Ng 2.2 Môi tr ng nuôi cy phân lp

Một phần của tài liệu Khảo sát tình hình đề kháng kháng sinh của vi khuẩn Escherichia coli phân lập tại Bệnh viện Nhi Đồng 1 từ 10 2013 đến 03 2014 (Trang 49 - 94)

i u ki n BA CA SS MC Phân * * 350C-370C N c ti u * * 350C-370C Máu * * Bình n n (BA), 350C-370C D ch não t y * * Bình n n, 350C-370C D ch c th , m , đƠm, d ch đ ng hô h p * * Bình n n (BA) 350C-370C

: Sau khi c y xong đ vào t m nhi t đ 370C, t 18-24 gi .

Các m u b nh ph m d ch não t y, m , máu đ c c y trên môi tr ng BA ph i v ch satellite (đ ng SAU).

Khi tùy lo i b nh ph m vƠ môi tr ng mà t 5% CO2 hay t m bình th ng.

K t qu :

N u vi khu n m c c n ti n hƠnh xác đnh có ph i là t p nhi m hay không, n u không thì ti p t c đ nh danh vi khu n (có th có nhi u lo i vi khu n khác nhau c n đnh danh t t c các lo i khúm khác nhau).

2.2.2.2 Ph ng ph́p c y đ nh l ng

Nguyên t c: Dùng đ c y m u b nh ph m lƠ n c ti u. n v tính th ng là CFU/ml. Dùng que c y đ nh l ng đ c y, 1 vòng que c y t ng đ ng v i 1/103ml.

Thao tác:

 Kh trùng que c y. M n p l , kh trùng mi ng l đ ng m u.  Làm ngu i que c y l y 1 vòng m u c y.

 Kh trùng l i mi ng l vƠ đ y n p l l i.

 M t tay m n p đ a petri m t tay b t đ u c y trên m t th ch theo ki u c y hàng rào.

: Sau khi c y hƠng rƠo trên môi tr ng BA, MC vào t m nhi t đ 370C, t 18-24 gi .

K t qu : Khi vi khu n m c trên 10 khúm thì ti p t c đ nh danh vi khu n (khi trên môi tr ng có nhi u lo i khúm ta có th xác đnh là t p khu n).

2.2.3 Quy trình đ nh danh:

2.2.3.1 H th ng đ nh danh

đnh danh vi khu n Escherichia coli ta d a vƠo s đ đnh danh tr c khu n Gram ơm nh sau. [23]

S NH DANH TR C KHU N GRAM ÂM

Test sinh hóa (KIA, SIM, CIT, Oxidase)

Enterobacteriaceae  Glucose(+) (KIA)  Oxidase (-)

Non-Enterobacteriaceae (Non fermentative Gram negative bacilli)

 Glucose (-)  Oxidase (+)/(-)  Không m c trên MC

B ng tr c nghi m sinh hóa đnh danh tr c khu n Gram (-)

API 20NE Pseudomonas aeruginosa (Pae)  MC (+); CIT(+); Oxidase(+).  BA: khúm l n, biên ko đ u, ph ng/ h i l i, tiêu huy t , có mùi th m nh .  MHA: s c t xanh/ vƠng, mùi th m nh .  KIA: Glu(-), Lact(-),

ánh xám b c b m t môi tr Acinetobacter spp.  MC: (+)  KIA: Glu (-), Lact: (-)  SIM: Ind (-), H2S (-), di đ ng (-)  CIT (+)  Oxidase (-) API 20NE

B ng 2.3: B ng tr c nghi m sinh hóa đ nh danh tr c khu n Gram âm. [21]

Ghi chú:

Yersiniae enterolitica không di đ ng 360C nh ng di đ ng 220C.

2.2.3.2 Ph ng ph́p nhu m Gram. [16, 23, 28]

Nguyên t c:

S b t màu Gram khác nhau vi khu n Gram d ng vƠ Gram ơm lƠ do tính th m th u khác nhau đ i v i ethanol c a hai nhóm vi khu n đó. N u dùng lysozyme bi n đ i vi khu n Gram d ng thƠnh protoplast không có vách thì protoplast l i b t màu Gram âm. Vi khu n Gram d ng có thƠnh t bào dày t 15 đ n 50 nm, d ng l i,

