Phần mở đầu
Chương 1: KIẾN TRÚC DI TRUYỀN CỦA MỘT QUẦN THỂ I-1.QUẦN THỂ GIAO PHỐI NGẪU NHIÊN
I-1-1.Tần suất gen
I-1-2.Giao phối ngẫu nhiên I-1-3. Định luật Hardy – Weinberg I-1-4. Thiết lập sự cân bằng
I-1-5. Sự đồng nhất ngẫu nhiên giao tử 1-2. SỰ PHỐI HỢP BỐ MẸ CÓ TÍNH LẶN
I-3. ỨNG DỤNG VÀ PHÁT TRIỂN ĐỊNH LUẬT CÂN BẰNG I-3-1. Không có tính trội
I-3-2. Công thức chính xác đối với các mẫu nhỏ I-3-3. Có tính trội :TỈ SỐ SNYDER
I-3-4. Các phối hợp giữa mẹ và con
I-3-5. Ước đoán tần suất gen từ số liệu MC Bài tập
Chương 2: PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG VỀ DI TRUYỀN
2-1. PHƯƠNG SAI & HỢP SAI 2-2. HIỆU SỐ D2
2-3. XẾP NHÓM KIỂU GEN VÀO NHỮNG CLUSTER DI TRUYỀN KHÁC NHAU
Phương pháp Tocher Phương pháp Canonical
2-4. NGHIÊN CỨU CHUYÊN ĐỀ
2-5. PHÂN TÍCH NHÓM TRÊN CƠ SỞ ĐIỆN DI VÀ BIỂU HIỆN ĐA HÌNH
2-5-1. Phân tích ma trận tương đồng, ma trận khoảng cách 2-5-2. Cách tính bằng tay
2-5-3. Xếp nhóm bằng phương pháp UPGMA
2-5-4. Phân tích thông qua chương trình NTSYS-pc trên computer
NTSYSpc trong WINDOW
Bài tập
Chương 3: SỰ PHÂN LY VÀ LIÊN KẾT CÓ TÍNH ĐA GEN
KHẢ NĂNG KẾT HỢP & TƯƠNG TÁC GEN
4-1. NGUYÊN TẮC CHUNG
4-2. PHÉP THỬ CHI BÌNH PHƯƠNG TRONG TRƯỜNG HỢP ĐƠN GEN Bài tập thực hành
4-3. PHÂN TÍCH DIALLEL TRONG DI TRUYỀN SỐ LƯỢNG
4-3-1. Ảnh hưởng của môi trường 4-3-2. ANOVA trong Hayman
4-3-3. Ước đoán các thông số di truyền 4-3-4. Các tỉ số trong phân tích Hayman
4-3-5. Phân tích biểu đồ Wr, Vr
4-4. PHÂN TÍCH KHẢ NĂNG PHỐI HỢP Các phương pháp Griffing
4-5. TƯƠNG TÁC KHÔNG ALEN 4-5-1. Tương tác trong trường hợp hai gen 4-5-2. Tương tác trong trường hợp 3 gen
4-5-3. Phép thử chứng minh sự hiện diện của tương tác không alen (Scaling test)
4-5-4. Phương pháp “weighted least square” 4-5-5. Phương pháp “Triple test cross” Bài tập
Chương 5: ƯU THẾ LAI
Thay đổi giá trị trung bình và phương sai 5-1. ĐỊNH NGHĨA
5-2. THUYẾT TÍNH TRỘI 5-3. THUYẾT SIÊU TRỘI 5-4. THẢO LUẬN
5-5. PHƯƠNG PHÁP TÍNH TRỊ SỐ ƯU THẾ LAI 5-5-1. Ưu thế lai trung bình (HM) (heterosis) 5-5-2. Ưu thế lai tuyệt đối (HB) (heterobeltiosis) 5-5-3. Ưu thế lai chuẩn (HS) (standard heterosis)
5-6. DI TRUYỀN SỐ LƯỢNG TRONG GIẢI THÍCH ƯU THẾ LAI 5-6-1. Trong tương tác digenic
5-6-2. Ưu thế lai theo mô hình của Mather và Jink (1982) 5-6-3. Ưu thế lai theo mô hình của Gardner - Eberhart (1966) 5-6-4. Trong tương tác trigenic
5-7. ƯU THẾ LAI VÀ TƯƠNG TÁC GIỮA KIỂU GEN X MÔI TRƯỜNG Chương 6: CHỌN LỌC TRONG DI TRUYỀN QUẦN THỂ
6-1. PHƯƠNG PHÁP CHỌN LỌC 6-1-1. Loại trừ hoàn toàn tính lặn
6-1-2. Chọn lọc không hoàn toàn để loại trừ tính lặn 6-1-3. Chọn lọc từ từ để loại tính lặn
6-1-4. Chọn lọc ở mức độ giao tử(gametic) và dị hợp tử trung gian 6-1-5. Cân bằng khi chọn lọc các dị hợp tử có ích
6-1-6. Chọn lọc loại bỏ dị hợp tử
6-1-7.Chọn lọc trong quần thể cận giao 6-2. CHỈ SỐ CHỌN LỌC
