KET QUA VÀ THẢO LUẬN

Một phần của tài liệu Luận văn thạc sĩ Công nghệ sinh học: Nghiên cứu truy xuất phả hệ quần đàn cá tra (Pangasianodon hyphophthalmus) chọn giống bằng chỉ thị phân tử microsatellite (Trang 65 - 85)

3.1. Đánh giá đa dạng di truyền qua thé chọn giống bằng bộ chỉ thị

microsatellite

3.1.1. Đánh giá tính 6n định của bộ microsatellite 3.1.1.1. Kết quả tách chiết DNA tổng số

Thực tế thu mẫu đã đảm bảo được số lượng gia đình và số lượng cá con, nhưng có 5 mẫu không cho kết quả PCR, điện di mao quản (trong quá trình lưu trữ có sơ sót nên bị khô cồn, dẫn đến khi li trích không đảm bảo chất lượng). Vì vậy, số lượng cá con là 495, thấp hơn thực tế thiết kế thí nghiệm là 5 cá con). Chakraborty (1992) cho rằng với nghiên cứu di truyền quần thể sử dụng số lượng mẫu trên 100 cá thé ở mỗi quan thé đủ lớn cho phép thu được các chỉ số thống kê đáng tin cậy.

Như vậy, tông số mẫu của 50 gia đình nghiên cứu gồm 40 cá bó, 50 cá mẹ và 495 cá

con (45 gia đình có 10 cá con và 5 gia đình có 9 cá con).

Mẫu vây cá tra sau khi tách chiết được kiểm tra trên gel agarose 1% (Hình

3.1):

Size (bp)

1013

500 400

200

100

Hình 3.1. Hình đại diện điện di một số mẫu DNA tổng số

Kết quả ở Hình 3.1 cho thấy có nồng độ DNA cao, sạch và ít bị đứt gãy; đo quang phô ở bước sóng 260nm và 280nm dé kiểm tra độ tinh sạch, nồng độ DNA của sản phẩm tách chiết cho thấy hàm lượng DNA tách chiết (Phụ lục 1) tương đối cao từ 169,6 - 474,4 ng/ml và độ tinh sạch đo được từ 1,862 - 1,981. Kết quả tách chiết DNA có vạch sản phẩm điện di đậm, rõ nét, DNA ít bị đứt gãy, độ tinh sạch cao 1,7<OD260nm/OD280nm<2 được sử dụng cho phản ứng PCR. Vì vậy, kết quả li trích DNA này cho thay DNA có độ tinh sạch cao phù hợp cho phản ứng PCR tiếp theo.

3.1.1.2. Kết quả ghi nhận dir liệu alen

Một số hình ảnh cho kết quả dữ liệu ghi nhận alen bằng phần mềm

GeneMapper 5.0:

Hình 3.2. Biểu đồ hình anh của tất cả các chỉ thị sau khi phân tích bằng phần mềm

GeneMapper 5.0

Cường độ tín hiệus Peak số 1 Peak số 2

(28000 RFUs) (alen 1) (alen 2) A Sutter peak \

| /

14..589.06.2022.03.09/47.08.12.06, PragmrerlAns|F1% Mử2-solan can jộ 8 '\ /

2000 = sổ \ lẹ

2000 -Ấ \

som \~ \

7 mann

: 18 io

z e

Kích thước alen Kích thước alen

(123bp) (139bp)

Hình 3.3. Biéu đồ hình ảnh tín hiệu của chỉ thị Pahy - 20 (mô tip lặp là 2 nueleotide) của mẫu cá con 596 - 06

Tín hiệu cho thấy mẫu phân tích là kiêu gen dị hợp, kích thước alen là 123 và 139 bp. Kết quả mẫu tốt, tín hiệu nhiễu thấp, các đỉnh chính có hình dạng đúng.

Xuất hiện các đỉnh lặp lại có tín hiệu thấp hơn alen chính xác. Thông tin đánh giá chất lượng tín hiệu thể hiện phía trên cùng của hình: hình vuông màu xanh là tốt, hình tam giác màu vàng là chấp nhận được, hình tròn màu đỏ là kém.

1 peak

B8-830:46-2022.63.08-17.06-12-08_FrsomardAns C16 'Mỉ2ssisn cfish: a la 2

—z“

270 20 20 900

ti1illiF

wm8 —====

Kích thước alen (306bp)

Hình 3.4. Biéu đồ hình ảnh tín hiệu của chỉ thị Pahy - 14 (mô típ lặp là 2

nucleotide) của mẫu cá con 530 - 10.

Tín hiệu cho thấy là kiểu gen đồng hợp, kích thước alen là 306 bp. Kết quả mẫu tốt, tín hiệu nhiễu thấp, đỉnh chính có hình dạng đúng. Xuất hiện các đính lặp

lại có tín hiệu thấp hơn alen chính xác. Thông tin đánh giá chất lượng tín hiệu thể hiện phía trên cùng của hình: hình tam giác màu vàng là chấp nhận được.

Tất cả các sản phẩm thu được sau phản ứng multiplex PCR của 90 mẫu cá bố mẹ và 495 mẫu cá con, đều được điện di trên hệ thống máy 3500 Genetic Analyzer và phân tích bằng phần mềm GeneMapper 5.0 đề xác định được kiểu alen 08 chỉ thị microsatellite của từng cá thể được khảo sát. Từ kết quả alen thu được, nhập vào phần mềm Excel dé quan lý và xử lý dữ liệu. Sau đó, tiến hành phân tích các thông số đa dang di truyền và truy xuất pha hệ bằng phan mềm CERVUS và COLONY.

Trong quá trình ghi nhận kiểu gen đã gặp một số trường hợp có thé gây sai sót

như mô tả từ Hình 3.5 - Hình 3.9 dưới đây:

03_528-08_2022.02.08-17-08-12_02_Fragmenténa Bê MO2asian catfish là I)

180 { 180) 170 180 190 200 z0Paty

32000, 29000:

24000 20000, 16000;

12000:

8000.

4000

9 J Vì wi LA

169}

Hinh 3.5. Biéu dé hinh anh trường hợp tín hiệu vượt quá mức ghi nhận của mẫu cá con 528 - 06. Tín hiệu cho thấy ở vị trí kích thước alen là 160 bp có tín hiệu vượt

quá mức ghi nhận, không thé hiện được đỉnh

37_T8L08.2022.0003/2267.09.08_fragmerlâna Sẽ |Mo2easian catfish | |B |B

120 14) 160 460 170 100 190Bi ]

2800 2400

2000 18001 1200)

8000 —

400

k a

Hình 3.6. Biểu đồ hình ảnh tín hiệu trường hợp tín hiệu yếu của mẫu cá con 751 -

08. Tín hiệu ở vị trí kích thước alen 157 bp có tín hiệu yêu khi ghi nhận

97_751-08_2022-03-09-22-57-08_08_FragmentAna 96 MO2-asian catfish 8 8

] 190 14) 190 190 170 190 190

j fl

Hình 3.7. Biểu đồ hình ảnh tin hiệu trường hợp không ghi nhận được tin hiệu của mẫu cá con 751 - 08. Kết quả hiển thi dấu “?”

05 _530-10_2022-03-08-17.08-12_03_FragmentAna|C10 |M2as.iancafish | [A [a

Pahy-07,

480 6) 1ì ‘80 190 2M 210

$2000 23000 2400 20000 16000:

12000 8000 400

0 Lhe LIL a

Hình 3.8. Biéu đồ hình anh tín hiệu trường hợp xuất hiện đỉnh lặp lai (stutter peak) của mẫu cá con 530 - 10

04_528.09.20220909-17.08.12.02_fragmerlâna|B9 M02agian catfish [a L] ]

Paty-A6 ]