Vi khu n KIA, sinh h i H2S IND CIT Ure di đ ng

Escherichia coli L+/G+ + - + - - + Shigella spp. (A,B,C) L-/G+ - - -/+ - - - Shigella sonnei L-/G+ - - - - Edwardsiella tarda L-/G+ + + + - - + Salmonella spp. L-/G+ + + - + - + Citrobacter freundii L+/G+ + + + - + +/- Citrobacter koseri L-/G+ + - + + +/- + Klebsiella pneumoniae L+/G+ ++ - - + + - Klebbsiella oxytoca L+/G+ ++ - + + + - Enterobacter aerogenes L+/G+ ++ - - + - + Enterobacter cloacae L+/G+ ++ - - + +/- + Serratia marcescens L-/G+ + - - + - + Proteus vulgaris L-/G+ +/- + + -/+ + + Proteus mirabilis L-/G+ + + - +/- + + Providencia rettgeri L-/G+ - - + + ++ + Morganella morganii L-/G+ + - + - ++ - Yersiniae enterolitica L-/G+ + - +/- - +/- -

c u t o b i peptidoglycan. Ch t này có kh n ng gi ph c h p tím k t tinh - lugol. Trong khi đó, l p thành t bào peptidoglycan c a các vi khu n Gram âm thì m ng h n vƠ th ng có thêm l p màng lipopolysaccharde (LPS). Sau khi nhu m v i ph c h p tím k t tinh - lugol, m u đ c x lí ti p v i h n h p kh màu, làm m t n c c a các l p peptidoglycan trong thành t bƠo Gram d ng, t đó lƠm gi m kho ng tr ng gi a các phân t và khi n thành t bào b t gi ph c h p tím k t tinh ậ lugol bên trong t bào.

i v i vi khu n Gram âm, h n h p kh mƠu đóng vai trò lƠ ch t hoà tan lipit và làm tan màng ngoài c a thành t bào. L p peptidoglycan m ng (ch kho ng 10 nm) không th gi l i ph c h p tím k t tinh ậ lugol và t bào Gram âm b kh màu và b t màu thu c nhu m b sung.

 D ng c và thu c nhu m: D ng c :  Khuyên c y khu n  èn c n (đèn gas)  Kính đ ng v t (lame) s ch  Bút chì m  BHI  ng h phút Thu c nhu m:

 Dung d ch Crystal Violet  Dung d ch Iodine (Lugol)  C n 95%

 Dung d ch Safranin 0,5% hay dung d ch Carbol Fuchsin 1/10  Methylen blue

Ngu n: nh ch p t i b nh vi n

Hình 2.21 B thu c nhu m Gram và nhu m phân

 Các b c ti n hành

 H nhanh tiêu b n qua ng n l a đèn c n

 Dùng bút chì m ho c bút lông ghi tên m u và s th t , và v vòng tròn d= 15mm trên lame kính đ đánh d u v t khu n.

B c 1: Chu n b v t bôi: Dùng que c y vô trùng l y m t ít b nh ph m đ gi a phi n kính, làm khô trong không khí.

 M u th làm phi n ph t

T b nh ph m

 N u b nh ph m là m hay các ch t ngo i ti t t ng đ ng: lƠm m t ph t m ng v i khuyên c y đư kh trùng, tr i đ u trên t m kính trên m t di n tích 1,5 × 2,5 cm.

 N u b nh ph m đ c l y b ng que gòn: Dùng que gòn làm phi n ph t th ng ho c làm huy n tr c v i 1 gi t n c mu i n u b nh ph m đư khô.

 N u b nh ph m lƠ đƠm hay phơn: Ch n ph n có m hay máu.

 N u là b nh ph m l ng nh n c ti u, n c t y s ng: Làm phi n ph t t c n l ng li tâm v i ng hút có đ ng kính nh .

T l a c y:

 N u là l a c y l ng: Tùy theo đ đ c c a l a c y, ta l y m t gi t nh hay l y đ y 2,3 khuyên c y khu n đ làm phi n ph t.

 N u là l a c y trên môi tr ng đ c: dùng khuyên c y khu n ch m trên 1 nhóm vi khu n riêng l , làm huy n tr c trong 1 gi t n c mu i trên kính, xong tr i m ng thành phi n ph t. Nên phơn tán đ u không dày đ có th quan sát đ c t ng t bào vi khu n.

 K thu t làm phi n ph t

 C m que c y th t th ng đ ng, đ u khuyên đ t trên ng n l a đèn c n vƠ đ t đ đ u que c y.

 ngu i, l y 1 khuyên đ y b nh ph m.

 t khuyên b nh ph m vào gi a t m kính, cho áp sát vào m t kính, ph t đ u trên kính thành nh ng hình b u d c v i di n tích 1,5 × 2,5 cm.

 t đ đ u que c y đ kh khu n.

B c 2: C đnh tiêu b n vi khu n:

Phi n ph t đ c đ khô t nhiên trong không khí, ho c h nh trên ng n đèn. Sau đó l u đnh phi n ph t b ng cách đ a nhanh t m lame qua l i trên ng n l a đ 4 - 5 l n, đ m t có phi n ph t phía trên. Không đ c h nóng quá vì s làm các t bào co l i.

