- Thứ nhất, cụng tỏc tổ chức hoạt động của ngõn hàng cũn thiếu hợp lý. Hiện tại, cỏc phũng ban tại chi nhỏnh được tổ chức dựa trờn cơ sở cỏc nghiệp vụ cơ bản như thanh toỏn xuất, kinh doanh ngoại tệ, cho vay…. Những trờn thực tế, giữa cỏc phũng ban lại chưa thực sự cú sự gắn kết chặt chẽ để trao đổi thụng tin cải thiện thiện hiệu quả hoạt động. Đơn cử một vớ dụ: khỏch hàng muốn thanh toỏn chứng từ hàng xuất khẩu tại Chi nhỏnh thỡ họ phải thực hiện tại phũng thanh toỏn xuất nhập khẩu; khi nhận được tiền thanh toỏn bằng ngoại tệ, muốn quy đổi về VNĐ họ phải thực hiện tại phũng kinh doanh quản lý kinh doanh ngoại tệ, vậy tức là khỏch hàng phải làm việc với ớt nhất hai phũng chức năng trong một lần xin tài trợ xuất khẩu. Gõy mất thời gian và cơ hội của khỏch hàng.
- Thứ hai là vấn đề nhõn lực của Chi nhỏnh. Trỡnh độ nghiệp vụ của cỏn bộ nhõn viờn làm cụng tỏc tài trợ xuất khẩu nhỡn chung là chưa đồng đều, cũn nhiều hạn chế, ớt nhõn viờn cú kinh nghiệm.
Thực tế hiện nay tại Chi nhỏnh, nhiều cỏn bộ làm cụng tỏc tài trợ xuất khẩu nhưng chưa qua đào tạo hoặc đào tạo chuyờn sõu, chưa đạt tiờu chuẩn về nghiệp vụ, ngoại ngữ hay luật phỏp quốc tế do vậy chưa thực sự đỏp ứng được nhu cầu cụng việc, cú thể dẫn đến những sai sút làm ảnh hưởng đến cả khỏch hàng và ngõn hàng.
- Thứ ba, cỏc nội dung quản lý rủi ro của ngõn hàng chưa hoàn chỉnh. Nội dung quản lý rủi ro bao gồm: xỏc định giới hạn tớn dụng đối với khỏch hàng, phõn chia thẩm
quyền quyết định tớn dụng… Trong thời gian qua, cỏc nội dung trờn đều đó được ỏp dụng nhưng cũn thiếu đồng bộ và chỉ ỏp dụng với một số nhúm khỏch hàng nhất định.
- Thứ tư là những hạn chế trong việc khai thỏc hệ thống thụng tin về khỏch hàng. Hiện nay thụng tin về khỏch hàng và thụng tin dựng để đỏnh giỏ, thẩm định dự ỏn tại Chi nhỏnh chủ yếu từ hồ sơ xin vay vốn và những hồ sơ khỏc do chớnh khỏch hàng cung cấp. Do đú, khụng thể trỏnh được những thụng tin sai lệch do khỏch hàng cố ý cung cấp hay những đỏnh giỏ chủ quan của cỏn bộ thẩm định. Hơn nữa, những số liệu trong dự ỏn để xuất của khỏch hàng thường khụng sỏt với thực tế và thiếu tớnh khoa học.
Hệ thống cụng nghệ thụng tin ngõn hàng hiện nay được trang bị tương đối đầy đủ, nhưng chưa được khai thỏc một cỏch triệt để. Phần lớn là do trỡnh độ của cỏn bộ nhõn viờn ngõn hàng. Nhõn viờn của ngõn hàng chưa làm chủ được cụng nghệ nờn sử dụng chưa hiệu quả.
- Thứ năm, cụng tỏc kiểm tra, kiểm toỏn nội bộ chưa được thực hiện nghiờm tỳc. Do đú chưa kịp thời phỏt hiện những sai sút để sửa chữa khắc phục hoặc rỳt kinh nghiệm kịp thời.
- Cuối cựng, chất lượng hoạt động của cỏc ngõn hàng đại lý cũn hạn chế. Việc giao dịch giữa cỏc ngõn hàng đại lý và NHNT Hà Nội chưa được quan tõm đỳng mức. Việc đỏnh giỏ chất lượng, uy tớn của cỏc ngõn hàng liờn kết cũn thiếu chớnh xỏc làm ảnh hưởng đến quyền lợi khỏch hàng. NHNT cũn thiếu sự liờn kết với ngõn hàng nhiều nước trờn thế giới làm mất thời gian khi cú dao dịch do phải thụng qua ngõn hàng của một nước thứ ba. Cỏc hoạt động hỗ trợ xuất nhập khẩu cũn hạn chế, chỉ tập trung vào việc chuyển tiếp cỏc thụng tin giữa NHNT Hà Nội với cỏc ngõn hàng nước ngoài. Chưa cập nhật được thụng tin để đỏnh giỏ, phõn loại chớnh xỏc cỏc ngõn hàng nước ngoài để đưa ra chớnh sỏch đối xử với từng ngõn hàng cụ thể.