Sau khi ti n hành khai thác d li u trên NCBI b ng các t khóa “APC gene”, “methylation”, “epigenetics”, “cancer”ầ chúng tôi thu đ c 17 bài báo kh o sát m c đ methyl hóa trên vùng promoter c a gen APC b nh nhân ung th . Nhìn chung, các nghiên c u v đánh giá m c đ methyl hóa t i vùng promoter gen APC b nh nhân ung th đ c th c hi n nhi u qu c gia trên th gi i và các s li u trên cho th y, có s khác bi t l n v t n s methyl hóa, lo i m u s d ng gi a các nghiên c u (thông tin chi ti t đ c trình bày ph l c 5).
Hình 3.1.1: Các ph ng pháp sinh h c phân t s d ng trong 17 nghiên c u.
Bên c nh đó, sau khi phân tích các d li u tìm đ c, chúng tôi nh n th y, các nghiên c u trên s dùng nhi u k thu t sinh h c phân t khác nhau nh MSP, qMSP, RT-PCR đ đánh giá m c đ methyl hóa t i vùng promoter c a gen APC, tuy nhiên MSP là ph ng pháp ph bi n nh t chi m 79,3% (P<0.05).
Báo cáo KLTN- Ph m Th Th ng Trang 34
Hình 3.1.2: th mô t t l methyl hóa tr ng s c a m u mô ung th v i các lo i ung th .
Chú thích: BMTBVTQ: ung th bi u mô t bào v y th c qu n, CTC: ung th
c t cung, TT: ung th đ i tr c tràng, UTBQ: ung th bàng quang, UTR: ung th ru t, UTV:ung th vú.
Theo phân tích t l methyl hóa có tr ng s c a m u mô ung th v i các lo i ung th , nhóm chúng tôi nh n th y t n s methyl hóa trên gen APC đ i v i m u mô ung th b nh nhân ung th bàng quang là cao nh t, và th p nh t là ung th đ i tr c tràng. B ng 3.1.1. T l lo i m u s d ng trong 17 nghiên c u. Lo i m u S nghiên c u s d ng T l (%) Mô đông l nh 11 64,7 Mô t i 1 5,9 Mô đúc paraffin 2 11,8 Mô khác 3 17,6
Báo cáo KLTN- Ph m Th Th ng Trang 35 th y m u mô đông l nh đ c s d ng v i t l khá cao, chi m 64,7%, bên c nh đó m u paraffin và mô t i c ng đ c s d ng các phân tích này v i t l l n l t là 11,8% và 5,9% (thông tin trong b ng 3.1.1).
V i nh ng d li u trên, chúng tôi ti n hành kh o sát in silico, thi t k b m i thích h p cho ph ng pháp MSP, đ đánh giá m c đ methyl hóa t i các đ o CpG thu c vùng promoter gen APC.