B c 3: Nhu m

 Ph dung d ch Crystal Violet (tím k t tinh) lên phi n ph t trong 1 phút, r a n c và nghiêng lame cho ráo.

 Ph dung d ch lugol l n I đ 30 giơy, đ b và r a n c r i nghiêng lame cho ráo.

 nghiêng phi n lame 450C, t y màu b ng dung d ch alcohol 95% cho đ n khi gi t cu i cùng ch y ra kh i phi n kính không còn mƠu (thông th ng kho ng 10 - 30 giây) thì r a n c, th m khô. ơy lƠ b c quan tr ng nh t.

 Nhu m b sung b ng dung d ch Safranin trong 1 phút, r a n c, đ khô trong không khí.

B c 4: Soi kính: S d ng d u soi kính và v t kính d u đ quan sát

Ngu n: Internet

Hình 2.22: K t qu nhu m Gram c a B- và C+

Ngu n: nh ch p t i b nh vi n

Hình 2. 23 T bào bi u mô Hình 2.24 T bào b ch c u

 Vi khu n Gram (+): gi màu tím c a Crystal Violet.  Vi khu n Gram (-): gi mƠu đ c a Safranin.

 M t s sai sót trong k t qu nhu m Gram Gram (+) có th tr thành Gram (-)

 Do s t h y, t ng tính acid c a môi tr ng, nhi t đ c y không thích h p, s hi n di n c a m t s đ c ch t. Do đó mu n đ c chính xác ph i nhu m Gram v i l a c y t 18-24 gi .

 Khi dung d ch indol đư h ng. Vì th ph i gi dung d ch Indol trong chai nâu, tránh ánh sáng và lo i b khi dung d ch t màu nâu s m đ i sang màu vàng nh t

 T y màu quá lâu

Có th nh m l n Gram (-) là Gram (+), n u:  Phi n đ c l u đ nh khi ch a khô.

 Phi n ph t quá d y, vi khu n phơn tán không đ u, t p trung quá nhi u m t ch và có th gi màu tím khi t y màu.

 Th i gian t y quá ít.

2.2.3.3 Th nghi m kh́ng sinh đ theo ph ng pháp Kirby-Bauer. [11,15,23]

Nguyên t c

Kháng sinh đ c t m vƠo đ a gi y theo n ng đ cho t ng lo i.Thu c kháng sinh th m trên đ a, khu ch tán ra môi tr ng xung quanh đ a ng n ch n s phát tri n c a vi khu n. ng kính vòng vô khu n di n đ t tính c m ng c a vi khu n đ i v i thu c kháng sinh, tr ng h p không có vòng vô khu n, vi khu n kháng l i thu c kháng sinh.

B ng 2.4 : Tiêu chu n đ ng kính vòng vô khu n vi khu n đ ng ru t (Enterobacteriaceae)

a kháng sinh:

Là nh ng đ a gi y th m có b dƠy 1 mm, đ ng kính 6 mm đ c t m m t dung d ch thu c kháng sinh v i n ng đ tiêu chu n. a kháng sinh ph i đ c gi t l nh, có kèm theo ch t lƠm khan n c, ch ng m s c nóng và s ngo i nhi m làm h ng đ a.

STT A KHÁNG SINH HÀM L NG NG KÍNH VÒNG VÔ KHU N Kháng (R) Trung gian (I) Nh y (S) 1 Ampicillin 10 µg ≤ 13 14 - 16 ≥ 17 2 Amikacin 30 µg ≤ 14 15 - 16 ≥ 17 3 Cefotaxime 30 µg ≤ 14 15 - 22 ≥ 23 4 Ceftazidime 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 5 Ceftriazone 30 µg ≤ 13 14 - 20 ≥ 21 6 Cefuroxime (oral) 30 µg ≤ 14 15 - 22 ≥ 23 7 Chloramphenicol 30 µg ≤ 12 13 - 17 ≥ 18 8 Ciprofloxacin 5 µg ≤ 15 16 - 20 ≥ 21 9 Bactrim 1.25/23.75 µg ≤ 10 11 - 15 ≥ 16 10 Gentamicin 10 µg ≤ 12 13 - 14 ≥ 15 11 Nalidixic acid (*) 30 µg ≤ 13 14 - 18 ≥ 19 12 Nitrofurantoin (*) 300 µg ≤ 14 15 ậ 16 ≥ 17 13 Norfoxacin (*) 10 µg ≤ 12 13 - 16 ≥ 17 14 Polymycin B 100 UI - - ≥ 17 15 Imipenem 10 µg ≤ 13 14 -15 ≥ 16 16 Cefepime 30 µg ≤ 14 15 - 17 ≥ 18 17 Pefloxacine 5 µg ≤ 15 16 - 20 ≥ 21 18 Ticarcillin 75 µg ≤ 14 15 - 19 ≥ 20 19 Meropenem 10 µg ≤ 13 14 - 15 ≥ 16 20 Aztreonam 30 µg ≤ 15 16 - 21 ≥ 22

