Quản lý các khoản chi NSNN cho sự nghiệp giáo dục đợc diễn ra liên tục từ khâu lập dự toán, cấp phát và quyết toán, trong quá trình đó cần phải tăng cờng kiểm tra giám sát xem các đơn vị có thực hiện theo đúng trình tự và thời gian quy định hay không, việc sử dụng nguồn kinh phí cấp phát có đúng mục đích và mang lại hiệu quả hay cha. Chính vì vậy cơ quan tài chính cần tiến hành hiểm tra thờng xuyên hay định kỳ từ khâu lập dự toán cho đến khâu quyết toán, đặc biệt là quá triènh cấp phát và sử dụng kinh phí tạ các trờng trung học phổ thông.
Nội dung kiểm tra chi giáo dục trung học phổ thông cần phải kiểm tra về định mức chi tiêu theo quy định của Nhà nớc, kiểm tra mục đích sử dụng kinh phí có đúng với dự toán hay không, kiểm tra tính hợp lý, hợp lệ trong từng khoản chi.
Sở Giáo dục-Đào tạo kết hợp với Sở Tài chính và Kho bạc Nhà nớc tỉnh Hà Tây theo dõi chặt chẽ tiến độ cấp phát và sử dụng nguồn kinhphí NSNN các sự vụ bất hợp lý. Nếu có sai phạm cần phải phối hợp với các cơ quan hữu quan giải
quyết và có biện pháp sử lý thích đáng, ngăn ngừa tình trạng tiêu cực, sử dụng kinh phí NSNN cấp một cách tuỳ tiện, không đúng mục đích gây hao hụt lãng phí không mang lại hiệu quả chi.
Ngoài ra cần phân chia rõ ràng chức năng, nhiệm vụ và cơ chế phối kết hợp giữa Sở Tài chính-Sở Giáo dục-Đào tạo Kho bạc Nhà nớc và các trờng trung học phổ thông trong tỉnh trong quá trình lập dự toán tạo điều kiện cho công tác thanh tra, kiểm tra tiến hành thuận lợi hơn.