110 180 19 20 210 Pa 20

24000

zen

18000;

12000:

9000

480

0 1/2 3|Í4

fa]

Hình 3.9. Biểu đồ hình ảnh tin hiệu trường hợp xuất hiện 2 đỉnh chênh lệch nhau 1 bp do hiện tượng thêm 1 Adenin và đầu 3’ của mẫu cá con 528 - 09. Dinh 3 là alen

chính xác có mô tip lặp là 2 nucleotide (206 bp), đỉnh 4 là trường hợp thêm 1

adenine vào sản phẩm của đỉnh 3 (207 bp), đỉnh 1 (204 bp) là đỉnh lặp lại của

đỉnh 3, đỉnh 2 (205 bp) là đỉnh lặp lại của đỉnh 4

3.1.1.3. Kết quả khảo sát tính 6n định của các microsatellite

Kết quả khảo sát tính 6n định của các microsatellite được trình bày ở Bảng

3.1,

Bảng 3.1. Hiệu suất PCR của 08 microsatellite

Hiệu

suất Pahy - 0Š Pahy - 07 Pahy - 08 Pahy - 09 Pahy - 14 Pahy - 16 Pahy - 19 Pahy - 20

PCR

: 100% 100% 100% 100% 100% 100% 100% 100%

bô mẹ

Cácon 994% 998% 990% 990% 100% 98.4% 988% 100%

Trong nghiên cứu phân tích di truyền phân tử, yếu tố hiệu suất cho kết quả sản phẩm khuếch đại (hiệu suất PCR) cũng đóng góp vai trò quan trọng trong kết quả phân tích. Theo Yue va Xia (2014) nên sang lọc các microsatellite ôn định và có hiệu suất PCR trên 90,0%, đữ liệu bị thiếu (missing data) < 5% (tỉ lệ ghi nhận không thành công alen). Nếu một microsatellite có chỉ số đa hình cao tuy nhiên chỉ có < 90,0% tổng số mẫu có sản phẩm khuếch đại thì kết quả số liệu không khuếch dai (missing data) cao. Kết quả phân tích cho thấy hiệu suất PCR của các microsatellite trên 50 mẫu bố mẹ GO và 50 mẫu dan con G1 đạt yêu cầu (98,4 - 100%) (Bảng 3.1). Trong đó, ở tất cả 50 mẫu cá bố mẹ đều cho tỉ lệ ghi nhận thành công alen đạt 100% và trên 495 mẫu cá con đạt thấp nhất là 98,4% tại chỉ thị Pahy - 16 (§ mẫu không ghi nhận được alen), tỉ lệ đạt được thấp hơn so với nghiên cứu của Trần Thị Phương Dung và ctv (2021), đạt 99,0 - 100% khi sử dụng cùng nhóm mẫu với nghiên cứu này nhưng với bộ 10 chỉ thị khác. Tuy nhiên, kết quả phân tích cho thấy hiệu suất PCR của bộ 08 chỉ thi microsatellite trên 90% với dữ liệu bị thiếu <

5% đã đạt yêu cầu. Vì vậy, 08 chỉ thị này có hiệu suất PCR cao và là những microsatellite có tính 6n định phù hợp với truy xuất pha hệ.

3.1.2. Kết quả đánh giá đa dạng di truyền và xác định tính đa hình của bộ microsatellite trên quan thé nghiên cứu

Kết quả thông số đa dang di truyền bằng phan mềm CERVUS 3.0.7 được thé hiện chỉ tiết ở Phụ lục 2.

