Thứ nhất, vốn đầu tư.
Vốn đầu tư bao gồm các loại chi phí cho R&D, phí thi công, xây dựng dự án và chi phí cho các trang thiết bị. Chi phí cho mục này đã được liệt kê và tính toán cụ thể trong phần trước.
Thứ hai, chi phí ô nhiễm môi trường.
Mặc dù việc xây dựng tuyến đường sắt cao tốc được đánh giá chung rằng có tác động tích cực tới môi trường thông qua việc chuyển đổi phương thức vận tải hành khách sang đường sắt cao tốc qua đó giảm được lượng khí thải nhà kính, tuy nhiên trong quá trình thi công và vận hành, dự án vẫn mang theo rủi ro về ô nhiễm môi trường, bao gồm ô nhiễm không khí, ô nhiễm nước, tạo ra trầm tích đáy, ô nhiễm đất, tạo ra chất thải, tiếng ồn và độ rung.
Về ô nhiễm không khí: Trong quá trình xây dựng, sẽ có một số tiêu cực do vận hành nhiều máy móc và phương tiện.Tác động do bụi từ hoạt động đào đắp đất vào mùa khô, mặc dù các tác động này chỉ tạm thời và ở mức hạn chế. Khi tuyến sắt cao tốc được đi vào hoạt động, ô nhiễm không khí do khí thải từ các phương tiện được dự kiến sẽ giảm do chuyển đổi phương thức vận tải nhưng cũng có thể các chất gây ô nhiễm không khí tăng lên từ phương tiện quanh nhà ga như xe con và xe khách.
Về ô nhiễm nước: Trong quá trình xây dựng, nước bị đục do công tác đào đắp đất và xây trụ cầu, nước thải từ các trại lán của công nhân khu vực công trường sẽ gây ô nhiễm sông ngòi xung quanh ở một mức độ nhất định. Khi đưa vào khai thác, sẽ phát sinh nước thải sinh hoạt từ hành khách tại ga và nước thải từ hoạt động bảo dưỡng tại xí nghiệp bảo dưỡng và sửa chữa.
Về ô nhiễm trầm tích đáy: Trong cả quá trình xây dựng và vận hành, một số loại vật liệu xây dựng như xi măng và cát, hay các chất cặn tích tụ trong nước thải từ hoạt động bảo dưỡng gây ảnh hưởng đến lớp trầm tích đáy tuy nhiên cũng chỉ tác động ở quy mô nhỏ.
Về ô nhiễm đất: Chất ô nhiễm sẽ tích tụ từ vật liệu và phương tiện xây dựng nhưng tác động chỉ ở quy mô nhỏ.
Về ô nhiễm chất thải: Trong quá trình xây dựng, chất thải từ việc xây dựng và phá hủy công trình trong đó có thể bao gồm cả vật liệu nguy hại, chất thải sinh hoạt của công nhân xây dựng từ công trường xây dựng thải ra được dự đoán sẽ tăng. Sau khi đưa vào sử dụng tuyến đường sắt tốc độ cao, chất thải có thể được phát sinh từ hành khách từ nhà ga và các hoạt động bảo trì, bảo dưỡng định kỳ.
Về ô nhiễm tiếng ồn và độ rung: Mức tiếng ồn và độ rung tăng lên tạm thời do hoạt động của các thiết bị và phương tiện trọng tải lớn gây ra, mặc dù chỉ tạm thời. Tuy nhiên, sẽ có một số tác động đến dân cư và công trình cần sự yên tĩnh ví dụ như trường học và bệnh viện nằm gần công trường xây dựng. Sau khi đưa vào sử dụng, sẽ có tiếng ồn và rung chấn do hoạt động chạy tàu cao tốc gây ra cũng như một số tác động khác đối với dân cư và công trình cần sự yên tĩnh như trường học và bệnh viện nằm dọc tuyến đường sắt cao tốc. Ngoài ra, bảo trì đường nền đá ba lát cũng gây ra tiếng ồn.
