Bên cạnh đó vẫn còn những hạn chế mà Chi nhánh gặp phải như:
Thứ nhất, số lượng thẻ không hoạt động của chi nhánh qua các năm đã được cải thiện nhưng vẫn còn cao.
Ta có thể thấy từ biểu đồ 2.5 tỷ lệ thẻ không hoạt động/ số lượng thẻ phát hành là một con số lớn. Đặc biệt năm 2014 quá nữa số thẻ phát hành ra không hoạt động đó là kết quá tất yếu của việc đẩy mạnh doanh số thẻ phát hành mà không xét đến nhu cầu thực của khách hàng.Mặc dù, trong những năm sau, ban lãnh đạo ngân hàng đã có những biện pháp khắc phục, điều chỉnh lại chiến lược kinh doanh tập trung phát hành thẻ hướng tới các đối
tượng thực có nhu cầu, làm giảm mạnh số thẻ không hoạt động của ngân hàng, tiết kiệm tối đa chi phí phát hành thẻ. Tuy nhiên, số lượng thẻ không hoạt động vẫn còn là một vấn đề mà vẫn cần được ban lãnh đạo cần quan tâm vì số lượng của thẻ không hoạt động vẫn là một con số lớn.
Thứ hai, doanh số thẻ phát hành hàng năm đều tăng nhưng vẫn còn thấp, đặc biệt thẻ tín dụng so với quy mô của chi nhánh, cũng như địa bàn chi nhánh hoạt động.
Agribank chi nhánh Sở Giao Dịch là một đơn vị lớn, với quy mô hoạt động, cũng như uy tín của một đơn vị nhiều năm đứng trong top đầu những đơn vị hoạt động khinh doanh hiệu quả của Agribank Việt Nam. Tuy nhiên, với kinh nghiệm là đơn vị hoạt động lâu năm....Điều này cũng không giúp Agribank CN Sở Giao Dịch hoạt động hiệu quả hơn nữa trong việc nâng cao doanh số thẻ phát hành của chi nhánh đặc biệt thẻ tín dụng, thẻ phải có tiện ích đa dạng phù hợp với nhu cầu và mong muốn của khách hàng, hoạt động tại địa bàn Hà Nội, nơi nhu cầu của khách khàng đối với thẻ tín dụng vô cùng lớn. Đó là một lợi thế cũng là thách thức to lớn, chi nhánh có thị trường rộng lớn để phát triển dịch vụ thẻ nhưng cùng với đó là sự cạch tranh khốc liệt từ các ngân hàng khác. Trong những năm qua, với nỗ lực của chi nhánh số lượng thẻ phát hành đều tăng. Tuy nhiên, mức tăng còn chậm, điều này cần ban lãnh đạo ngân hàng cùng đội ngũ cán bộ thẻ phải tập trung nỗ lực hơn nữa để nâng cao thành tích.
Thứ ba, doanh thu từ hoạt động kinh doanh về thẻ chưa tương xứng với quy mô về thẻ của Agribank chi nhánh Sở Giao Dịch.
Nguồn thu chính từ hoạt động kinh doanh thẻ của chi nhánh đều từ thu phí in sao kê, phí phát hành thẻ, phí thường niên, phí cấp lại thẻ, lãi từ thẻ tín dụng, phí phạt chậm trả, chênh lệch lãi khi ngân hàng huy động được tiền gửi không kỳ hạn từ số dư trên tài khoản của khách hàng. Tuy nhiên, trong những thẻ đã phát hành của chi nhánh vẫn có nhiều thẻ của chi nhánh phát
hành ra nhưng khách hàng không sử dụng, sử dụng ít, hoặc do thói quen giữ tiền mặt, nhiều khách hàng chỉ để số dư trên tài khoản ở mức tối thiểu theo quy định của ngân hàng... Do vậy doanh thu của ngân hàng cũng bị ảnh hưởng không nhỏ.