3.1.2.1. Số lượng alen và kiểm tra cân bằng Hardy-Weinberg

Số lượng trung bình của các alen phản ánh thêm mức độ đa dạng di truyền trong các quần thê nghiên cứu. Trong nghiên cứu này, số lượng alen trung bình của nhóm mẫu 50 gia đình cá tra đạt 13,375, dao động từ 8 - 21 alen, trong đó sé alen/locus dat thap nhat 6 chi thi Pahy - 05 va Pahy - 14 (8 alen), cao nhất ở chỉ thị Pahy - 07 (21 alen) (Bảng 3.2). Kết quả cho thấy số lượng alen cao thể hiện tính đa

hình của các chỉ thị microsatellite. So với các nghiên cứu trước vê độ đa hình các

alen trên cùng đối tượng cá tra cho thấy một số microsatellite trong nghiên cứu này khuếch đại được số alen trên mỗi chỉ thị cao hơn, cụ thể là nghiên cứu của

Volckaert va ctv (1999) đạt 3 - 9 alen, Bùi Thị Liên Hà và ctv (2017) đạt 1 - 9 alen

và Nguyen và ctv (2019) đạt 4 - 7 alen. Mặt khác, số alen trung bình/locus đạt 13,88 cao hơn nghiên cứu của Nguyễn Hữu Ninh và Lưu Thị Hà Giang (2012) sử dụng 08 microsatellite (7,83 alen/locus). Lí do có thể đến từ ba nguyên nhân sau: (1) do số lượng gia đình ở các nghiên cứu trước thấp hơn nghiên cứu này (nghiên cứu của Nguyễn Hữu Ninh và Lưu Thị Ha Giang (2012) tiễn hành truy xuất trên 30 gia đình;

nghiên cứu của Bùi Thị Liên Hà và ctv (2017) tiến hành truy xuất trên 25 gia đình).

Trên thực tế, nếu không xét đến mức độ đa dạng alen khác nhau giữa các chỉ thị và các chỉ thị tuân theo quy luật Mendel thì sự đa dạng alen sẽ thể hiện hầu hết ở các cá thể bố mẹ mà ít liên quan đến số lượng cá con. Điều này dẫn đến các nghiên cứu khảo sát nhiều gia đình (nhiều cá bố mẹ) hơn thì sẽ phát hiện nhiều alen hơn; (2) đo công nghệ điện di mao quản ở các nghiên cứu trước đây sử dụng hệ thống có độ phân giải (phân biệt các alen gần nhau từ 3 - 5 bp) thấp hơn nghiên cứu này (hệ thống Genetic Analyzer 3500) có thể ghi nhận được tín hiệu của 2 đoạn DNA có độ dài cách biệt 1 - 2 bp) và (3) nghiên cứu này thiết kế các mồi từ trình tự gen toàn phần của cá tra đã được công bố trên cơ sở dữ liệu NCBI (Kim và ctv, 2018) nên

các cặp môi có thê có tính đặc hiệu hơn các nghiên cứu trước.

Bang 3.2. Thông tin đa dang di truyền chung của 8 microsatellite trên 50 gia đình trong nghiên cứu

eer Chi thi Trung Chi tiêu Pahy-05 Pahy-07 Pahy-08 Pahy-09 Pahy-14 Pahy-16 Pahy-19 Pahy-20 bình

Nhóm mau bố mẹ (n=50)

Hiệu suất PCR (%) 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 100,0 Na 9 21 19 14 8 12 11 14 13,375 Ho 0,512 0,904 0,883 0,847 0,550 0,811 0,808 0,610 0,741 He 0,776 0,880 0,891 0,837 0,562 0,785 0,787 0,722 0,780 PIC 0,745 0,869 0,881 0,818 0,530 0 797 0,756 0,692 0,756 HWE NS ND ND ND NS NS ND NS

Faw 0,208 - 0,015 0,004 - 0,005 0,008 - 0,015 - 0,014 0,085 0,032

Nhom mau ca con (n=495)

Hiéu suất PCR (%) 99,4 99,8 99,0 99,0 100,0 98,4 98,8 100,0 99,5

Na 8 20 20 14 8 12 11 14 13,375 Ho 0,769 0,891 0,848 0,807 0,603 0,769 0,736 0,718 0,768 He 0,768 0,898 0,893 0,847 0,623 0,776 0,779 0,731 0,789 PIC 0,738 0,888 0,882 0,830 0,575 0,745 0,746 0,697 0,763 HWE = NS NS NS NS NS NS

