Dữ liệu phát thải của các công trình nhiệt điện than theo các kịch bản đề xuất đã được sử dụng là đầu vào cho nhóm chuyên gia quốc tế chạy mô hình GEOS-Chem. Kết quả chạy mô hình lần một được nhóm chuyên gia Việt Nam tổng hợp và phân tích để xây dựng bản thảo số 1. Bản thảo số 1 đã được nhóm nghiên cứu trình bày và lấy ý kiến góp ý của các chuyên gia đầu ngành trong lĩnh vực nghiên cứu về ô nhiễm không khí và đánh giá tác động của ONKK tới sức khỏe tại hội thảo tham vấn tháng 12/2019. Các chuyên gia phản biện và các chuyên gia tham dự hội thảo cho rằng kết quả ban đầu từ nghiên cứu có sự chênh lệch lớn và quá khác biệt so với kết quả nghiên cứu [4] của nhóm tác giả Havard áp dụng cùng phương pháp đã công bố. Các chuyên gia góp ý cần rà soát lại kết quả chạy mô hình hóa. Tiếp thu góp ý của các chuyên gia Việt Nam tại Hội thảo tham vấn trên, nhóm chuyên gia Harvard đã kiểm tra lại các mô phỏng và tìm thấy lỗi trong khi chạy mô hình lần một, cụ thể như sau:
(i) Phát thải SO2 và NOx từ các nhà máy điện than ở Việt Nam không được đưa vào mô hình một cách chính xác. Số liệu kiểm kê phát thải nhân tạo khu vực châu Á MIX đã được tính đến trong các mô phỏng ban đầu. Do cách xử lý kiểm kê khu vực trong thành phần phát thải HEMCO của GEOS-Chem, MIX đã ghi đè lên lượng phát thải NOx và SO2 cho
cả phát thải nhân tạo toàn cầu CEDS và phát thải than Việt Nam được thêm vào trong công trình này. Kiểm kê MIX (có sẵn cho năm 2008 và 2010) đã bị loại ra vì CEDS có sẵn trong những năm gần đây (đến năm 2014) và kết hợp kiểm kê khu vực MEIC với kiểm kê của Trung Quốc và REAS 2.1 so với phần còn lại của châu Á. Trong các mô phỏng cuối cùng, MIX đã bị loại ra để chúng tôi thu được khí thải NOx và SO2 từ CEDS trên toàn cầu và từ các kịch bản phát thải của nhà máy nhiệt điện than Việt Nam.
(ii) Cũng có những vấn đề trong các điều kiện biên được sử dụng trong nguyên bản độ phân giải cao chạy qua Việt Nam. Các điều kiện biên không hoàn toàn bao gồm toàn bộ khu vực. Các tệp điều kiện biên đã được xử lý lại cho các lần chạy sau để bao phủ đúng vùng. Các mô phỏng mô hình được thực hiện một cách không chính xác; điều này hoàn toàn không liên quan đến các yếu tố đầu vào phát thải mà là cách mà miền toàn cầu và miền Việt Nam được liên kết trong mô hình. Những lỗi này làm mất hiệu lực các kết quả đầu tiên và đồng nghĩa là những kết quả đó không làm cơ sở ý nghĩa để phân tích.
Kết quả chạy mô hình sau khi cập nhật và chỉnh sửa các lỗi trên đã được nhóm nghiên cứu trong nước sử dụng phân tích và cho ra kết quả cuối cùng của nghiên cứu được trình bày kỹ trong phần 4 của báo cáo này.
Kết quả nghiên cứu gồm hai phần chính: