CHƢƠNG 4 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.6. Nhận diện dịng vi khuẩn có khả năng phân giải lipid
4.6.1. Kết quả điện di sản phẩm PCR
Hình 11: Phổ điện di sản phẩm PCR đƣợc nhân lên từ đoạn gen 16S rDNA của 3 dòng vi khuẩn cần nhận diện
(Giếng (1): thang chuẩn 100bp plus, (2): dòng AL1, (3): dòng MT8, (4): dòng MT9, (5): đối chứng âm)
Hình 10 trình bày kết quả điện di sản phẩm PCR khuếch đại trình tự gen 16S rDNA của 3 dòng vi khuẩn cần nhận diện. Qua phổ điện di cho thấy sản phẩm PCR có chiều dài khoảng 1500bp và khơng có các sản phẩm phụ.
4.6.2 Kết quả giải trình tự và nhận diện vi khuẩn
Kết quả giải trình tự của 3 dịng vi khuẩn có khả năng phân giải lipid được trình bày ở phụ lục 3. Chiều dài đoạn gen 16S rDNA được giải trình tự của các dòng vi khuẩn nhận diện được trình bày ở bảng sau:
Bảng 8: Kích thƣớc đoạn gen 16S rDNA đƣợc giải trình tự của 3 dịng vi khuẩn có khả năng phân giải lipid
Kí hiệu Chiều dài đoạn gen 16S rDNA được giải
trình tự Dòng AL1 Dòng MT8 Dòng MT9 1384 nucleotide 1418 nucleotide 1375 nucleotide 1.500 bp 1 2 3 4 4 5
32
Kết quả BLAST N của dòng AL1 trên cơ sở dữ liệu NCBI:
Dịng AL1 có trình tự 16S rDNA tương đồng 99% với trình tự của các dịng
Acinetobacter baumannii (KF055001 và JN162444)
Kết quả BLAST N của dòng MT8 trên cơ sở dữ liệu NCBI:
Dịng MT8 có trình tự 16S rDNA tương đồng 99% với trình tự của các dòng
Bacillus cereus và Bacillus thuringiensis (GU122949 và JX010983)
33
Dịng MT9 có trình tự 16S rDNA tương đồng 99% với trình tự của các dịng
Acinetobacter bereziniate (JX035952 và HE651922)
Như vậy, qua BLAST N trên cơ sở dữ liệu NCBI có thể tạm khẳng định các dòng vi khuẩn phân giải lipid phân lập được là những dòng Acinetobacter sp. và Bacillus sp..
Theo Sugimori và Utsue (2012), Acinetobacter là vi khuẩn gram âm, hiếu khí, tế bào dạng cầu (spheroid) có đường kính là 0.8 – 0.9 µm, ít di động; có khuẩn lạc màu kem. Hai dịng vi khuẩn AL1 và MT9 phân lập có đặc điểm phù hợp với những mô tả của nghiên cứu trên.
Theo Nur Hidayat (2011), Bacillus cereus N-09 là một vi khuẩn có khả năng
phân giải lipid, được phân lập ở đường ống thoát nước của các nhà hàng. Bacillus cereus có vi khuẩn dạng que, có kích thước lớn so vi vi khun khỏc, 1ì 3-4 àm, gram dương và hình thành nội bào tử (theo microbewiki.kenyon.edu). Các đặc điểm cũng như nguồn gốc phân lập được rất tương đồng với dòng MT8.