+ Khí hậu chia 2 mùa rõ rệt. Mùa nóng từ tháng 5 tới tháng 9 có nhiệt độ bình quân 20-250C. Mưa to thường tập trung vào mùa nóng, độ ẩm mùa nóng trung bình 80-85%. Mùa lạnh từ tháng 10 tới tháng 4 năm sau: trong mùa lạnh nhiệt độ thường thấp hơn 200C. Trong các đợt rét nhiệt độ thường xuống dưới 130C và cá biệt có khi xuống tới 3-50C. Trong mùa lạnh không khô, độ ẩm khá cao, thường 70-80% và nhiều ngày có sương mù, ẩm ướt.
+ Khu BTTN có lượng mưa trung bình 1.700-2.000 mm.
Mùa mưa thường gây ra ngập úng cục bộ trong thời gian ngắn ở các thung, khe hoặc quanh các lỗ hút xuống sông suối ngầm. Mùa lạnh, các khe suối thường cạn kiệt, đôi chỗ cịn các đám sình lầy, nước ngọt chủ yếu còn trong các mỏ.
+ Sương mù: Tháng 1 và 2 thường có sương mù.
+ Sương muối: Thơng thường khơng có sương muối trong năm, nhưng đơi khi có nhẹ khơng gây hại.
+ Gió: Hướng gió thịnh hành của khu BTTN là Đông Bắc, Đông Nam. Hàng năm và các tháng 4-8 đơi khi có gió tây khơ nóng xuất hiện mỗi đợt 2- 4
23
+ Mưa đá: Tần suất xuất hiện mưa đá rất nhỏ.
+ Thuỷ văn: Trong khu BTTN khơng có sơng, khơng có suối lớn. Đáng chú ý là hệ thống các suối nhỏ bắt nguồn, đón nước từ dãy núi ranh giới với Thanh Hố đổ xuống vùng trung tâm. Các suối kể trên có đoạn lộ, đoạn mất, khơng thường xun có nước quanh năm. Mật độ suối thấp, tuy độ dốc lớn nhưng có nhiều hút nước, sơng ngầm, hang động vùng đá vơi nên chỉ có lũ cục bộ trong những ngày mưa lớn và rất ít nước vào mùa khơ.
Tóm lại, khu BTTN Xuân Nha là vùng núi cao của huyện Mộc Châu, có khí hậu nhiệt đới gió mùa, có hai mùa trong năm, mùa nóng nhiệt độ cao và mưa nhiều, mùa đơng có nhiệt độ thấp, lạnh nhẹ và hơi khơ, riêng mùa đơng lại có sương mù nên ít gây cản trở tới sinh trưởng và phát triển của cây.