UBCKNN - một cơ quan trực tiếp quản lý, giâm sát hoạt động chứng khoán và thị trường chứng khốn, mơ hình một Ủy ban (cấp Nhà nước) lại trực thuộc Bộ (Bộ Tài chính), nên khơng có đầy đủ các thẩm quyền, điều kiện và khả năng ban hành các văn bản pháp quy nhằm xử lý nhanh, nhạy các vấn đề phức tạp nảy sinh trong thực tiễn
Công tác giám sát được thực hiện dàn trải theo từng khu vực và đối tượng quản lý, chưa mang tính chất tập trung và chun mơn hóa, chưa có đơn vị thực hiện chức năng giám sát chuyên biệt. Sự phân mảng trong công tác giám sát và thiếu một cơ chế phối hợp giữa các đơn vị đã tạo ra sự cục bộ và không đảm bảo được tính tổng thể hoạt động giám sát TTCK.
Công tác giám sát của UBCK chủ yếu dựa trên những báo cáo định kỳ và bất thường của SGDCK, TTGDCK chứ chưa được thực hiện dựa trên những tiêu chí giám sát rõ ràng và khơng có sự hỗ trợ của hệ thống cơng nghệ thông tin giám sát tự động, dẫn đến tình trạng chỉ phát hiện được những vi phạm đơn giản, dễ thấy như vi phạm chế độ công bố thông tin, vi phạm quy chế giao dịch của SGDCK, TTGDCK mà chưa phát hiện một cách hiệu quả và kịp thời những vi phạm tinh vi hơn như giao dịch nội gián, thao túng giá cả và thị trường dựa trên việc theo dõi, phân tích và điều tra về những diễn biến giao dịch bất thường còn hạn chế.
Việc thanh tra và xử lý những vụ việc nghiêm trọng như giao dịch nội gián, thao túng thị trường chủ yếu xuất phát từ các khiếu kiện và khiếu nại. Các hệ thống giám sát tại các TTGDCK tuy có được lắp đặt nhưng ở mức độ thô sơ và vận hành thiếu hiệu quả, không cung cấp được những cảnh báo về giao dịch bất thường mà chỉ cung cấp được số liệu giao dịch đơn thuần;
Trên thực tế, nhiệm vụ phối hợp các hoạt động giám sát nhằm đảm bảo an