MG Màu vai quả xanh Màu quả chắn độ dày thịt quả (cm) Chiều cao quả (cm) đường kắnh quả (cm) Chỉ số I=H/D Số ngăn hạt/quả Khắa quả 26 Xanh đỏ 0.8 5.6 4.9 1.2 3 Không
27 Xanh ựậm đỏ 0.7 5.0 4.6 1.1 5 Khắa nơng
183 Xanh Vàng 0.6 4.2 4.5 0.9 4 Không
186 Xanh Vàng 0.6 4.8 4.6 1.0 2 Không
190 Xanh nhạt đỏ 0.6 4.8 4.5 1.1 3 Khắa nơng
192 Trắng ngà đỏ 0.7 5.8 4.2 1.4 2 Không 194 Xanh nhạt đỏ 0.5 2.9 3.9 0.8 2 Không 196 Xanh nhạt đỏ 0.7 5.6 4.8 1.2 3 Không 201 Trắng ngà đỏ 0.9 5.3 5.8 0.9 3 Không 234 Trắng ngà đỏ 0.6 5.4 3.8 1.4 4 Không 241 Xanh đỏ 0.6 3.7 4.2 0.9 3 Không 252 Trắng ngà đỏ 0.7 5.3 7.2 0.7 5 Không 254 Xanh đỏ 0.7 4.7 6.8 0.7 2 Không
257 Xanh đỏ 0.7 4.7 5.0 0.9 4 Khắa nơng
261 Xanh nhạt đỏ 0.4 4.6 3.2 1.4 5 Không 264 Xanh nhạt đỏ vàng 0.5 4.6 4.8 1.0 2 Không 269 Xanh nhạt đỏ 0.7 4.8 6.8 0.7 4 Không 274 Trắng ngà đỏ 0.7 5.9 9.0 0.7 5 Khắa nông 275 Trắng ngà đỏ 0.7 5.3 5.4 1.0 3 Không 277 Xanh ựậm đỏ 0.5 4.8 6.7 0.7 3 Không 282 Trắng ngà đỏ 0.7 5.7 5.0 1.1 2 Không 293 Xanh nhạt đỏ 0.4 4.1 4.6 0.9 9 Không 295 Xanh đỏ 0.7 5.9 7.3 0.8 2 Không
297 Xanh nhạt đỏ 0.8 5.9 7.2 0.8 2 Khắa nông
299 Khơng đổi đỏ 0.6 5.2 6.8 0.8 3 Không
300 Khơng đổi đỏ 0.4 3.5 3.9 0.9 5 Khắa nơng
độ dày thịt quả của các mẫu giống nghiên cứu dao ựộng từ 0,4 - 0,9 cm. Dựa vào độ dày thịt quả chúng tơi phân chia các mẫu giống thành 3 nhóm: nhóm thịt quả mỏng (<0,5 cm) gồm 3 mẫu giống 261, 293 và 300; nhóm thịt quả dày (>7 cm) gồm 3 mẫu giống 26, 201 và 297; các mẫu giống cịn lại đều thuộc nhóm trung bình (0,5 - 0,7). Giống đối chứng Savior có độ dày thịt quả ựạt tới 0,9 cm.
Số ngăn hạt/quả là tắnh trạng phụ thuộc vào đặc điểm của giống, ắt chịu sự tác ựộng của ngoại cảnh. Số ngăn hạt/quả càng nhiều thì thường có ắt dịch quả do thể tắch ngăn hạt nhỏ hơn, vì thế ảnh hưởng đến các chỉ tiêu về chất lượng quả như khẩu vị, hương vị, hàm lượng chất khơ hồ tan. Các giống có ắt ngăn hạt thường có ựộ chắc quả kém nên dễ dập nát khi vận chuyển. Nhìn chung, các giống cà chua tốt thường có số ngăn hạt ựạt khoảng 3 - 4 ngăn ựể vừa ựảm bảo cấu trúc chịu lực quả vừa ựảm bảo ựược chất lượng. Kết quả quan sát trình bày trong bảng 4.3 cho thấy số ngăn hạt/quả của các mẫu giống chủ yếu dao ựộng từ 2 - 5,3 ngăn, riêng mẫu giống 274 có tới 9 ngăn hạt/quả. Thuộc nhóm có 3 - 4 ngăn/quả có 12 mẫu giống gồm 293, 26, 190, 196, 192, 275, 27, 201, 264, 277, 297 và 257; nhóm có ≥ 5 ngăn/quả gồm 6 mẫu giống 269, 254, 299, 252, 295 và 274; các mẫu giống cịn lại thuộc nhóm có 2 ngăn hạt/quả. đối chứng Savior có 2 ngăn hạt/quả.
