Xác định CNTT là mũi nhọn trong quản lý hiện đại, do đó ngay từ khi thành lập Hải quan Đồng Nai đã ý thức thiết kế xây dựng trụ sở hiện đại và tập trung phát triển công tác tin học- thống kê, đầu tư trang thiết bị và đẩy mạnh ứng dụng CNTT.
Ngày 08/11/2006, Cục Hải quan Đồng Nai đã ban hành Quyết định số 658/QĐ-HQĐN quy định tạm thời về quản lý và triển khai CNTT tại Cục. Theo đó, kế hoạch xây dựng, triển khai và quản lý CNTT hàng năm đều được lập cụ thể, có phân cấp và giao việc đến từng đơn vị trực thuộc.
Đến nay cơ sở vật chất CNTT tại Cục Hải quan Đồng Nai được trang bị hiện đại với mạng LAN nội bộ kết nối và vận hànhổn định giữa 18 đơn vị trực thuộc. Đặc biệt với công nghệ kết nối Megawan và đường truyền Leased line, mạng WAN băng thông 512 Kb diện rộng vừa được nâng cấp lên 2 Mb thơng suốt giữa văn phịng Cục với các Chi cục và đường truyền Mega Wan đãđược nâng cấp lên 2 Mb kết nối với Tổng cục Hải quan, Kho bạc Nhà nước tỉnh Đồng Nai phục vụ đắc lực cho việc truyền nhận dữliệu, báo cáo theo quy định và triển khai thông quan điện tử tại Cục HQ Đồng Nai.
- Tại các Chi cục đều được trang bị hệ thống máy vi tính với 40 máy chủ, 330 máy trạm, 24 phần mềm được cài đặt và tự xây dựng đang vận hành ổn định, thực hiện hiệu quả công tác quản lý và đáp ứng cho công việc ứng dụng CNTT và hiện đại hoá hoạt động HQ.