6-2-1. Lập chỉ số trong trường hợp chọn giống vật nuôi 6-2-2. Lập chỉ số trong trường hợp chọn giống cây trồng Bài tập
Chương 7: TƯƠNG TÁC GIỮA KIỂU GEN VÀ MÔI TRƯỜNG 7-1. TƯƠNG TÁC KIỂU GEN x MÔI TRƯỜNG TRONG QUẦN THỂ PHÂN LY
7-2. ẢNH HƯỞNG CÓ TÍNH CHẤT BỔ SUNG VÀ TƯƠNG TÁC ĐA PHƯƠNG (AMMI)
Bài tập
Chương 8: TÍNH TRẠNG SỐ LƯỢNG TRONG CHỌN LỌC TỰ NHIÊN 8-1. CHỌN LỌC TỰ NHIÊN
8-2. TƯƠNG QUAN GIỮA TÍNH TRẠNG SỐ LƯỢNG VÀ GIÁ TRỊ THÍCH NGHI
8-2-1 . Quần thể cân bằng 8-2-2. Phổ giá trị thích nghi 8-2-3. Thành phần chính
8-2-4. Tính trạng có giá trị tối hảo trung bình 8-2-5. Ảnh hưởng của chọn lọc ổn định 8-2-6. Chọn lọc đột phá
8-2-7. Tính trạng trung tính (neutral)
8-3. ĐÁP ỨNG CỦA GIÁ TRỊ THÍCH NGHI ĐỐI VỚI CHỌN LỌC 8-4. NGUỒN GỐC BIẾN DỊ DO ĐỘT BIẾN
8-5. NHỮNG GEN GÂY RA BIẾN DỊ SỐ LƯỢNG 8-5-1. Tính trội và hoạt tính của enzyme
8-5-2. Tạo đột biến Bài tập
Tài liệu tham khảo
Phụ lục: Thuật ngữ chuyên môn Bảng chỉ dẫn (Index)
TÀI LIỆU THAM KHẢO
Ahmad L, AH Zakri, BS Jalani, and D Omar. 1986. Detection of additive and non additive variation in rice. Pages 555-564 in Rice Genetics. IRRI, Philippines.
Allard RW. 1990 Future direction in plant population genetics, evolution, and breeding. Pages 1- 19 in Plant Population Genetics, Breeding and Genetics Resource. Seminar Associates Inc. Publishers, Massachusetts, USA.
Baker RJ. 1978. Issues in diallel analysis. Crop Science 18 (4): 533-536
Bateson W. 1909. Mendel’s principles of heredity, University Press, Cambridge Brieger FG. 1950. The genetic basis of heterosis in maize. Genetics 35: 420-445
Bulmer MG. 1985. The mathematical theory of quantitative genetics. Clarendon Press, Oxford
Buu BC and PB Tao. 1992. Genetic nature of some agronomic traits in two elite lines of rice. IRRI 17 (5): 5
Buu BC, NT Lang, NM Chau. 1995. Inheritance of some quantitative physiological characters in rice (Oryza sativa L.). OMonRice 4: 8-19
Buu BC and TM Tuan. 1989. Genetic diversity in rice (Oryza sativa L.) LRRN. 14 (6): 5 Buu BC and TT Hanh. 1991. some quantitative characters of rice (Oryza sativa L.). studied
by triple test cross analysis. Pages 166-767 in Rice Genetics II. IRRI, Philippines. Buu BC. 1987. Nghiên cứu một vài đặc tính quan trọng của giống lúa nước sâu ở Đồng bằng
sông Cửu Long, phục vụ công tác chọn giống. Luận án PTS. Viện KHKTNN Việt Nam. Hà Nội
Chandraratna MF and KT Sakai. 1960. A biometrical genetic analysis of macrolinous inheritance of grain weight in rice. Heridity 14 (3&4): 365-373
Chang TM 1981. Studies on quantitative inheritance in rice (Oryza sativa L.). II. Diallel cross of, japonica and indica varieties . Rice Abstract 4: 10
Collins GN. 1921. Dominance and the vigor of first generation hybrids. Amer Nat 55:116-133 Coughtrey A and K Mather. 1970. Interaction and gene association and dispersion in diallel
crosses where gene frequencies are unequal. Heredity 25:79-88.