Khắa quả hay khắa vai quả là đặc điểm chỉ phụ thuộc vào giống. Có 3 dạng khắa quả: khắa nơng, khắa sâu và khơng có khắa quả. Các mẫu giống nghiên cứu chủ yếu thuộc dạng khơng khắa, dạng có khắa nơng chỉ gồm 6 mẫu giống là 27, 241, 252, 254, 269 và 297. Khơng mẫu nào có dạng khắa sâụ
Khẩu vị và hương vị quả là các chỉ tiêu chất lượng quả rất quan trọng. Khẩu vị ngọt dịu, hương vị thơm là yêu cầu của người tiêu dùng cũng như chế biến (Kiều Thị Thư, 2003). Kết quả ựánh giá cảm quan về mùi vị cho thấy ngoại trừ mẫu giống 269 và 257 ra thì tất cả ựều có vị thơm ựặc trưng. đánh giá cảm quan khẩu vị cho thấy 5 mẫu giống 241, 252, 254, 274 và 282 cho vị ngọt; 6 mẫu giống 26, 27, 192, 201, 257 và 297 cho vị ngọt dịu; mẫu giống 196 cho vị chua; các mẫu giống cịn lại đều chua dịụ đối chứng Savior có vị chuạ
Bảng 4.4. Một số chỉ tiêu chất lượng quả của các mẫu giống nghiên cứu MG Khẩu vị Hương vị độ ướt thịt quả độ chắc thịt quả độ cứng quả Brix (%) 26 Ngọt dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 4.7
27 Ngọt dịu Thơm Khơ nhẹ Chắc mịn Trung bình 3.0
183 Chua dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 4.0
186 Chua dịu Thơm Ướt Mềm mịn Trung bình 4.0
190 Chua dịu Thơm Khơ nhẹ Chắc mịn Trung bình 4.7
192 Ngọt dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 3.8
194 Chua dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 3.0
196 Chua Thơm Khô Chắc mịn Cứng 2.9
201 Ngọt dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 3.3
234 Chua dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 3.9
241 Ngọt Thơm Ướt Mềm mịn Trung bình 4.5
252 Ngọt Thơm Khô nhẹ Mềm mịn Trung bình 4.5
254 Ngọt Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Mềm 3.8
257 Ngọt dịu Ngái Ướt Mềm mịn Trung bình 4.5
261 Chua dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 4.1
264 Chua dịu Thơm Khơ nhẹ Chắc mịn Trung bình 3.7
269 Chua dịu Ngái Khô nhẹ Mềm mịn Trung bình 4.0
274 Ngọt Thơm Khô nhẹ Mềm mịn Mềm 3.0
275 Chua dịu Thơm Khô nhẹ Mềm mịn Mềm 3.1
277 Chua dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 3.7
282 Ngọt Thơm Khơ nhẹ Mềm mịn Trung bình 3.8
293 Chua dịu Thơm Ướt Chắc mịn Mềm 4.0
295 Chua dịu Thơm Khô nhẹ Mềm mịn Mềm 3.0
297 Ngọt dịu Thơm Khô nhẹ Mềm mịn Trung bình 3.7
299 Chua dịu Thơm Khô nhẹ Chắc mịn Trung bình 4.0
300 Chua dịu Thơm Ướt Mềm mịn Trung bình 3.7
độ chắc thịt quả thuộc loại chắc mịn thì quả thường chắc, chịu vận chuyển tốt, thịt quả mềm mịn thì quả ăn ngon, nấu nhanh nhừ, thịt quả thơ sượng thì quả chắc nhưng ăn khơng ngon, khơng thắch hợp cho ăn tươi và chế biến, thịt quả mềm nát thì chịu vận chuyển kém. Kết quả ựánh giá về ựộ chắc thịt quả bằng cảm quan cho thấy các mẫu giống nghiên cứu thuộc 2 dạng là chắc mịn và mềm mịn. Thuộc dạng mềm mịn có 11 mẫu giống là 269, 257, 186, 275, 295, 300, 241, 252, 274, 282 và 297. đối chứng và các mẫu giống còn lại ựều thuộc dạng chắc mịn.