Về môi trường tự nhiên: Dự báo hoạt động của dự án không có tác động đáng kể đến thực vật, động vật và hệ sinh thái. Tuy nhiên, nên tiến hành nghiên cứu chi tiết trước khi xây dựng và thực hiện bảo tồn và giữ gìn cây xanh tối đa.
Thứ ba, ảnh hưởng tiêu cực tới môi trường xã hội.
Ngoài các vấn đề về ô nhiễm môi trường tự nhiên thì việc thi công và vận hành dự án cũng có những tác động đáng kể tới môi trường xã hội của khu vực xung quanh. Cụ thể:
Về vấn đề tái định cư bắt buộc và thu hồi đất: Sẽ cần tới khoảng 1.100ha đất để xây dựng các công trình đường sắt cao tốc (cầu cạn, nhà ga, xí nghiệp bảo dưỡng và sửa chữa, v.v.) trên đoạn này. Ngoài ra, khoảng 1.300 công trình nhà cửa và 4.400 hộ gia đình sẽ bị ảnh hưởng từ việc giải phóng mặt bằng hay tái định cư, mặc dù hướng tuyến đã được quy hoạch sao cho giảm thiểu yêu cầu giải phóng mặt bằng và tái định cư trên cơ sở phân tích so sánh các phương án. Hoạt động giải phóng mặt bằng và tái định cư sẽ tiếp diễn kể cả trong giai đoạn xây dựng. Cũng cần phải di dời tạm thời để bố trí công trường, khu lán trại công nhân phục vụ xây dựng.
Về kinh tế địa phương (việc làm và sinh kế): Trong quá trình xây dựng, có thể có tác động tiêu cực tới kinh tế và cách kiếm sống ở địa phương do mất cơ hội việc làm, mất nguồn thu nhập vì giải phóng mặt bằng và tái định cư. Tuy nhiên, có thể có một số tác động tích cực tới kinh tế địa phương do tăng cơ hội kinh doanh/việc làm liên quan tới dự án đường sắt cao tốc, nhất là quanh khu vực nhà ga, và cơ hội việc cho công nhân bảo dưỡng đường. Dù vậy sau khi đã kết thúc các hoạt động xây dựng cũng sẽ hết cơ hội có việc làm tạm thời cho lao động địa phương.
Về cơ sở hạ tầng và dịch vụ xã hội: Giải phóng mặt bằng và tái định cư có thể gây ra một số tác động tới cơ sở hạ tầng và dịch vụ xã hội như phải di dời các công trình sinh hoạt cộng đồng (nhà văn hóa làng, xã v.v.) Trong quá trình xây dựng, mặc dù chỉ ở quy mô tạm thời, nhưng việc bố trí công trường và khu lán trại công nhân sẽ gây tác động tới cơ sở hạ tầng và dịch vụ xã hội. Cụ thể, sẽ có tác động tới cơ sở hạ tầng và dịch vụ xã hội do có cản trở hay làm gián đoạn việc sử dụng các khu vực này vì có các hoạt động xây dựng ở đây, ví dụ như phải di dời các công trình công ích hay đường thôn xã. . Sau khi đưa vào hoạt động, việc phát triển ga đường sắt cao tốc và khu vực xung quanh sẽ cải
thiện cơ sở hạ tầng và dịch vụ xã hội ở khu vực này và trên cả nước. Mặt khác, cũng có một số tác động tới cơ sở hạ tầng và dịch vụ xã hội do sự hiện diện của kết cấu đường sắt cao tốc.
Về điều kiện làm việc (bao gồm an toàn lao động): Tác động tiêu cực đến sức khỏe và an toàn của công nhân trong giai đoạn xây dựng và lái xe trong giai đoạn vận hành có thể xảy ra nếu không có các giải pháp thích đáng đảm bảo sức khỏe và an toàn lao động.
Về sức khỏe cộng đồng: Tác động tiêu cực đến sức khỏe cộng đồng trong giai đoạn xây dựng và vận hành có thể xảy ra nếu không có các giải pháp thích đáng giảm tác động môi trường (bụi, khí thải).