Hệ thống sơng rạch trên địa bàn Thành phố Hồ Chí Minh giữ vai trị quan trọng trong việc cung cấp nước cũng như tiêu thốt nước. Đặc biệt, vùng hạ lưu chịu ảnh hưởng của chế độ thuỷ triều mạnh mẽ. Vì vậy, chính những yếu tố trên đã tạo cho sơng Sài Gịn hai khả năng vừa thuận lợi vừa khĩ khăn.
Ở khu vực thượng nguồn: ở khu vực này hầu như khơng bị nhiễm mặn. Do đĩ, vùng thượng lưu với các đập hồ quan trọng là nơi cung cấp nước sinh hoạt chủ yếu cho một bộ phận lớn dân cư đồng thời cũng là nguồn cung cấp nước tưới tiêu cho một diện tích lớn đất nơng nghiệp. Đặc biệt, ở thượng lưu sơng Sài Gịn cĩ hồ Dầu Tiếng, tình hình điều tiết, xả lũ và sự an toàn của hồ cĩ mối quan hệ mật thiết với vùng hạ lưu, nhất là Thành phố Hồ Chí Minh. Sự tồn tại và vận hành của các hồ chứa đã mang lại một nguồi lợi to lớn cho đất nước. Một trong những nguồi lợi đầu tiên phải kể đến là nguồi lợi về thuỷ điện.
Vùng nước ngọt ở khu vực Củ Chi, Bắc Hĩc Mơn, Bắc Bình Chánh…đĩng vai trị quan trọng trong hoạt động sản xuất nơng nghiệp nơi đây. Tuy nhiên, hiện nay ranh mặn đang bắt đầu di chuyển dần sang địa bàn huyện Củ Chi. Do vậy, nguy cơ làm suy giảm năng suất cây trồng ở nơi đây là rất lớn.
Ngồi ra, hệ thống sơng rạch ở khu vực Thành phố Hồ Chí Minh hoàn tồn chịu ảnh hưởng của chế độ bán nhật triều biển Đơng do đĩ rất thuận lợi để điều tiết nước tưới và xả lũ vào mùa mưa cũng như cĩ khả năng tự làm sạch và cải tạo ơ nhiễm nhanh chống. Mặt khác, vùng nước lợ ở cửa sơng rất thích hợp để phát triển nuơi trồng thuỷ hải sản như tơm, cua,…Chính chế độ thuỷ triều đặc trưng của khu
vực là nguồn cung cấp phù sa, sinh vật làm cải tạo đất, giúp đất màu mỡ hơn. Tuy nhiên, chính nĩ lại rất dễ làm cho đất bị nhiễm mặn, gây xĩi lở (điển hình là khu vực bán đảo Thanh Đa, Thành phố Hồ Chí Minh cũng như ở các khu vực ven sơng Sài Gịn ).
Ngồi ra, sơng cịn là nơi chứa đựng một trong những loại khống sản quan trọng là cát dùng cho xây dựng, cát dùng cho việc san lấp. Hoạt động khai thác cát trên sơng một mặt mang lại lợi nhuận to lớn nhưng mặt khác cũng gây nên những hậu quả nghiêm trọng. Chính hoạt động này gĩp phần đẩy nhanh tốc độ sạt lở bờ sơng, làm mất ổn định cấu trúc đất ở những khu vực này.