Crow JF. 1952. Dominance and overdominance. Pp 282-297 in Gowen JW (ed). Heterosis, IowaState College, Ames, Iowa, USA.
Curnow RN. 1964. The effect of continuedselection of phenotypic intermediates on gene frequency. Genet Res 5: 341-353
Darlington CD, K Mather. 1949. The elements of genetics. The Macmillan Co., New York Davenport CB. 1908. Degeneration, albinism and inbreeding. Science 28:454-455
Digby PGN, RA Kempton. 1987. Multivariate analysis of ecological communities. London: Chapman and Hall. 206 pp.
East EM. 1915. Studies on size inheritance in Nicotiana. Genetics 1:164-176 East EM. 1936. Heterosis. Genetics 21: 375-397
Eberhart SA, and CO Gardner 1966. A general model for genetic effects Biometrics 22: 864- 881.
40
Emerson RA, EM East. 1913. The inheritance of quantitative characters in maize. Bull Agr Exp Stat. Nebraska, Res Bull 2.
Falconer DS 1989. Introduction to Quantitative Genetics. Longman UK Third edition.
Finley KW, GM Wilkinson. 1963. The analysis ofadaptation in plant breeding programme. Aust J Agric Res 14: 742-757
Fisher RA. 1918. The correlations between relatives on the supposition od Mendelian inheritance. Trans Roy Soc Edin 52:399-433
Fisher RA. 1922. On the dominance ratio. Proc Roy Soc Edinburgh 42:321-341 Fisher RA. 1930. The genetical theory of natural selection. Oxford: Clarendon Press.
Fisher RA 1936. The use of multiple measurements in taxonomic problem. Annuals of Eugemcs 7: 179-188.
Freeman GH, JM Perkins. 1971. Environmental and genotype-environmental components of variability. VIII. Relations between geneotypes grown in different environments and measures of these environments. Heredity 27: 15-23
Gardner CO, SA Eberhart. 1966. Analysis and interpretation of the variety cross diallel and related population. Biometrics 22: 439 - 452.
Gilbert NEG 1958. Diallel cross in plant breeding. Heredity. 12: 477-492
Griffing B 1956. Concepts of general and specific combining ability in relation to diallel crossing systems. Anst J. Biol. Sci. 9: 463-493
Griffing B. 1956. A generalized treatment of diallel crosses in quantitative inheritance. 10: 31-50
Haldane JBS. 1936. The amount of heterozygosis to be expected in an approximately pure line. Ibid 32: 375-391
Halliburton R, GAE Gall. 1981. Disruptive selection and assortative mating in Tribolium
castaneum. Evolution 35: 829-843
Hallauer AR 1979. Quantitative Genetics in maize. Heriditary variance - Mating designs. P. 45-114.
Hardy GH. 1908. Mendelian proportion in a mixed population. Science 28:49-50 Hayman BI. 1954. The theory and analysis of diallel crosses. Genetics, 39: 789- 809
Hayman BI. 1958. The separation of epistatic from additive and dominance variation in generation means. Heredity 12: 371-390
Hedrick PW, JF McDonald. 1980. Regulatory gene adaptation in an evolutionary model. Heredity 45: 83-97
Hull FH. 1945. Recurrent selection and specific combining ability in corn. Jour Amer Soc Agron 37:134-145
Jink JL. 1956. The F2 and back crosses generations from a set of diallel crosses. Heredity 10: l – 30
Jink JL, RM Jones. 1958. Estimation of the components of heterosis. Genetics Coop Newsl 27:48-54
Jones RM. 1956. Analysis of variance on the half diallel table. Heridity 20:117-121
Kaw RN, and GS Khush. 1986 . Combining ability for low temperature tolerant in rice. Pages 593-612 in Rice genetics. IRRI, Philippines.
