Thành phố Hng Yên chủ trơng tổ chơng tổ chức 2 khu công nghiệp, ở phía Bắc xã Bảo Khê khoảng 100 ha kết hợp với khu công nghiệp của huyện Kim Động; khu công nghiệp Trung Nghĩa bám theo quốc lộ 38 khoảng 200 ha, kết hợp với khu công nghiệp của huyện Tiên Lữ. Ngoài ra tổ chức các làng nghề và khu tiểu thủ công nghiệp [72]. Nhng thực tế hiện nay cha có khu công nghiệp nào trên địa bàn thành phố Hng Yên chính thức đi vào hoạt động. Các cơ sở sản xuất công nghiệp vẫn tồn tại xen kẽ trong khu đất dân dụng đô thị. Có các khu vực tập trung nhiều cơ sở sản xuất công nghiệp là:
Phía Tây phờng An Tảo, khu vực nằm giữa đờng Nguyễn Văn Linh và sông Điện Biên có các cơ sở sản xuất công nghiệp nh : nhà máy cơ khí nông nghiệp, liên doanh mút xốp Việt - Nhật, công ty lơng thực, công ty xây dựng, công ty đay, công ty may II, công ty thực phẩm xuất khẩu Hng Yên...
Phía Tây phờng Lê Lợi, khu vực phía Bắc Đờng Bạch Đằng có các cơ sở sản xuất công nghiệp nh : công ty xây lắp, công ty cơ khí dệt may 1/5, công ty chế biến nông sản, công ty may Hng Yên, hợp tác xã tháng 8 - công ty nhựa, công ty lơng thực...
Tuy các cơ sở sản xuất công nghiệp trên chủ yếu là công nghiệp nhẹ và sạch, thu hút đợc một lợng lớn lao động nhng do nằm sát khu dân c nên có ảnh hởng tiêu cực tới môi trờng đô thị. Ngoài ra trên địa bàn thành phố còn có nhiều cơ sở tiểu thủ công nghiệp quy mô nhỏ nằm rải rác trong các thôn xóm, đờng phố. Trong thời gian tới cần nhanh chóng tập trung các cơ sở sản xuất này vào khu công nghiệp để tạo điều kiện thuận lợi cho phát triển sản xuất và bảo vệ môi trờng.