Những năm qua, thành phố đã tập trung củng cố, đổi mới, nâng cao và phát triển các hình thức tổ chức sản xuất trong nông nghiệp. Cùng với phát triển mạnh kinh tế hộ, tăng cường chức năng quản lý Nhà nước của chính quyền cấp xã trong nông nghiệp, nông thôn, củng cố và chuyển đổi hoạt động của Hợp tác xã theo Luật Hợp tác xã năm 2012. Đến nay, toàn thành phố có 7 Hợp tác xã Dịch vụ nông nghiệp đã chuyển đổi và đang hoạt động hiệu quả theo Luật Hợp tác xã năm 2012, tổng số thành viên HTX là 129 người, trung bình 18,4 thành viên/HTX. Doanh thu từ các hoạt động sản xuất, kinh doanh của các Hợp tác xã nông nghiệp bình quân đạt 1056 tỷ đồng, thu nhập bình quân của người lao động làm việc thường xuyên trong HTX là 5,0 triệu đồng/người/tháng. Các Hợp tác xã Dịch vụ nông nghiệp hoạt động khá, tốt, (03 HTX hoạt động tốt, chiếm 42,86%; 03 HTX hoạt động khá, chiếm 42,86%; 01 HTX thành lập mới chưa đủ điều kiện đánh giá xếp loại) điển hình như Hợp tác xã nông nghiệp Quảng Minh, HTX nông nghiệp Quảng Hùng, HTX Nông nghiệp và VSMT Quảng Đại, HTX nông nghiệp Quảng Vinh. Các HTX nông nghiệp đã giải quyết việc làm cho 131 lao động, góp phần ổn định và phát triển kinh tế - xã hội tại địa phương.
Có 3/7 Hợp tác xã nông nghiệp đang hoạt động có hợp đồng liên kết, tiêu thụ sản phẩm chủ lực như rau quả, lúa, sản phẩm thủy sản như liên kết sản xuất lúa gạo (HTX DVNN Quảng Minh), sản xuất rau, củ, quả (HTX NN Quảng Hùng), sản phẩm khai thác, chế biến hải sản (HTX NN&VSMT Quảng Đại). Cụ thể: HTX nông nghiệp Quảng Đại thu mua hải sản khô, tươi đạt 3 tấn/năm, giá trị liên kết 150 triệu đồng; HTX NN Quảng Minh liên kết, thu mua và chuyển giao công nghệ sản xuất và bao tiêu lúa thương phẩm với diện tích hàng năm 100 ha, giá trị liên kết 2.187,5 triệu đồng; HTX nông nghiệp Quảng Hùng liên kết thu mua rau, củ quả và thỏ thương phẩm; trong đó: liên kết sản xuất rau an
toàn hàng năm 3 ha, giá trị liên kết 150 triệu đồng; liên kết tiêu thụ thỏ thương phẩm hàng năm 1000 con, giá trị liên kết 84 triệu đồng.
3/3 xã đều đạt yêu cầu tiêu chí số 13 về tổ chức sản xuất.