Kearsey MJ, K Kojima. 1967. The genetic architecture of body weight and egg hatchability in
Drosophila melanogaster. Genetics 56:23-37
Kearsey MJ and JL Jinks. 1968. A general method of detecting additive dominance and epistatic variation for metrical traits. I. Theory. Heridity 23: 403-409.
Keeble F, C Pellew. 1910. The mode of inheritance of stature and of time of flowering in peas
(Pisum sativum). Jour Genetics 1: 47-56
Lang NT. 1994. Nghiên cứu ưu thế lai của một số tính trạng sinh lý và năng suất cây lúa. Luận án TS. Viện KHKTNN Việt Nam. Hà Nội. 147 pp.
Lang NT and BC Buu. 1993. Combining ability and heterosis for some physiological traits in rice. IRRN 18 (l): 7-8
Lerner IM. 1954. Genetic homeostasis. Oliver and Boyd, Edinburgh
Levene H. 1949. On a matching problem arising in genetics. Ann Math Stat 20:91-94
Li CC. 1977. Diallel analysis of yield and its component traits in rice ( Oryza sativa L.). Plant Breeding Abstracts 47: 45
Li CC. 1982. Population Genetics. 361pp. University of Chicago, Illinois, USA.
Lin CY. 1978. Index selection for genetic improvement of quantitative characters. Theor Appl Genet 52: 49-56
Lu X. 1988. Studies of correlation heritability of quantitative characters in hsien rice Heriditas China 10 (3): 8-10.
Lynch M. 1988. The rate of polygenic mutation. Genet Res 51: 137-148
Mackay TFC. 1985. A quantitative genetic analysis of fitness and its components in
Drosophila melanogaster. Genet Res 47: 59-70
Mackay TFC. 1987. Transposable element-induced polygenic mutations in Drosophila
melanogaster. Genet Res 49:225-233
Mahalanobis PC. 1928. A statistical study at Chinese head measurement. J Asiatic Soc Bengal 25: 301-377
Mather K. 1943. Polygenic inheritance and natural selection. Biol Rev 18:32-64 Mather K. 1949. Biometrical genetics. Dover Publication, Inc., New York.
Mather K. 1979. Historical overview: quantitative variation and polygenic system. In Quantitative Genetic Variation (eds. JN Thompson Jr and JM Thoday). Pp 5-34. Academic Press, New York
Mather SK and JL Jink. 1982. Biometrical genetics . Chapman and Hall, London, Third Edition.
Matzinger DF, and O Kempthone. 1956. The modified diallel table with partial in breeding and interaction with environment. Genetics 41: 822-833.
Mc Donald DJ, JW Stensed, EC Gilmore. 1974. Breeding for high photosynthetic rate in rice. Indian J. Genet 34: 1068-1073
Miller PA, IC Willam, HF Comstock. 1958. Estimates of genetic and environmental variances and covariances in upplant cotton and their implications in selection. Agro. 5 (50): 126-131.
Miller PA, JC Willam, HF Comstock. 1958. Estimates of genetic and environmental variances and covariances in upplant cotton and their implications in selection. Agro. 5 (50): 126-131
Mohapatra KC, and HK Mohanty. 1986. Inheritance of some quantitative characters including heterosis in rice by combining ability analysis. Pages 579- 592 in Rice Genetics. IRR, Philippines.
Mukherjee BK, NB Gupta, SB Singh, NN Singh. 1971. Metrolyph analysis of Indian and exotic varieties of maize. Euphytica 20: 113-118
Murai M, T. Kinosita, and S Hirose. 1987. Diallel analysis of leaf trait in rice Japanese J. Breed. 37 (2): 207 - 211
Murty PSS, and KS Murty. 1983. Path coefficient analysis of source - sink on spikelet sterility in rice (Oryza sativa L. ) Andhra Agric. J. 30 (I): 67-68
Nassa RF. 1965. Effect of correlated gene distribution due to sampling on the diallel analysis. Genetics 52: 9-20
Nei M. 1987. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia University press. 512 pp.