Fnun -0,0119 0,0029 0,0248 0,0240 0,0198 0,0063 0,0272 0,0133 0,013 Na: sô lượng alen; Ho: chỉ sô di hợp tử quan sat; He: chỉ sô dị hop tử mong doi; PIC: thông tin da hình; HWE: trạng thái cân bang Hardy-Weinberg; NS: cân bang;

ND (Not done): Kiểm tra trạng thái cân bằng Hardy-Weinberg chưa được thực hiện; *: không cân bằng Hardy-Weinberg; F„„: tần số null - alen

Trong nghiên cứu này, khi xét trạng thái cân bằng theo quy luật Hardy- Weinberg tại các microsatellite khảo sát, kết quả ở Bảng 3.2 cho thấy trên nhóm cá bố mẹ (G0) có bốn chỉ thị không kiểm tra được theo quy luật cân bằng Hardy- Weinberg (Pahy - 07, Pahy - 08, Pahy - 09 và Pahy - 19), phần mềm CERVUS không thực hiện kiểm tra Hardy-Weinberg đối với một chi thị nhất định nếu N x a nhỏ hơn tan số mong đợi tối thiểu, trong đó N là số kiểu gen va q là tần số của alen hiếm nhất (Ferrando, 2021). Tiếp theo, ở nhóm cá con (G1) đa số đều tuân theo quy luật Hardy-Weinberg (trừ Pahy - 05, Pahy - 19 không cân bằng theo quy luật

Hardy-Weinberg).

3.1.2.2. Hệ số Ho, He, PIC, tan số null - alen

Bên cạnh tinh ôn định thì trong phân tích pha hệ yêu cầu các chỉ thị phan tử phải có độ đa hình cao (Jones và ctv, 2010). Các giá trị Ho, He, PIC có thể cung cấp thông tin quan trọng trong việc đánh giá tính đa dạng di truyền giữa các cá thể và quan thể khác nhau, mặt khác cũng thể hiện tinh đa hình của các microsatellite. Giá

trị Ho, He, PIC được phân tích và trình bày ở Bảng 3.2.

Kết quả ở Bảng 3.2 cho thấy hệ số đa dạng di truyền (PIC) trung bình của các microsatellite trên GO và G1 lần lượt là 0,756 và 0,763. Cụ thé, chỉ số PIC dao động từ 0,53 (Pahy - 14) đến 0,881 (Pahy - 08). Theo tác giả Botstein (1980), khi

PIC > 0,5 và He > 0,6 chỉ thị có sự đa dạng cao; khi PIC > 0,25 chỉ thị có sự đa

dạng thấp; 0,25 < PIC < 0,5 chỉ thị có sự đa dạng trung bình. Vì vậy, PIC của hầu

hết các chỉ thị microsatellite là hơn 0,5 và điều này chỉ ra rằng các chỉ thị microsatellite được chọn có độ đa dạng cao và có thể áp dụng cho phân tích đa dạng di truyền và truy xuất phả hệ.

Tương tự, kết quả ở Bảng 3.2 cho thấy tỉ lệ dị hợp tử thực tế trung bình (Ho) và tỉ lệ dị hợp tử lí thuyết trung bình (He) trên tất cả các chỉ thị lần lượt là 0,741, 0,780 và 0,768, 0,789. Cụ thể, chỉ số He dao động từ 0,562 (Pahy - 14) đến 0,891 (Pahy - 08) và Ho dao động từ 0,512 (Pahy - 05) đến 0,904 (Pahy - 07). Hầu hết các chỉ thị đều cho thay tỉ lệ di hop tử mong doi He tương déi cao phản ánh sự ton tại

của sự khác biệt trong nhóm mâu. Kêt quả này cũng phù hợp với các nghiên cứu về

mức độ đa hình của một số microsatellite trên cá tra (Tran Thi Phương Dung và ctv (2021), He trung bình và PIC trung bình lần lượt là 0,76 và 0,71; nghiên cứu của Nguyen và ctv (2019), chỉ số He trung bình và PIC trung bình lần lượt là 0,73 và

