Mặc dù các doanh nghiệp dệt may đã áp dụng các chuẩn mực kế toán Việt Nam, chế độ kế toán mới cho các doanh nghiệp theo Quyết định số 15/2006/QĐ-BTC và Quyết định số 48/2006/QĐ-BTC, nhưng việc áp dụng tại các doanh nghiệp còn nhiều hạn chế:
Hạn chế trong việc xử lý các khoản chênh lệch vĩnh viễn:
- Khoản chênh lệch vĩnh viễn phát sinh tại các Công ty cổ phần Dệt may là các khoản chi phí không hợp lý: các khoản chi phí không có hóa đơn chứng từ theo quy định, các khoản chi không làm phát sinh doanh thu, thu nhập trong kỳ. Tuy nhiên, trong quá trình tự kê khai quyết toán thuế TNDN, các doanh nghiệp Dệt may không loại trừ các khoản chênh lệch này.
1)Ngày 18/9/2010, Tổng Giám đốc Công ty TNHH Thương Mại Dịch Vụ và Xây Dựng Đứ Hà duyệt chi theo Bảng thanh toán ủng hộ quỹ vì người nghèo là 15.000.000 VNĐ của Công đòan Công ty. Kế toán hạch toán vào TK 6413 - chi phí quảng cáo (Trích sổ cái TK 641- chi phí bán hàng của Công ty TNHH Thương Mại Dịch Vụ và Xây Dựng Đứ Hà). Số tiền ủng hộ không phải là chi
phí làm phát sinh doanh thu của đơn vị. Do đó, không được tính vào chi phí được trừ khi tính thuế TNDN.
2)Ngày 02/07/2010, kế toán Công ty TNHH Thương Mại Dịch Vụ và Xây Dựng Đứ Hà ghi tăng chi phí tiếp khách số tiền 83.500.000 VNĐ (chưa VAT) trên cơ sở hóa đơn ăn uống và phòng nghỉ tại khu du lịch Sầm Sơn , hạch toán vào TK 6422 – Chi phí tiếp khách (Trích sổ cái TK 642 – Chi phí QLDN của Công TNHH Thương Mại Dịch Vụ và Xây Dựng Đứ Hà). Số tiền tiếp khách này
không phải là chi phí làm phát sinh doanh thu của đơn vị. Do đó, không được tính vào chi phí được trừ khi tính thuế TNDN.
- Các khỏan thuế bị truy thu và tiền phạt do vi phạm hành chính của doanh nghiệp đã bị cơ quan thuế hoặc các cơ quan chức năng có thẩm quyền ra quyết định truy thu và phạt cũng không được tính vào chi phí hợp lý. Tuy nhiên, có doanh nghiệp vẫn ghi nhận vào các khoản phí và lệ phí để tính vào chi phí trong kỳ.
3)Cụ thể, Công ty TNHH Thương Mại Dịch Vụ và Xây Dựng Đứ Hà , ngày 14/5/2011, kế toán căn cứ biên lai thu tiền phạt chậm nộp thuế TNDN, số tiền phạt 500.000 VNĐ, ghi vào chi nộp các khoản phí, lệ phí (trích sổ cái TK 6425- chi nộp các khoản phí – lệ phí cho doanh nghiệp). Khoản phát
sinh này không được tính vào chi phí thuế TNDN theo quy định của Luật thuế TNDN hiện hành.
4) Công ty TNHH Thương Mại Dịch Vụ và Xây Dựng Đứ Hà hạch toán khoản tiền nộp phạt vi phạm hành chính 327.002.800 VNĐ vào khoản mục chi phí khác làm cơ sở xác định lợi nhuận kế toán. Điều này làm phát sinh khoản chênh lệch vĩnh viễn do tiền phạt vi phạm hành chính không được Luật thuế TNDN 2008 cho phép khấu trừ khi xác định thu nhập chịu thuế