3.1 Kết quả nghiên cứu in silico họ gen OsNHX
3.1.3.2 Sự biểu hiện các gen thuộc họ OsNHX trong điều kiện stress
Phân tích sự biểu hiện các gen OsNHX1, OsNHX2, OsNHX3, OsNHX5 bằng công cụ http://signal.salk.edu/cgi-bin/RiceGE trong điều kiện mặn. Các nhóm mẫu đƣợc tiến
hành phân tích bao gồm: GSE4438 và GSE3053. Gen OsNHX1 đƣợc phân tích in silico
với probe ID: Os.4700.1.S1_at. Các gen OsNHX2, OsNHX3 và OsNHX5 có ID lần lƣợt là:Os.14813.1.S1_at;Os.27479.1.S1_at và Os.5237.1.S1_at.
Phân tích dữ liệu in silico các gen OsNHX1, OsNHX2 và OsNHX5 chúng tôi nhận thấy ở giai đoạn sinh trƣởng, sự khác biệt về biểu hiện gen giữa nhóm đối chứng và nhóm xử lú mặn là tƣơng đối nhỏ. Trong khi ở giai đoạn sinh sản mức độ biểu hiện giữa 2 nhóm này là khá rõ nét. Điều này chứng tỏ mặn ảnh hƣởng khá mạnh mẽ đến giai đoạn sinh sản của cây lúa (Hình 3.14). Ở giai đoạn sinh sản, kết quả phân tích cũng ghi nhận các gen OsNHX2 và OsNHX3 đều biểu hiện khá mạnh mẽ của trên giống FL478 (chịu mặn), nhƣng lại biểu hiện khác nhau ở giống lúa mẫn cảm mặn IR29 (Hình 3.14 và 3.15).
Hình 3.15 Sự biểu hiện gen OsNHX3 (c) và OsNHX5 (d) trong điều kiện stress mặn
(Đƣợc phân tích in silico từ nguồn http://signal.salk.edu/cgi-bin/RiceGE )
Mặc dù IR29 là giống lúa nhạy cảm với stress mặn nhƣng các gen OsNHX2 và OsNHX5 là cho thấy mức độ biểu hiện khá cao ở giống này. Điều này cho thấy ngoài khả
năng chống chịu mặn chúng có thể thực hiện các chức năng trao đổi chất và sinh trƣởng ở khác ở cây lúa. Trong 4 gen đƣợc phân tích, có thể nhận thấy ở điều kiện stress mặn gen
OsNHX5 biểu hiện ở mức độ thấp hơn những gen khác và gen OsNHX1 biểu hiện mạnh