Bệnh bạc lỏ do vi khuẩn ( Xanthomonas Oryzae pv Oryzae) gõy nờn. ðược phỏt hiện ủầu tiờn tại Nhật Bản vào khoảng năm 1884-1885, bệnh khỏ phổ biến ở hầu hết cỏc nước trồng lỳa trờn thế giới, song vựng chịu sự tỏc hại lớn nhất là ðụng Nam ỏ và Chõu ỏ làm thiệt hại về năng suất và chất lượng hạt. Theo Mew và cộng sự (1982) [54], thỡ bệnh cú thể lầm giảm tới 60% năng suất hạt hàng năm. Tại Australia năm 1986 bệnh bạc lỏ ủó làm giảm năng suất trung
bỡnh 3,5 tấn/ha ( Ramsey and Moffet, 1998). Tại ấn ðộ hàng năm cú tới hàng trăm triệu ha lỳa bị bạc lỏ nặng làm cho năng suất giảm 60% ( Sivivatava, 1972) [56]. ở Việt Nam bệnh bạc lỏ ủó từng gõy hại nặng ở Bắc Giang ( 1956- 1957), ðụng Triều- Quảng Ninh ( 1961) và trở thành dịch bệnh ở ủồng bằng sụng Hồng những năm 1968- 1975 ( Hà Minh Trung, 1996 ) [33].
Bệnh bạc lỏ ảnh hưởng rất lớn ủến sinh trưởng và phỏt triển của cõy lỳa làm tăng cường hụ hấp, giảm cường ủộ quang hợp, cõy mềm yếu, kộo dài thời gian trỗ, tỷ lệ gạo lộp, gạo nỏt cao ( Tạ Minh Sơn, 1987) [25]. Vỡ vậy việc nghiờn cứu chọn tạo ra cỏc giống cú khả năng chống bệnh bạc lỏ luụn là nhiệm vụ cấp bỏch ủặt ra cho cỏc nhà chọn giống, năm 1926 giống lỳa chống bệnh ủầu tiờn mới ủược xỏc ủịnh. Tại trường trung học nụng nghiệp Kagoshima, giống lỳa ủú ủó ủược chọn lọc từ giống nhiễm bệnh Shikinki và ủược ủặt tờn là Kono 35. Nhiều cụng trỡnh chọn tạo giống lỳa khỏng bệnh ủó ủược tiến hành từ ủú ( Kush, 1997; Revadath, 1987) [48].
Vào những năm 80, Viện nghiờn cứu lỳa quốc tế IRRI ủó xỏc ủịnh bản chất di truyền tớnh chống bệnh bạc lỏ là do gen quy ủịnh. Nhiều dũng, giống lỳa khỏng bệnh bạc lỏ ủó ủược Viện nghiờn cứu lỳa quốc tế IRRI tạo ra. Cỏc dũng giống này ủó ủược khu vực hoỏ trồng rộng rói ở Chõu ỏ và cung cấp nguồn gen chống chịu bệnh bạc lỏ cho nhiều nước ( Vũ Cụng Khoỏi, 2002) [37].
Năm 1989 ủó phỏt hiện ủược 14 gen chống bệnh bạc lỏ trong ủú cú 5 gen là Xa-1, Xa-2, Xa-3, Xa-11 và Xa-12 tỡm thấy ở Nhật Bản do Ogawa và Yamamoto (1986) và 9 gen khỏc ủược phỏt hiện ở IRRI là Xa-4, Xa-5, Xa-6, Xa-7, Xa-8, Xa-9, Xa-10, Xa-13, Xa-14, xa-18, Xa-21 ( theo Ogawa và cộng sự, 1987). Cũng theo Ogawa và cộng sự thỡ Xa-6 và Xa-9 cựng alen với Xa- 3. Tương tự với những gen chống bệnh trờn, người ta ủó phỏt hiện ra 6 nũi sinh lý khỏc nhau ở Philippines là Px061( nũi 2), Px079 (nũi 3), những giống mang gen Xa-1, Xa-11, Xa-12 mẫn cảm với 6 nũi sinh lý tỡm thấy ở
Philippines, gen này cú nguồn gốc loài lỳa dại Oryzae longistamminata. Sau ủú Ikeda và cộng sự (1990) ủó phỏt hiện thấy gen này cú liờn kết với gen Xa- 3, Xa-4 ở nhiễm sắc thể số 11.
Theo Khuy và cộng sự thỡ giống nào chứa Xa-13 và xa-21 nguồn gốc từ lỳa dại Olong B Taminata cú khả năng chống ủược 9 chủng tỡm thấy ở ấn ðộ và 6 chủng tỡm thấy ở Philippines.
Những năm gần ủõy, IRRI và một số nước phỏt triển ủó lập bản ủồ gen và dựng phương phỏp PCR ủể phỏt hiện chọn lọc những gen chống bệnh bạc lỏ của giống lỳa trờn cơ sởủú cú thể ủiều tra phỏt hiện nhiều gen chống bệnh khỏc nhau trờn cựng một cỏch chớnh xỏc.
Theo Phan Hữu Tụn (2000) [31] dựng phương phỏp PCR ( Polymerase Chain Reaction) ủó phỏt hiện và chọn lọc những gen chống bệnh ở lỳa trong ủú cú bệnh bạc lỏ. Qua kiểm tra 145 giống lỳa ủịa phương, nghiờn cứu thấy cú 12 giống lỳa chứa gen Xa-5 và khụng cú giống nào chứa Xa-13 và Xa-21.
Theo Tạ Minh Sơn (1978) [24] những nghiờn cứu bước ủầu về thành phần nũi vi khuẩn gõy bạc lỏ ở nước ta cho thấy vi khuẩn gõy bệnh bạc lỏ cú 4 nhúm và phổ biến. Nhúm I tập trung ở ủồng bằng Bắc Bộ, nhúm II tập trung ở cỏc tỉnh ủồng bằng Nam Bộ, nhúm III và IV nằm rải rỏc trong cả nước. Hiện nay bộ mụn Cụng nghệ sinh học và Phương phỏp thớ nghiệm ủó phõn lập ủược 10 chủng ủang tồn tại ở miền Bắc Việt Nam ( Phan Hữu Tụn, 2002-2004) [32].