Hàng năm, MISA đầu tư rất nhiều vào việc nghiên cứu phát triển các sản phẩm phần mềm mới, và nâng cấp các tính năng mới, hoặc cơng nghệ cho các sản phẩm hiện cĩ.
Các sản phẩm chủ chốt được nâng cấp lên phiên bản mới
MISA Mimosa: Phần mềm kế tốn hành chính sự nghiệp
Là một trong những phần mềm chủ chốt của MISA, Phần mềm kế tốn hành chính sự nghiệp MISA Mimosa cĩ số lượng khách hàng trên khắp 64 tỉnh thành, từ thành phố đến các huyện miền núi xa xơi.
MISA-SME: Phần mềm kế tốn doanh nghiệp
Từ năm 2004 đến nay, Phần mềm kế tốn doanh nghiệp MISA-SME đạt được sự tăng trưởng vượt bậc (tỉ lệ tăng trưởng 70%) về số lượng khách hàng. MISA-SME hiện đang là phần mềm duy nhất trong số hàng trăm sản phẩm phần mềm tham dự, đạt được giải thưởng Giải pháp phần mềm hay nhất (Best IT Solution - BIT CUP) trong 5 năm liên tiếp (2004-2008) do người dùng bình chọn thơng qua điều tra của Tạp chí Thế giới Vi tính PCWorld và tập đồn dữ liệu Quốc tế IDG.
Các sản phẩm được phát triển mới
MISA Bamboo.NET: Phần mềm Kế tốn Xã
Năm 2007 MISA đa phát triển và cho ra mắt sản phẩm Phần mềm Kế tốn cho các đơn vị hành chính cấp Xã mang tên MISA Bamboo.NET. Với hơn 11.000 đơn vị hành chính cấp xã, phường trên tồn quốc cùng với ưu thế kinh nghiệm trong lĩnh vực phần mềm kế tốn, MISA kỳ vọng sẽ chiếm được thị phần 70% số lượng khách hàng xã/phường trên tồn quốc.
MISA CRM.NET 2008: Phần mềm Quản trị Quan hệ Khách hàng
Phần mềm Quản trị Quan hệ Khách hàng MISA CRM.NET hỗ trợ quá trình điều hành, tác nghiệp từ khâu marketing, bán hàng, đến khâu hỗ trợ khách hàng. MISA CRM.NET khơng chỉ cung cấp câu trả lời để kịp thời hỗ trợ cho các quyết định kinh doanh của lãnh đạo doanh nghiệp mà cịn là cơng cụ tác nghiệp hàng ngày của nhân viên marketing, bán hàng và tư vấn chăm sĩc khách hàng.
MISA Human Resouce.NET: Phần mềm Quản trị Nhân sự
Phần mềm Quản trị Nhân sự MISA Human Resource.NET trợ giúp cho việc quản trị nhân sự, bao gồm từ khâu tuyển dụng, quản lý hồ sơ nhân viên theo dõi và đánh giá nhân viên, chấm cơng và tính lương, chi trả các khoản trợ cấp và bảo hiểm
MISA Panda. NET 2008: Phần mềm kế tốn nghiệp vụ thi hành án
Phần mềm MISA Panda.NET 2008 được xây dựng theo chế độ kế tốn nghiệp vụ thi hành án (THA) ban hành theo Quyết định số 572/2004/QĐ-BTP ngày 25 tháng 10 năm 2004 của Bộ Tư pháp và cập nhật theo Quyết định số 09/2007/QĐ-BTP ngày 08 tháng 10 năm 2007 của Bộ trưởng Bộ Tư pháp. Phần mềm này được áp dụng thống nhất cho tất cả các đơn vị quản lý THA Dân sự từ Trung ương đến cấp huyện.