0,69). Theo tac giả Boistein va ctv (1980), microsatellite được cho là có độ đa hình cao khi He > 0,6 và PIC > 0,5; nghiên cứu của Bùi Thị Liên Hà và ctv (2017) cũng

cho rằng các microsatellite có Na (số alen/locus) > 4 và PIC > 0,5 đã có thể dùng cho truy xuất pha hệ. Vì vậy, cả 08 microsatellite được phân tích đều có độ đa hình cao và có thé sử dụng cho truy xuất pha hệ. Kết quả phân tích dit liệu cũng cho thấy, giữa quan dan GO và G1 cho thấy đa số các chỉ thị có giá tri di hợp tử quan sát thấp hơn giá tri di hợp tử mong đợi (ở GO trừ Pahy - 07, Pahy - 09, Pahy - 16 và Pahy - 19; ở G1 trừ Pahy - 05). Sự thiếu hụt di hợp tử đã thường xuyên được dé cập tới trong các nghiên cứu trên đối tượng thủy sản nuôi và tự nhiên khi sử dụng chỉ thị phân tử allozyme, microsatellite và có thé được giải thích do giao phối cận huyết tạo nên sự xuất hiện của các alen lặn, alen câm (Cruz và ctv, 2004; Chen và ctv,

2015).

Các alen có tần số null - alen (Faun) khảo sát trên hai quần đàn nghiên cứu dao động từ - 0,015 đến 0,208 (Bảng 3.2). Kết quả này phù hợp với các nghiên cứu truy xuất phả hệ và đánh giá đa dạng di truyền với xác suất xuất hiện null - alen thường < 0,2 (trừ Pahy - 05 trên quần đàn G0) không làm ảnh hưởng nhiều đến khả năng truy xuất (Dakin và Avise, 2004). Tuy nhiên, đánh giá các chỉ số tần số null - alen, chỉ số Ho, He va PIC và dựa vào phương pháp ““leave one out’’ (phương pháp loại bỏ ngẫu nhiên một hoặc vai microsatellite) dé đạt thông số đạt yêu cầu tốt nhất được sử dụng nhiều trong các nghiên cứu khi tiến hành xử lý số liệu (Varma và

Simon, 2006) xét hai trường hợp sau:

- (1) Chỉ thị Pahy - 05 đồng thời có chỉ số Ho thấp hơn các chỉ thị khác (0,512) và tỉ lệ null - alen cao (0,208), trong khi các chỉ thị còn lại đều có tỉ lệ null - alen thấp (từ -0,015 đến 0,085) nên chỉ thị này cần được kiểm tra lại khi thực hiện truy xuất bằng cách thực hiện truy xuất nhưng loại bỏ chỉ thị này ra khỏi bộ dữ liệu.

Vi tỉ lệ null - alen khi lớn hơn 0,2 có thé ảnh hưởng nhiều đến khả năng truy xuất

(Dakin và Avise, 2004).

- (2) Theo Boistein va ctv (1980), microsatellite có độ đa hình cao khi He >

0,6 và PIC > 0,5, vì vậy chỉ thị Pahy - 14 có giá trị dị hợp tử lí thuyết He < 0,6

(0,562) và chỉ số đa hình (PIC) gần với 0,5 (0,53) nên cần được kiểm tra lại khi thực hiện truy xuất bằng cách thực hiện truy xuất nhưng loại bỏ chỉ thị này ra khỏi bộ dữ

liệu.

