Bên cạnh những ưu điểm đó nờu ở trên, trong quá trình phát triển sản xuất kinh doanh của mỡnh Công ty không thể tránh khỏi những nhược điểm và những hạn chế nhất định, đó là:
- Tuy có sự đầu tư đổi mới nhưng do hạn chế về kinh phí nên nhìn chung là hệ thống máy móc, trang thiết bị không đồng bộ.
- Công tác tiêu thụ sản phẩm chưa phát triển tương xứng với sự phát triển của năng lực sản xuất. Thị trưởng tiêu thụ chủ yếu ở nông thôn, nắm bắt nhu cầu thị trường, giá cả chưa kịp thời nờn cũn bị động trong việc chỉ đạo sản xuất, kinh doanh.
- Về vấn đề đánh giá nguyên vật liệu xuất kho: Công ty áp dụng theo phương pháp bình quân cuối kỳ là khá chính xác, hợp lý nhưng lại phức tạp, công tác kế toán tập trung vào cuối thỏng nờn rất mất thời gian và gây khó khăn cho kế toán.
- Về thủ tục nhập, xuất kho nguyên vật liệu: Đối với phế liệu thu hồi nhập kho, Công ty chưa làm thủ tục nhập kho mà chỉ khi nào có khách mua, bộ phận vật tư mới
thông báo cho kế toán để nhập số liệu vào máy hạch toán giảm chi phí giá thành sản phẩm.
- Hạch toán tổng hợp NVL ở Công ty sử dụng hình thức Nhật ký chung nhưng lại không sử dụng sổ Nhật ký đặc biệt mua hàng. Mặc dù sử dụng Nhật ký đặc biệt sẽ có nhược điểm là ghi trùng lặp giữa Nhật ký chung và Nhật ký đặc biệt nhưng nếu sử dụng cả hai loại nhật ký này sẽ có ưu điểm là những nghiệp vụ kinh tế phát sinh thường xuyên sẽ được ghi riêng thuận tiện cho việc theo dõi, quản lý.