose + Citrate +

Sinh catalase + H2S -

Sinh oxidase + Urease -

Sinh hơi - TDA +

NO2 + Indole + O129 (0,5µg) R VP - Kỵ khí + Gelatine - Tính chịu muối 0% NaCl 3% NaCl 5% NaCl 6% NaCl 8% NaCl 10% NaCl + + + - - - Sử dụng đường Glucose Mannitol Inositol Sorbitol Rhamnose Sucrose Melibinose Amygladine Arabinose + + + - + + - - + Nhiệt độ 4OC 42OC - -

3.1.4 Kháng sinh đồ

Sau khi xác định chủng cĩ khả năng gây bệnh, tiến hành thử nghiệm tính mẫn cảm với kháng sinh của chủng D1-8 và một chủng ngẫu nhiên khác khơng gây chết cá là D2-10 (Bảng 3.3).

Sau khi đối chiếu vịng kháng khuẩn với các số liệu tham khảo trong CLSI M100-S17 cho thấy:

 Chủng D1-8 gây chết phân lập được hồn tồn kháng với Amoxicilin và Rifampin; nhạy với hầu hết 6 loại kháng sinh cịn lại, hình thành các vịng kháng khuẩn cĩ kích thước khá lớn và đặc biệt nhạy với Chloramphenicol, Doxycyclin và Tetracycline (Phụ lục 5).

 Chủng D2-10 chỉ kháng với Cefixime và nhạy với 7 kháng sinh cịn lại với tất cả vịng kháng khuẩn đều rất lớn (Hình 3.6).

Bảng 3.3. Bảng kết quả xác định kháng sinh đồ của 2 chủng D1-8 và D2-10

CD30 AMX25 D30 TE30 CFM5 C30 CL30 RA5 D1-8 S R S S S S S R

D2-10 S S S S R S S S

Chú thích: CD30: Cefadroxil 30µg/đĩa CFM5: Cefixime 5µg/đĩa

AMX25: Amoxicilin 25µg/đĩa C30: Chloramphenicol 30µg/đĩa D30: Doxycyclin 30µg/đĩa CL30: Cefalexin 30µg/đĩa TE30: Tetracycline 30µg/đĩa RA5: Rifampin 5µg/đĩa

Hình 3.6. Kết quả thử nghiệm khả năng kháng 8 loại kháng sinh của hai chủng D1-8 (trái) và D2-10 (phải)

3.1.5 Khả năng kháng khuẩn của một số loại thực vật

Với các loại thực vật khác nhau sẽ cĩ hoạt chất kháng khuẩn khác nhau vì thế khả năng kháng lại các chủng vi khuẩn cũng sẽ khác nhau (Bảng 3.4).

- Dịch chiết thơ của tỏi, trà xanh, trầu khơng, trứng cá và ổi thể hiện khả năng kháng khuẩn với các mức độ khác nhau. Trong đĩ, khả năng kháng khuẩn cao nhất là tỏi và giảm dần đối với trà xanh, ổi, trứng cá và thấp nhất là trầu khơng (Hình 3.7).

- Các loại thực vật cịn lại như: nghệ vàng, nghệ trắng, nghệ đen, lá cộng sản, lá diếp cá, lá húng quế, lơ hội, bạc hà đều khơng cĩ khả năng kháng lại các chủng vi khuẩn thí nghiệm.

Bảng 3.4. Kết quả kháng khuẩn của dịch chiết một số loại thực vật Loại thực

vật khảo nghiệm

Đƣờng kính vịng kháng khuẩn của một số chủng vi khuẩn (mm)

E.coli YR TNX D1-8 D2-10 Tỏi 35 ± 2,0 24,75 ± 3,27 33,66 ± 5,51 37,75 ± 5,12 46,33 ± 4,51 Trà xanh 15 ± 0 15,5 ± 1,29 14,33 ± 0,58 16 ± 1,0 17,67 ± 2,08 Trầu khơng 10,25 ± 2,5 10,6 ± 2,41 11,5 ± 1,29 12,67 ± 4,62 9,67 ± 1,53 Ổi 10,33 ± 0,58 15,33 ± 1,53 17,33 ± 5,03 13 ± 1,73 14,33 ± 3,06

Một phần của tài liệu Xác định các tác nhân gây bệnh trên cá cảnh biển tại thủy cung Vinpearl, bước đầu thử nghiệm khả năng kháng khuẩn của một số thực vật trên tác nhân gây bệnh cho cá (Trang 33)