Giám đốc đơn vị được kiểm toán chịu trách nhiệm lập, trình bày trung thực, hợp lý báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành theo đúng chuẩn mực kế toán, chế độ kế toán, quy định hiện hành về quyết toán vốn đầu tư và các quy định pháp lý có liên quan.
Giám đốc đơn vị được kiểm toán có trách nhiệm chuẩn bị và cung cấp đầy đủ hồ sơ báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành thoe quy định hiện hành, các tài liệu có liên quan khác kể cả biên bản kiểm tra, thanh tra (nếu có) cho KTV để thực hiện kiểm toán và chịu trách nhiệm về sự trung thực, chính xác, kịp thời đối với các hồ sơ, tài liệu đã cung cấp cho KTV
Trường hợp đơn vị được kiểm toán chưa chuẩn bị đầy đủ hồ sơ báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành thì được thuê kiểm toán viên cung cấp dịch vụ “Tư vấn hoàn thiện hồ sơ báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành” như một hợp đồng riêng, ngoại trừ các dự án thuộc nguồn vốn ngân sách, KTV và Công ty vốn đầu tư hoàn thành thì khác được tiếp tục cung cấp dịch vụ kiểm toán báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành
KTV và Công ty kiểm toán chịu trách nhiệm kiểm toán báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành, hồ sơ quyết toán vốn đầu tư và trình bày ý kiến của mình về kết quả kiểm toán báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành.
Việc kiểm toán báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành không làm giảm nhẹ trách nhiệm của Giám đốc (người đứng đầu) đơn vị được kiểm toán đối với báo cáo quyết toán vốn đầu tư hoàn thành.