3.1. Phâ vỡ tế băo
Protein enzyme có trong tất cả câc cơ thể động vật, thực vật vă vi sinh vật. Sau khi được tổng hợp nó có thể được tiết ra ngoăi tế băo tồn tại trong câc dịch cơ thể, dịch môi trường (gọi lă protein enzyme ngoại băo) hoặc được giữ lại bín trong tế băo (protein enzyme nội băo). Câc protein enzyme nội băo có thể tồn tại ở dạng hòa tan trong tế băo chất vă câc băo quan (nhđn, microsome, mitochondria v.v...) của tế băo. Tế băo được bao bọc bằng một lớp măng.Lớp măng năy ở vi khuẩn đôi khi rất bền vă dăy. Người ta còn thấy nhiều protein enzyme liín kết rất chặt chẽ với câc băo quan của tế băo. Câc phđn tử protein enzyme không có khả năng đi qua măng của tế băo vă măng của câc băo quan của tế băo. Do đó để có thể chiết rút câc protein enzyme nội băo, bước đầu tiín lă phải phâ vỡ cấu trúc của câc tế băo có chứa protein enzyme vă chuyển chúng văo dung dịch.
Có thể phâ vỡ cấu trúc của tế băo bằng câc biện phâp cơ học như nghiền với bột thủy tinh hoặc cât thạch anh, lăm đồng hóa bằng thiết bị nghiín đồng thể (homogenizator). Thiết bị năy có chăy thủy tinh gắn với một môtơ quay vă có thể điều chỉnh được tốc độ quay theo yíu cầu. Câc tế băo giữa chăy thùy tinh vă thănh cối sẽ bị phâ hủy.
Để việc phâ vỡ có hiệu quả, ở mô thực vật, trước khi nghiền, người ta thường thâi nhỏ mẫu để văo ngăn đâ hoặc cho trương nước. (ví dụ như đối với mẫu hạt khô). Còn ở câc mô của động vật như gan hoặc thận, khi chiết protein enzyme người ta cần cắt bỏ câc mô liín kết.
Muốn tâch được câc protein trong câc cấu tử của tế băo, người ta còn phải dùng câc yếu tố vật lý vă hóa học khâc như sóng siíu đm, dùng câc dung môi hữu cơ như butanol, acetone, glycerin, ethylacetat... vă chất tẩy (detergent). Câc hóa chất tốt cho việc phâ vỡ câc băo quan của tế băo vì trong câc cơ quan năy thường chứa mỡ.
3.2. Chiết rút protein
Sau khi đê phâ vỡ cấu trúc của câc tế băo tiến hănh chiết xuất câc protein enzyme bằng câc dụng dịch đệm thích hợp, dung dịch muối trung tính hoặc bằng nước đối với protein enzyme nội băo hoặc bằng ly tđm tâch
tế băo đối với câc protein enzyme ngoại băo: việc chọn phương phâp tâch chiết protein enzyme tùy thuộc văo tính chất của protein enzyme cần nghiín cứu.