Khu vực huyện Thuận Bắc và Ninh Phước mang đặc trưng điều kiện tự nhiên vùng Duyên hải Nam Trung Bộ có đặc điểm về khí hậu và địa hình phức tạp. Là nơi chịu ảnh hưởng của hầu hết các loại thiên tai thường xảy ra ở Việt Nam như: bão, áp thấp nhiệt đới (ATNĐ), lũ lụt, lũ quét, sạt lở bờ sông, lốc tố, dông sét, sạt lở đất, hạn hán,… Trong đó dạng thiên tai thường xuyên xảy ra trên địa bàn 2 huyện là bão, mưa lớn, lũ quét, ngập lụt, sạt lởđất do mưa và
dịng chảy, nắng nóng kéo dài gây hạn hán.
Bão: Huyện Ninh Phước và Thuận Bắc có mùa bão tập trung vào tháng 10 và 11, đôi khi vào tháng 1 năm sau. Lượng mưa lớn nhất trong 24 giờ đã ghi được là 180mm, nguy cơ bão ở Biển Đơng có khả năng ảnh hưởng đến khu vực là bão mạnh cấp 12, cấp 13; gió bão mạnh nhất có thể lên đến 60 - 65 m/s.
Lũ ống, lũ quyét: Khu vực trọng điểm thường xảy ra lũ ống, lũ quét:
+ Huyện Thuận Bắc: Thôn Kiền Kiền 1, Kiền Kiền 2, Bà Râu 1, Bà Râu 2 xã Lợi Hải; thơn Ba Tháp, Gị Sạn xã Bắc Phong; xã Phước Kháng; thôn Hiệp Thành, Suối Đá xã Công Hải.
Lũ lụt và ngập: Các khu vực thường bị lũ lụt và ngập:
+ Huyện Ninh Phước: Thơn Thuận Hịa, Phước Khánh, Phước Lợi, Vạn Phước xã Phước Thuận; thôn Phước Thiện 3, Ninh Quý 2 và 3 xã Phước Sơn; thơn Thái Giao, Hồi Ni
xã Phước Thái; khu phố 2, 5 và 6 thị trấn Phước Dân; thơn Từ Tâm, Thành Tín xã Phước Hải;
thơn Long Bình 1, 2, Hịa Thạnh, An Thạnh 1 và 2 xã An Hải. Các hộ dân dọc 2 bên triền sông Cái từ đập Nha Trinh đến cuối sông Cái.
+ Huyện Thuận Bắc: Thôn Ba Tháp, Mỹ Nhơn - xã Bắc Phong; thôn Bà Râu 1 và 2 xã Lợi Hải; thôn Suối Giếng, xã Công Hải.
Sạt lở: Các khu vực trọng điểm sạt lở:
+ Sạt lở đường: đoạn đường vào thơn Bình Tiên xã Cơng Hải; đoạn đường Phước Chiến –Phước Thành, huyện Thuận Bắc.
+ Sạt lở núi, đất: thơn Đá Liệt, Cầu Đá xã Phước Kháng, thơn Xóm Bằng, Láng Me xã Bắc Sơn, xã Phước Chiến huyện Thuận Bắc.
Ngoài ra, trên địa bàn tỉnh thường bị ảnh hưởng các trận tố lốc, dơng sét, nắng nóng, hạn hán.
Sạtlở bờ sơng:Do các hiện tượng khí hậu cực đoan như mưa lớn dẫn đến lũ lụt, một số đoạn sông suối trong khu vực bị xói lở nặng. Hiện tượng này vẫn tái diễn mỗi năm và đe dọa an ninh lương thực và sự an toàn của người dân sống dọc bờ sông suối.