Nei M, W Li. 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonuclease. Proc Natl Acad Sci (USA) 76:5269-5273
Nicolas FW. 1987. Veterinary genetics. Clarendon Press, Oxford, UK. Nilsson-Ehle H. 1909. Kreuzunguntersuchungen an Hafer und Weizen, Lund
Nordskog AW. 1978. Some statistical properties of an index of multipletraits. Theor Appl Genet 52:91-94
Perkins JM, JL Jink. 1968. Environmental and genotype-environmental components ofvariability. III. Multiple lines and crosses. Heredity 23:339-356
Perera LT, D Senadhira and MJ Lawrence. 1986. Genetic architecture of economically important characters and prediction of performance of recombinant inbred lines in rice. Pages 565-578 in Rice Genetics, IRRI, Philippines
Ram T, J Singh, RM Singh. 1989. Dominance relationship and nature of genetic variances for yield and its components in rice. IRRN 14 (4): 6
Ramanujam S, S Kumar. 1964. Metrolyph analysis of geographical complexes in Indian varieties. Indian J Genet 24:144-150
Rao GM 1965. Studies on hybrid vigor in intervarietal hybrids of rice (Oryza sativa L). Andra Agric. J. 2: 1-12.
Robbison HF, RE Comstock and PH Hardy. 1955. Genetic variance in open pollinated varieties of corn. Genetics 40: 45 – 60
Robertson FW. 1955. Selection responses and the properties of genetic variation. Cold Spring Harbor Sump Quant Biol 20:410-427
Robertson FW. 1956. The effect ofselection against extreme deviants based on deviation or on homozygosis. J Genet 54:236-248
Robertson FW. 1966. A mathematical model of the culling process in dairy cattle. Anim Prod 8:95-108
Rohlf FJ. 1992. NTSYS-pc: Numerical taxonomy andmultivariate analysis system, version 1.70. Setauket, New York: Exeter Software
Rife DC. 1938. Simple modes of inheritance and the study of twins. Ohio J Sc 38: 281-293 Shaalan MI, and AE Aly. 1977. Studies on types of gene effects in some crosses of rice
(Oryza sativa L. ). Libyan J. Agr. 6: 229 – 233
Sax K. 1923. The association of size differnces with seed-coat pattern and pigmentation in
Phaseolus vulgaris. Genetics 8:229-243
Shull GH. 1952. Beginnings of the heterosis concept. In Heterosis, pp. 14-48. Iowa State College Press.
Singh RK and SN Kakar. 1977. Control on individual trait mean during index selection. Proc. third Congress SABRAO (Canberra ), 3 (d): 22-25
Singh RK, BD Chaudhary. 1985. Biometrical methods in quantitative genetic analysis. Kalyani Publisher, New Delhi, India. 318 pp.
Snyder LH. 1932. Studies in human inheritance. IX. The inheritance of taste deficiency in man. Ohio J Sc 32: 436-440
Snyder LH. 1947. Studies in human inheritance. XXX. A gene frequency analysis of maternal-fetal incompatibility. J Immunol 56:281-285
Sokal RR, PHA Sneath. 1963. Principles of numerical taxonomy. San Francisco: WH Freeman and Company. 359 pp.
Stebbins GL. 1950. Variation and evolution in plants. Columbia University Press, New York. Stuber CW, RH Moll, MM Goodman, HE Schaffer, BS Weir. 1980. Allozyme frequency
changes associated with selection for increased grain yield in maize (Zea mays L.). genetics 95:225-236
Thoday JM. 1977. Effects of specific genes. pp 141-159 in Pollack E, O Kempthorne, TB Bailey (eds.). Proc Int Conf Quantitative Genetics, Iowa State Univ Ames, Iowa, USA Venkatarao C, KV Krishnamurty, R Lakshminayana. 1973. Metrolyph analysis of
morphological variation in flue-cured tobacco (Nicotiana tabaccum L.). Ind Agric Sci 43:170-172
Waller JH. 1971. Differential reproduction: its relation to IQ test score, education, and occupation. Social Biol 18:122-136
Weir BS. 1996. Genetic data analysi II. Sinauer Associates, Inc. Publishers. Sunderland, Massachusetts. 445 pp.
Wright S. 1931. Evolution in Mendelian populations. Genetics 16:97-159
Wright S. 1949. Adaptation and selection. In GL Jepsen et al. (eds.). genetics, Paleontology, and Evolution, pp. 365-389. Princeton, NJ: Princeton University Press.