Tuy nhiờn cú một vấn đề khú khăn cho cụng tỏc thu gom, vận chuyển rỏc thải là việc tỡm cỏc điểm thu thập rỏc từ cỏc xe gom lờn xe chở rỏc. Do phương tiện của ta cũn lạc hậu nờn trong quỏ trỡnh cẩu rỏc thường cú tiếng ồn lớn của động cơ xe, cỏc mựi khú chịu từ rỏc bốc ra và việc rơi
vãi rỏc, chảy nước rỏc ra đường trong quỏ trỡnh nõng cẩu. Do đú người dõn thường phản đối việc đặt cỏc điểm cẩu rỏc gần nhà họ. Điều này khiến cho việc lựa chọn cỏc điểm cẩu rỏc thường khụng tuõn thủ cỏc nguyờn tắc đặt ra mà thường được tiến hành ở bất cứ nơi nào cú thể được thậm chớ ngay tại cỏc vườn hoa hoặc cỏc điểm nhạy cảm với mụi trường.
Nhiều năm trước đõy rỏc thải của thành phố hàng ngày được Cụng ty Mụi trường Đụ thị thu gom và vận chuyển tới cỏc bãi chụn lấp như Thuỵ Phương, Tõy Mỗ. Hiện nay do bãi chụn lấp Tõy Mỗ đã đúng bãi nờn rỏc của thành phố Hà Nội sẽ vận chuyển lờn bãi Nam Sơn.
Vận chuyển lờn bãi Nam Sơn được chia làm 2 phương ỏn :
* Phương ỏn 1 : Toàn bộ chất thải được chuyển thẳng lờn khu liờn hiệp xử lý chất thải rắn Nam Sơn.
Theo phương ỏn này cụng ty xin được đầu tư thờm xe, lỏi, phụ xe cựng với phương tiện hiện cú của cụng ty đảm bảo đủ phương tiện vận chuyển. Tất cả rỏc thu gom được đi thẳng từ nội thành đi Nam Sơn.
Tuyến vận chuyển : cú 2 tuyến.
- Tuyến 1 : Nội thành - Cầu Thăng Long - Nam Sơn : 61km.- Tuyến 2 : Nội thành - Cầu Chương Dương - Nam Sơn : 59 km.