Các tiêu chu n l a ch n kháng sinh th nghi m đ c h ng d n chi ti t b i y ban Qu c gia v tiêu chu n c a các phòng thí nghi m t i M . Các tiêu chu n chính:

 Ch n kháng sinh đ i di n cho nhóm có cùng ph ho t đ ng  Tùy thu c vào lo i vi khu n th nghi m

 Tùy thu c vào v trí nhi m khu n

 Tùy theo chi n l c và chính sách s d ng kháng sinh t ng vùng, t ng b nh vi n.

Môi tr ng:

 Môi tr ng tiêu chu n là MHA, pH: 7,4. V i các vi khu n khó tính ph i cho thêm 5% máu.

 Môi tr ng đ c đ vƠo đ a petri v i b dày c a th ch là 4 mm. B o qu n t l nh không đ c dùng sau 7 ngƠy. Tr c khi dùng, ph i l y ra kh i t l nh và đ cho đ n khi đ t đ c nhi t đ phòng.

 Dung d ch chu n đ đ c (huy n d ch t ng đ ng đ đ c khu n 1 - 2.108 CFU/ml)

Vi khu n th nghi m:

Vi khu n sau khi đư đ c c y thu n khi t, c y vào ng 2 ậ5 ml môi tr ng BHI, sau đó vortex thƠnh m t huy n d ch vi khu n đ ng nh t theo đ đ c chu n.

K thu t (ph ng pháp)

 Dùng que gòn nhúng vào canh c y đư đ c chu n đ đ c, ép h t n c trên thành ng nghi m, xong tr i th t đ u lên m t th ch. 5 - 10 phút nhi t đ phòng đ lo i b vi khu n th a.

 Dùng k p h l a, đ ngu i g p đ a thu c kháng sinh đ lên m t th ch, đè nh cho đa n m sát đ có s ti p xúc tr n v n v i m t th ch, bìa các đ a ph i cách xa nhau 2,5 - 3,5 cm và cách thành h p th ch 2 - 2,5 cm.

 370C vƠ đ c k t qu sau 24 gi .

c k t qu b ng cách đo đ ng kính vòng vô khu n r i so v i b ng chu n.

Ph ng pháp phát hi n vi khu n ti t men betalactamse ph r ng:

Ph ng ph́p th nghi m ESBLs (ph ng ph́p đ a hi p đ ng kép)

H p th ch MHA 1: đ t 5 khoanh gi y kháng sinh nh ng v trí có ch ý:  ATM gi a

 CTX, CRO, CAZ, CPD đ t xung quanh cách ATM 30 mm và các khoanh gi y kháng sinh cách nhau 30 mm.

H p th ch MHA 2: đ t 4 khoanh gi y kháng sinh nh ng v trí có ch ý:  Ceftazidime-Clavulanic acid , Ceftazidime

 Cefotaxime-Clavulanic acid , Cefotaxime M i khoanh gi y kháng sinh cách nhau 30 mm.

Cách đ c k t qu th nghi m phát hi n men ESBLs:

 Nghi ng vi khu n có ti t men ESBLs.

Ch c n 2 trong 4 lo i kháng sinh CPD, CTX, CAZ, ATM có đ ng kính vòng vô khu n b ng ho c nh h n vòng vô khu n kho ng trung gian.

 Kh ng đ nh vi khu n có ti t men ESBLs.

Khi s chênh l ch đ ng kính vòng kháng khu n ≥ 5mm c a 2 c p gi y kháng sinh CTX/CCTX và CAZ/CCAZ.

3 K T QU NGHIểN C U VẨ BI N LU N Các k t qu đ c trích t ph n m m x lỦ WHONET vƠ đ c x lý l i b ng Word và Excel. 3.1 K t qu t l nhi m khu n Trong 6 tháng t 01/10/2013 đ n 31/03/2014 khoa ti p nh n 11476 m u b nh ph m (6073 m u máu, 3224 m u DNT và m u m , 585 m u phân, 579 m u n c ti u

Một phần của tài liệu Khảo sát tình hình đề kháng kháng sinh của vi khuẩn Escherichia coli phân lập tại Bệnh viện Nhi Đồng 1 từ 10 2013 đến 03 2014 (Trang 49 - 94)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(94 trang)