III.1 Khai thác d l iu

Một phần của tài liệu Đánh giá mức độ Methyl hóa tại các đảo CpG thuộc vùng Promoter gen APC trên các bệnh ung thư (Trang 33 - 35)

Sau khi ti n hành khai thác d li u trên NCBI b ng các t khóa “APC gene”, “methylation”, “epigenetics”, “cancer”ầ chúng tôi thu đ c 17 bài báo kh o sát m c đ methyl hóa trên vùng promoter c a gen APC b nh nhân ung th . Nhìn chung, các nghiên c u v đánh giá m c đ methyl hóa t i vùng promoter gen APC b nh nhân ung th đ c th c hi n nhi u qu c gia trên th gi i và các s li u trên cho th y, có s khác bi t l n v t n s methyl hóa, lo i m u s d ng gi a các nghiên c u (thông tin chi ti t đ c trình bày ph l c 5).

Hình 3.1.1: Các ph ng pháp sinh h c phân t s d ng trong 17 nghiên c u.

Bên c nh đó, sau khi phân tích các d li u tìm đ c, chúng tôi nh n th y, các nghiên c u trên s dùng nhi u k thu t sinh h c phân t khác nhau nh MSP, qMSP, RT-PCR đ đánh giá m c đ methyl hóa t i vùng promoter c a gen APC, tuy nhiên MSP là ph ng pháp ph bi n nh t chi m 79,3% (P<0.05).

Báo cáo KLTN- Ph m Th Th ng Trang 34

Hình 3.1.2: th mô t t l methyl hóa tr ng s c a m u mô ung th v i các lo i ung th .

Chú thích: BMTBVTQ: ung th bi u mô t bào v y th c qu n, CTC: ung th

c t cung, TT: ung th đ i tr c tràng, UTBQ: ung th bàng quang, UTR: ung th ru t, UTV:ung th vú.

Theo phân tích t l methyl hóa có tr ng s c a m u mô ung th v i các lo i ung th , nhóm chúng tôi nh n th y t n s methyl hóa trên gen APC đ i v i m u mô ung th b nh nhân ung th bàng quang là cao nh t, và th p nh t là ung th đ i tr c tràng. B ng 3.1.1. T l lo i m u s d ng trong 17 nghiên c u. Lo i m u S nghiên c u s d ng T l (%) Mô đông l nh 11 64,7 Mô t i 1 5,9 Mô đúc paraffin 2 11,8 Mô khác 3 17,6

Báo cáo KLTN- Ph m Th Th ng Trang 35 th y m u mô đông l nh đ c s d ng v i t l khá cao, chi m 64,7%, bên c nh đó m u paraffin và mô t i c ng đ c s d ng các phân tích này v i t l l n l t là 11,8% và 5,9% (thông tin trong b ng 3.1.1).

V i nh ng d li u trên, chúng tôi ti n hành kh o sát in silico, thi t k b m i thích h p cho ph ng pháp MSP, đ đánh giá m c đ methyl hóa t i các đ o CpG thu c vùng promoter gen APC.

Một phần của tài liệu Đánh giá mức độ Methyl hóa tại các đảo CpG thuộc vùng Promoter gen APC trên các bệnh ung thư (Trang 33 - 35)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(67 trang)