Trình tự các bước như sau:
Nguồn nước dùng nuôi cấy vi sinh có thể sử dụng nước sạch hay tận dụng nguồn nước thải sẵn có nhưng tải lượng chất hữu cơ không nên quá cao (>100kg BOD/mẻ).
Cung cấp khí vào bể để duy trì sự sống cho vi sinh vật.
Theo dõi và phân tích các chỉ tiêu cần thiết: pH, DO, SV, SVI.
Tăng dần tải trọng hữu cơ đến mức thích hợp (350 – 400 kgBOD/mẻ) thì giai đoạn khởi động kết thúc, quá trình vận hành đi vào ổn định.
Trong giai đoạn khởi động, thông số DO thường dao động rất lớn (1,5 – 8 mgO2/l), tạo nhiều bọt trắng khó tan. Cần liên tục vớt bỏ bọt nổi trên bềmặt bể SBR.
Để đánh giá hoạt động của hệ thống cần phải theo dõi chặt chẽ hoạt động phân hủy vi sinh trong các bể phản ứng. Việc đánh giá, xác định trạng thái ổn định và tối ưu chỉ có thể đạt được trên cơ sở:
Hiểu biết về các thiết bị kỹ thuật. Hiểu biết về quá trình bể SBR
Theo dõi và phân tích thường xuyên các đặc tính của nước thải, trạng thái hoạt động của bể, các thông số của quá trình. Các kết quả theo dõi biến thiên theo thời gian được thể hiện trên đồ thị.
Ghi chép các thông số để rút ra kinh nghiệm.
Cần có sự quan sát các thông số vật lý như độ mùi, độ màu, độ đục, lớp bọt trong bể cũng như dòng chảy. Tần số quan sát là hằng ngày.
Trong bể SBR, quá trình phân hủy của vi sinh vật phụ thuộc vào các điều kiện sau: pH của nước thải, nhiệt độ, chất dinh dưỡng, nồng độ bùn và tính đồng nhất của nước thải. Do đó cần phải theo dõi các thông số này.
Thông thường, giai đoạn khởi động sẽ kết thúc sau một tháng vận hành.