độ ướt thịt quả có liên quan đến độ cứng quả và chất lượng quả, giống có thịt quả ướt thường mềm hơn giống có thịt quả khơ nhẹ và khơ. Kết quả đánh giá cho thấy thuộc dạng thịt quả ướt chỉ có 5 mẫu giống là 186, 241, 257, 293 và 300; dạng thịt quả khơ chỉ có 1 mẫu là 196. đối chứng Savior và các mẫu giống khác đều thuộc dạng khơ nhẹ.
độ cứng của quả quyết ựịnh khả năng vận chuyển và tồn trữ quả. Các giống quả mềm rất dễ dập nát khi vận chuyển, thời gian bảo quản ngắn nên làm tăng sự thất thoát năng suất sau thu hoạch. đánh giá về ựộ cứng quả bằng cảm quan cho thấy chỉ có mẫu 196 có quả cứng, 5 mẫu giống quả mềm là 254, 275, 295, 274 và 293. Các mẫu giống khác ựều có độ cứng trung bình tương tự ựối chứng Savior.
độ brix hay hàm lượng chất khơ hồ tan trong quả là yếu tố chịu ảnh hưởng bởi cả điều kiện mơi trường và kiểu gen. Cường ựộ ánh sáng cao, quang chu kỳ dài, ựiều kiện thời tiết khô tại thời ựiểm thu hoạch tạo cho quả có hàm lượng chất khơ hồ tan caọ Kết quả đo bằng khúc xạ kế cho thấy ựộ brix của các mẫu giống nghiên cứu dao ựộng từ 2,9 - 4,7 %. Dựa vào kết quả ựo ựộ brix có thể chia các mẫu giống thành 3 nhóm: độ brix thấp (dưới 3,5%) gồm 7 mẫu giống là 27, 194, 196, 201, 274, 275 và 295; ựộ brix cao (4,5 - 6,0%) gồm 5 mẫu giống là 252, 257, 241, 190 và 26. độ brix trung bình (3,6 - 4,4%) gồm các mẫu giống cịn lạị Giống đối chứng Savior có độ brix thấp, đạt 2,0%.
4.1.4. Xây dựng cây phả hệ phân nhóm các mẫu giống dựa trên dữ liệu kiểu hình
Thơng qua kết quả ựánh giá ựặc ựiểm hình thái trên 26 mẫu giống cà chua nghiên cứu, chúng tơi tiến hành phân nhóm các mẫu giống theo từng ựặc ựiểm qua các mơ hình thống kê sinh học, từ đó tắnh khoảng cách hình học giữa các mẫu giống. để làm ựược ựiều này chúng tơi tiến hành mã hóa số liệu thu ựược theo phương pháp của IPGRI thành dạng hệ nhị phân (0,1) bằng chương trình NTedit, sau đó tiến hành phân nhóm các mẫu giống bằng phần mềm NTSYS pc 2.1.
Dựa vào cây phả hệ xây dựng được trên các dữ liệu kiểu hình (hình 4.1) chúng tơi nhận thấy các mẫu giống được phân thành 2 nhóm lớn, nhóm I gồm 16 mẫu giống: 26, 27, 190, 192, 234, 196, 201, 297, 264, 277, 254, 274, 275, 295, 194 và 300; nhóm II gồm 10 mẫu giống cịn lạị Thuộc nhóm thứ nhất, ngoại trừ mẫu giống 274 là dạng sinh trưởng vô hạn, tất cả các mẫu giống khác ựều thuộc kiểu hình sinh trưởng hữu hạn. Nguyên nhân là do kiểu hình sinh trưởng của giống có ảnh hưởng ựến nhiều yếu tố khác ựược sử dụng ựể phân nhóm như đặc điểm nở hoa, số hoa/cây, số quả/câỵ
Hình 4.1. Sơ ựồ phả hệ của 26 mẫu giống cà chua nghiên cứu dựa trên các chỉ thị kiểu hình
Xét ở hệ số tương đồng là 0,66 có thể phân chia 2 nhóm lớn trên thành 5 nhóm nhỏ hơn, cụ thể:
- Nhóm Ị1. gồm 14 mẫu giống: : 26, 27, 190, 192, 234, 196, 201, 297, 264, 277, 254, 274, 275 và 295.
- Nhóm Ị2 gồm 2 mẫu giống: 194 và 300.
- Nhóm IỊ1 gồm 6 mẫu giống: 183, 282, 186, 261, 293 và 299.
