Việc thanh tra giám sát của NHNN được thực hiện chủ yếu dựa trên các báo cáo tổng hợp được các NHTM lập ra. Các báo cáo được lập một cách khoa học, rõ ràng sẽ tạo điều kiện thuận lợi, giúp cho hoạt động thanh tra được nhanh chóng, chính xác. Trên thực tế, công tác kế toán ở nước ta đã và đang bị coi thường. Mặc dù đã nhà nước đã ban hành Luật kế toán và các văn
bản hướng dẫn nhưng các doanh nghiệp vẫn thờ ơ. Tình trạng coi thường công tác kế toán trong nhiều doanh nghiệp đã gây ra những hậu quả âm thầm nhưng nghiêm trọng. Không ít doanh nghiệp khi có thanh tra thuế mới vội vàng lập các báo cáo tài chính. Công tác kế toán chỉ là công cụ để đối phó với việc kiểm tra, quyết toán thuế. Ngẫu nhiên trong doanh nghiệp tồn tại hai hệ thống sổ kế toán. Một hệ thống sổ kế toán phản ánh đúng thực chất về doanh nghiệp nhưng không theo bất kỳ quy định pháp luật nào; còn hệ thống kế toán thuế, về hình thức theo đúng cá quy định của pháp luật nhưng thông tin, số liệu trong đó phản ánh hoàn toàn không đúng thực tiễn hoạt động kinh doanh. Và chỉ có cơ quan thuế quan tâm đến công tác kế toán của các doanh nghiệp. Hơn nữa nguồn nhân lực lại không được trọng dụng. Đội ngũ cán bộ kế toán được đào tạo khá nhiều, song sự gia tăng về số lượng không tương xứng với việc nâng cao chất lượng.
Trong những năm qua, để chế độ kế toán Việt Nam hoà nhập với chế độ kế toán của các nước trên thế giới, Bộ tài chính đã nghiên cứu và ban hành được 26 chuẩn mực kế toán (VAS). Đây là một cố gắng lớn đáng ghi nhận. Song, việc nghiên cứu và ban hành các chuẩn mực kế toán là quan trọng nhưng quan trọng hơn là phải đưa vào ứng dụng trong thực tiễn. Nghiên cứu, tiếp thu các chuẩn mực kế toán là công việc rất phức tạp, ngay cả với những cán bộ kế toán được đào tạo chính quy. Do đó, ban hành các chuẩn mực kế toán chưa phải đã là hoàn thành nhiệm vụ. Vì vậy, các cơ quan quản lý nhà nước có thẩm quyền phải tiếp tục hoàn thiện hệ thống kế toán và các chuẩn mực kê toán cho phù hợp với các quy định, thông lệ quốc tế; tạo điều kiện thuận lợi cho việc quản lý nhà nước.