3.1.2.3. Khảo sát sự phân bố tần số alen của 08 chỉ thi microsatellite trong quan thể nghiên cứu

Từ dit liệu tan số alen (TSAL) của 08 chỉ thị thu được ở nhóm cá bố mẹ và cá con nghiên cứu (Phụ lục 3), sau đó lập đồ thị so sánh TSAL giữa hai nhóm mẫu trên. Kết quả nghiên cứu so sánh được đánh giá đối với từng chỉ thị nghiên cứu cụ thé như sau:

s* Pahy - 05

Kết quả so sánh sự phân bố TSAL chỉ thị Pahy - 05, giữa nhóm cá bố mẹ và cá con nghiên cứu tương ứng được thể hiện ở Hình 3.10 như sau:

So sánh sự phân bố tần suất alen của chỉ thị Pahy - 05

=Cabéme #Cá con

(%)

26,06

ee 2532 Ss œ 0tSve 3 apeaco Xt,= is

aa ge ar Kỹ eS

-_ co

e &

on ul Tt ==

243 245 247 249 351 53 37 259 277 Alen (bp)

Hình 3.10. Đồ thị so sánh su phân bố TSAL chi thi Pahy - 05, giữa nhóm cá bố me

với nhóm cá con trong 50 gia đình cá tra

Từ kết quả so sánh được thể hiện ở Hình 3.10 cho thấy: Ở nhóm cá bố mẹ (N=90) xuất hiện có 9 alen (từ alen 243 đến alen 277) với tần số dao động từ 0,56%

(alen 277) đến 32,78% (alen 257). Ở cá con (N=495) chỉ xuất hiện 8 alen (từ alen 243 đến alen 259) với tần số dao động từ 2,83% (alen 243) đến 33,94% (alen 257). Như vậy, về số lượng alen va sự phân bố TSAL của chỉ thi Pahy - 05 khảo sát có sự tương đồng về số lượng alen và tần số xuất hiện (trừ alen 277). Đa số các alen nhóm bố mẹ đều xuất hiện ở nhóm cá con (8/9 alen) vì vậy kết quả này vẫn phù hợp với quy luật của Mendel. Tương tự, ở Pahy - 14, Pahy - 16 và Pahy - 20 cũng cho kết quả một số alen ở nhóm cá bố mẹ không xuất hiện ở nhóm cá con (Phụ lục 4). Cụ thé, Pahy - 14, ở nhóm cá con xuất hiện 7/8 alen ở nhóm cá bố mẹ; Pahy -16 ở nhóm cá con xuất hiện 9/12 alen và Pahy - 20 có 11/14 alen xuất hiện ở nhóm cá con.

s* Pahy - 07

Tương tự, kết quả so sánh sự phân bố TSAL chỉ thị Pahy - 07, giữa nhóm cá bố mẹ và cá con nghiên cứu tương ứng được thể hiện ở Hình 3.11 như sau:

So sánh sự phân bố tần suất alen của chỉ thị Pahy - 07

#Cá bố mẹ # Cá con (%)

19/98 TT”

11,46 15,56

10,56 1N

9/74

ặ ae. ae 1,67 li II

174 176 178 180 182 184 186 188 19

9

214 216

el

192 194 196

160 1 ts ym 3,338Sm 0,51 0,00ằ 6,20

11081

m 071 m 056 = 0,30

iB

1 — ]—— 5,04 11 —‹‹: ` 556 6,2) ——— 1,6717 So =m 1.67 ————..› me ill0 ` mm 11) 5 @ 4.97

s8 9§ 200 8 8 is}

Alen (bp)

Hình 3.11. Đồ thị so sánh su phân bố TSAL chi thi Pahy - 07, giữa nhóm cá bố me

với nhóm cá con trong 50 gia đình cá tra

Một phần của tài liệu Luận văn thạc sĩ Công nghệ sinh học: Nghiên cứu truy xuất phả hệ quần đàn cá tra (Pangasianodon hyphophthalmus) chọn giống bằng chỉ thị phân tử microsatellite (Trang 65 - 85)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(116 trang)