Kết quả phân tích thành phần ch

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) ứng dụng kỹ thuật metagenomics trong nghiên cứu hệ vi sinh vật vùng rễ cây dó bầu tại một số tỉnh của việt nam​ (Trang 44 - 45)

C) Loại đất PQ Phú Quốc,

3.6. Kết quả phân tích thành phần ch

Tiếp theo, ở mức độ chi, chúng tôi xác định đƣợc 21 chi trên toàn bộ dữ liệu phân tích, các nhóm có tỉ lệ phần trăm thấp hơn 0,1% đƣợc phân vào nhóm Khác nhau, các trình tự còn lại đƣợc xếp nhóm Không phân loại (Hình 3.6).

Luận văn Thạc sĩ Hồ Mạnh Tường

Từ biểu đồ hình 3.7 cho thấy, mặc dù số lƣợng các trình tự đƣợc phân loại ở mức độ chi của mẫu Nha Trang là rất lớn, nhƣng các trình tự này đƣợc tập trung chủ yếu ở các chi edaphobacter, planctomyces, bradyrhizobium, devosia, rhodoplanes, mesorhizobium, và telmatospirillum. Tƣơng tự với mẫu Phú Quốc, với các trình tự có thể phân loại ở mức độ chi, hầu hết tập trung ở các chi: candidatus solibacter, bradyrhizobium, và rhodoplanes. Trong khi đó, ở mẫu Tuyên Quang, mặc dù số lƣợng trình tự đƣợc phân loại thấp hơn, nhƣng các trình tự có sự đa dạng khá cao và phân bố đồng đều ở 16 chi.

Đặc điểm nổi bật của kết quả phân tích này đó là sự khác nhau về số lƣợng của các trình tự đƣợc phân loại và không đƣợc phân loại ở mức độ chi của 3 mẫu nghiên cứu. Cụ thể, Mẫu Nha Trang có số lƣợng trình tự lớn nhất, tuy nhiên toàn bộ 100% đã đƣợc phân loại tới mức độ chi. Trong khi đó, hai mẫu Phú Quốc và Tuyên Quang, mặc dù có số lƣợng trình tự thấp hơn, nhƣng đã cho thấy sự phong phú rõ rệt về dữ liệu, hầu nhƣ toàn bộ các trình tự đều thuộc các chi mới chƣa có trong ngân hàng cơ sở dữ liệu SILVA, cụ thể là 85% và 92% tƣơng ứng.

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) ứng dụng kỹ thuật metagenomics trong nghiên cứu hệ vi sinh vật vùng rễ cây dó bầu tại một số tỉnh của việt nam​ (Trang 44 - 45)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(62 trang)