Tự chủ trong quản lý và sử dụng tài sản được hiểu là cỏc trường cú trỏch nhiệm tăng cường quản lý, khai thỏc và nõng cao hiệu suất, hiệu quả sử dụng tài sản cho việc thực hiện sứ mạng, nhiệm vụ được giao, đồng thời gúp phần tạo ra nguồn thu cho nhà trường.
Cỏc trường thực hiện đầu tư mua sắm, quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước theo quy định của phỏp luật về quản lý tài sản nhà nước tại đơn vị sự nghiệp. Đối với tài sản cố định sử dụng vào hoạt động dịch vụ phải thực hiện trớch khấu hao thu hồi vốn theo quy định ỏp dụng cho cỏc doanh nghiệp nhà nước. Số tiền trớch khấu hao tài sản cố định và tiền thu từ thanh lý tài sản thuộc nguồn vốn ngõn sỏch Nhà nước, đơn vị được để lại bổ sung quỹ phỏt triển hoạt động sự nghiệp. Số tiền trớch khấu hao, tiền thu thanh lý tài sản thuộc nguồn vốn vay được dựng để trả nợ vay. Trường hợp đó trả đủ nợ vay, số cũn lại đơn vị được bổ sung Quỹ phỏt triển hoạt động sự nghiệp.
Trong cơ chế TCTC, Nhà nước cần giao cho cỏc trường quyền tự chủ mua sắm; sử dụng tài sản, đất đai để khai thỏc, mở rộng nguồn thu. Chẳng hạn như việc mua sắm; sử dụng tài sản, đất đai cú sẵn vào mục đớch sản xuất, kinh doanh dịch vụ, cho thuờ, liờn doanh, liờn kết trờn nguyờn tắc hoàn thành nhiệm vụ chớnh trị được giao, thực hiện đầy đủ nghĩa vụ tài chớnh với Nhà nước và phải bảo toàn, phỏt triển vốn, tài sản được giao quản lý, sử dụng. Khụng gũ bú việc mua sắm theo cỏc thủ tục hành chớnh; sử dụng tài sản, đất đai đỳng mục đớch, tiờu chuẩn, định mức, chế độ. Điều này sẽ nõng cao tớnh tiết kiệm, giảm tỡnh trạng lóng phớ.