- Nhóm IỊ2 gồm 2 mẫu giống: 241 và 257.
- Nhóm IỊ3 gồm 2 mẫu giống: 252 và 269.
4.2. Kết quả nghiên cứu ựa dạng di truyền bằng chỉ thị phân tử SSR
Trong số 10 chỉ thị SSR ựược sử dụng ựể ựánh giá ựa dạng di truyền các mẫu giống cà chua, chỉ có 5 cặp mồi cho sản phẩm khuếch đại đa hình gồm các cặp mồi SSR 304, SSR 108, Tom 8-9A, Tom 49-50 và Tom 322-323. Kết quả ựiện di sản phẩm PCR với 5 cặp mồi này (hình 4.2, 4.3, 4.4, 4.5 và 4.6) ựã thu ựược tổng số 22 alen với 421 vạch băng DNA ựược nhân lên. Trong đó, 14 alen có sự đa hình giữa các mẫu giống nghiên cứu với 213 vạch băng DNA đa hình, chiếm 50,59%. Năm cặp mồi cịn lại đều cho sản phẩm PCR khơng đa hình. Dữ liệu thu ựược từ 5 cặp mồi ựa hình được sử dụng để phân tắch mối quan hệ di truyền giữa các mẫu giống cà chua nghiên cứụ
Hình 4.3. Sản phẩm khuếch ựại DNA hệ gen một số mẫu giống với mồi SSR 108
Hình 4.5. Sản phẩm khuếch đại DNA hệ gen một số mẫu giống với mồi Tom 49-50
Hình 4.6. Sản phẩm khuếch ựại DNA hệ gen một số mẫu giống với mồi Tom 322-323
Kết quả PCR với cặp mồi SSR 304 với 26 mẫu giống thu ựược tổng cộng 7 alen với 132 vạch băng ựược nhân lên.Trong đó có 4 alen đa hình với 54 vạch băng ựược nhân. Cặp mồi SSR 108 thu ựược 3 alen, trong đó 2 alen đa hình. Tổng số vạch băng ựược nhân với cặp mồi này là 67 vạch, trong đó 41 vạch đa hình. Cặp mồi Tom 8-9A tạo ra 4 alen, trong đó 3 alen đa hình, tổng số vạch băng ựược nhân lên là 81 vạch, trong đó 55 vạch đa hình. Cặp mồi Tom 49-50 cho 5 alen, trong đó 3 alen đa hình, tổng số vạch DNA ựược nhân lên là 102, số vạch đa hình là 50 vạch. Cặp mồi Tom 322-323 tạo ra 4 alen với tổng số 39 vạch ựược nhân, trong đó 2 alen đa hình với số vạch đa hình là 13 vạch băng.
Bảng 4.5. Thống kê số băng DNA thu ựược trên các mẫu giống cà chua nghiên cứu với 5 mồi SSR đa hình
Mồi
MG SSR304 SSR108 Tom8-9A Tom49-50 Tom 322-323 Tổng
26 7 3 4 5 1 20 27 5 2 3 3 2 15 183 7 3 4 5 1 20 186 5 2 3 2 1 13 190 6 3 4 5 1 19 192 5 3 3 4 1 16 194 5 3 3 4 1 16 196 5 3 3 3 2 16 201 3 2 2 5 3 15 234 6 3 3 3 1 16 241 5 2 3 3 1 14 252 6 3 4 5 1 19 254 6 3 4 5 1 19 257 5 2 4 4 1 16 261 5 3 2 4 2 16 264 5 3 2 4 2 16 269 5 2 4 4 2 17 274 5 3 3 4 2 17 275 5 2 3 2 1 13 277 3 3 3 5 3 17 282 3 2 3 5 3 16 293 5 2 2 3 1 13 295 4 2 3 3 1 13 297 5 3 3 3 1 15 299 5 2 2 4 2 15 300 6 3 4 5 1 19 Tổng 132 67 81 102 39 421
Dữ liệu thu ựược từ kết quả ựiện di sản phẩm PCR với 5 cặp mồi SSR đa hình ựược thống kê và mã hóa thành dạng số liệu nhị phân dựa trên sự có mặt hay vắng mặt của các vạch băng trên các mẫu giống, tương ứng là 1 hoặc 0. Hệ số tương ựồng di truyền giữa các mẫu giống được tắnh tốn bằng cách sử dụng hệ số tương ựồng (Sij) được mơ tả bởi Nei và Li (1979) trên phần mềm NTSYSpc Version 2.1. Dữ liệu này sau đó ựược sử dụng ựể xây dựng cây phả hệ bằng phương pháp ghép cặp chuỗi dùng khoảng cách trung bình số học ngang bằng UPGMA (Unwaited Pair Group Method using Arithmetic Averages) trên phần mềm NTSYSpc (hình 4.6).
Hình 4.7. Cây phả hệ xây dựng dựa trên dữ liệu phân tắch bằng chỉ thị phân tử SSR
Kết quả trình bày trong hình 4.6 cho thấy các mẫu giống nghiên cứu có hệ số tương ựồng dao ựộng từ 0,41 ựến 0,94. Dựa vào dữ liệu thu ựược, chúng tơi đã xây dựng cây phả hệ dạng dendogram thông qua phần mềm NTSYSpc ver. 2.1 bằng phương pháp UPGMẠ Ở mức tương đồng 0,71 thì cây phả hệ ựược chia thành 4 nhánh:
- Nhánh I gồm 10 mẫu giống: 26, 190, 183, 252, 300, 254, 192, 194, 257 và 269.
- Nhánh II gồm 6 mẫu giống: 196, 324, 261, 274, 264 và 299.
- Nhánh III gồm 3 mẫu giống: 201, 277 và 282.
- Nhánh IV gồm 7 mẫu giống: 27, 241, 186, 275, 293, 297 và 295
Các mẫu giống thuộc 4 nhóm này có mức tương đồng từ 0,47 đến 0,7 so với các mẫu giống thuộc nhóm cịn lại, do đó khi lai các mẫu giống thuộc các nhóm này với nhau thì con lai tạo ra có khả năng cho ưu thế lai caọ
Bảng 4.6. Hệ số tương ựồng di truyền giữa các mẫu giống cà chua nghiên cứu 26 27 183 186 190 192 194 196 201 234 241 252 254 7 25 261 264 269 274 275 7 27 282 293 295 297 299 300 26 27 183 186 190 192 194 196 201 234 241 252 254 7 25 261 264 269 274 275 7 27 282 293 295 297 299 300 26 1.00 27 0.50 1.00 183 0.86 0.50 1.00 186 0.50 0.86 0.50 1.00 190 0.93 0.43 0.93 0.43 1.00 192 0.71 0.41 0.71 0.46 0.79 1.00 194 0.71 0.41 0.71 0.46 0.79 0.90 1.00 196 0.57 0.50 0.57 0.46 0.64 0.57 0.57 1.00 201 0.56 0.57 0.46 0.43 0.43 0.50 0.50 0.46 1.00 234 0.71 0.50 0.71 0.50 0.64 0.57 0.57 0.86 0.41 1.00 241 0.57 0.93 0.57 0.93 0.50 0.49 0.49 0.43 0.50 0.57 1.00 252 0.93 0.43 0.93 0.43 0.86 0.79 0.79 0.64 0.43 0.79 0.50 1.00 254 0.93 0.43 0.93 0.43 0.86 0.79 0.79 0.64 0.43 0.79 0.50 0.92 1.00 257 0.71 0.41 0.71 0.46 0.79 0.86 0.86 0.57 0.46 0.57 0.49 0.79 0.79 1.00 261 0.57 0.46 0.57 0.41 0.64 0.71 0.71 0.86 0.50 0.71 0.49 0.64 0.64 0.57 1.00 264 0.57 0.46 0.57 0.41 0.64 0.71 0.71 0.86 0.50 0.71 0.49 0.64 0.64 0.57 0.92 1.00 269 0.64 0.49 0.64 0.49 0.71 0.79 0.79 0.64 0.43 0.50 0.41 0.71 0.71 0.93 0.64 0.64 1.00 274 0.64 0.43 0.64 0.49 0.71 0.79 0.79 0.79 0.57 0.64 0.46 0.71 0.71 0.64 0.93 0.93 0.71 1.00 275 0.50 0.86 0.50 0.93 0.43 0.46 0.46 0.46 0.43 0.50 0.93 0.43 0.43 0.46 0.41 0.41 0.49 0.49 1.00 277 0.50 0.43 0.50 0.49 0.57 0.64 0.64 0.50 0.86 0.46 0.46 0.57 0.57 0.50 0.64 0.64 0.57 0.71 0.49 1.00