Tỷ lệ khuyết số liệu (M%) và tỉ lệ dị hợp (H%) của các mẫu

Một phần của tài liệu nghiên cứu xác định marker để nhận dạng một số giống cam bản địa quý của việt nam làm cơ sở cho việc đăng kí bản quyền marker phân tử trong nước và quốc tế. (Trang 40 - 42)

III. KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

3.2.2. Tỷ lệ khuyết số liệu (M%) và tỉ lệ dị hợp (H%) của các mẫu

mồi AC01 với 3 alen ựược thể hiện) ựến 0.80 (ở mồi CAT01 với 8 alen thể hiện). Kết quả ở bảng 6 cũng cho thấy hệ số PIC của cả tập ựoàn có giá trị trung bình là 0,56.

Phân tắch 19 mồi SSR với 48 mẫu thuộc 16 giống cam thu ựược tổng số 76 loại alen, trung bình 4 alen/locus. Tất cả các mồi ựều ựa hình, trong ựó có 3 mồi cho 2 alen (Ci02B10, CAC23, CT21); 6 mồi thu ựược 3 alen (mCrCIR06B04, P94, P620, NTCP9, AC01, CT02); 5 mồi thu ựược 4 alen (Ci02F07, Ci07C09, Ci07G07, AG14, CTT01); 1 mồi thu ựược 5 alen (P1223); 2 mồi thu ựược 6 alen (Ci06A05b, GT03); 1 mồi thu ựược 7 alen (mCrCIR06A02) và 1 mồi thu ựược 8 alen (CAT01) (bảng 6).

3.2.2. Tỷ lệ khuyết số liệu (M%) và tỉ lệ dị hợp (H%) của các mẫu giống cam nghiên cứu cam nghiên cứu

Tỷ lệ khuyết số liệu phản ảnh khả năng bắt cặp của các mẫu giống với các mồi nghiên cứu. Tỷ lệ khuyết số liệu lớn nhất ở mẫu VC3- Cam Vân Canh là 26,32%, và mẫu SBT2 Ờ Sành Bến Tre là 21,05%, trong số 48 mẫu thuộc 18 giống nghiên cứu thì 16 mẫu không khuyết số liệu ở tất cả các mồi nghiên cứu.

Tỷ lệ dị hợp ở mức locus (H%) cao nhất là 56,3% ở mẫu CS3 (mẫu thuộc giống cam Soàn). Có 8 mẫu có mức dị hợp cao hơn 50 % gồm: XD1, XD2, XD3, BH1, CC1, SBT1, CS1 và CS2; các mẫu thuộc 5 giống khác nhau.

Bảng 7: Tỷ lệ khuyết số liệu (M%) và tỉ lệ dị hợp (H%) của các giống cam dựa trên kết quả phân tắch 28 locus khác nhau

TT Kắ hiệu Tên giống M% H% TT Kắ hiệu Tên giống M% H%

1 VD1 Cam Vân Du 5,26 38,9 25 CP1 Cam sành Cao

Phong 0,00 47,4 2 VD2 Cam Vân Du 5,26 33,3 26 CP2 Cam sành Cao Phong 0,00 47,4 3 VD3 Cam Vân Du 5,26 38,9 27 CP3 Cam sành Cao

Phong 5,26 44,4 4 SC1 Cam Sông

con 5,26 38,9 28 LV1 Cam Lòng Vàng 0,00 42,1 5 SC2 Cam Sông con 5,26 38,9 29 LV2 Cam Lòng Vàng 0,00 42,1 6 SC3 Cam Sông

con 5,26 44,4 30 LV3 Cam Lòng Vàng 0,00 42,1 7 VC1 Cam Vân

Canh 10,53 35,3 31 CC1 Cam Chanh 0,00 52,6 8 VC2 Cam Vân

Canh 5,26 33,3 32 CC2 Cam Chanh 0,00 36,8 9 VC3 Cam Vân

Canh 26,32 28,6 33 CC3 Cam Chanh 5,26 38,9 10 STQ1 Cam Sành

Tuyên Quang 5,26 27,8 34 SYB1

Cam Sành Văn

Chấn 5,26 38,9 11 STQ2 Cam Sành

Tuyên Quang 10,53 35,3 35 SYB2

Cam Sành Văn

Chấn 5,26 44,4 12 STQ3 Cam Sành

Tuyên Quang 5,26 33,3 36 SYB3

Cam Sành Văn

Chấn 0,00 47,4 13 QT1 Cam Sành

Quang Thuận 15,79 43,8 37 SBT1 Cam sành Bến Tre 15,79 50 14 QT2 Cam Sành

Quang Thuận 15,79 25 38 SBT2 Cam sành Bến Tre 21,05 40 15 QT3 Cam Sành

Quang Thuận 0,00 36,8 39 SBT3 Cam sành Bến Tre 0,00 47,4 16 XD1 Cam Xã đoài 0,00 52,6 40 CS1 Cam Soàn 5,26 55,6 17 XD2 Cam Xã đoài 5,26 50 41 CS2 Cam Soàn 15,79 56,3 18 XD3 Cam Xã đoài 0,00 52,6 42 CS3 Cam Soàn 5,26 33,3 19 BH1 Cam Bố Hạ 5,26 55,6 43 MCH 1 Cam mật có hạt 15,79 37,5 20 BH2 Cam Bố Hạ 15,79 37,5 44 MCH 2 Cam mật có hạt 15,79 37,5 21 BH3 Cam Bố Hạ 5,26 44,4 45 MCH 3 Cam mật có hạt 5,26 44,4 22 CG1 Cam Giấy 0,00 36,8 46 MKH1 Cam mật không hạt 0,00 47,4 23 CG2 Cam Giấy 0,00 36,8 47 MKH

2 Cam mật không hạt 0,00 42,1 24 CG3 Cam Giấy 5,26 33,3 48 MKH

Các mẫu khác có mức dị hợp dao ựộng từ 25% ựến 50% nhưng không có giống nào có cả 3 mẫu ựều có mức dị hợp giống nhau. điều này chứng tỏ có sự sai khác giữa các mẫu thuộc cùng một giống và giữa các giống; các giống có sự ựa dạng về mức ựộ dị hợp, và không có nhiều sự khác biệt về mức dị hợp giữa các giống thuộc tập ựoàn cam thu tại miền bắc và các tập ựoàn cam Miền Nam. Như vậy, phân tắch với 35 locus thì tỷ lệ dị hợp chung của cả tập ựoàn là khá cao, không có mẫu nào ựồng hợp cả 35 locus nghiên

Một phần của tài liệu nghiên cứu xác định marker để nhận dạng một số giống cam bản địa quý của việt nam làm cơ sở cho việc đăng kí bản quyền marker phân tử trong nước và quốc tế. (Trang 40 - 42)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(62 trang)