Dù rất quan tâm đến việc đầu tư đổi mới công nghệ để nâng cao chất lượng dịch vụ cung ứng cho khách hàng, nhưng trên thực tế vẫn còn nhiều bất cập như: Quy mô vốn nhỏ; chi phí đầu tư hiện đại hóa công nghệ cao; khả năng ứng dụng công nghệ tiên tiến của nhân viên còn hạn chế nên dẫn đến lãng phí, khai thác không hết tính năng của công nghệ mới.
Điển hình là hệ thống giao dịch tự động – ATM và E-banking, sau một thời gian triển khai thực hiện vẫn chưa hết những bất cập, chưa có sự kết nối trong toàn hệ thống Ngân hàng để có thể giảm chi phí và đảm bảo hiệu quả giao dịch cho khách hàng.
Công tác thu nợ gốc và lãi treo của các đơn vị có nợ xấu, nợ quá hạn tại Chi nhánh đã có nhiều chuyển biến tích cực, tuy nhiên số nợ xấu, nợ quá hạn và lãi treo còn nhiều dẫn
đến sức ép trích dự phòng rủi ro cụ thể lớn, ảnh hưởng đến kết quả hoạt động kinh doanh của Chi nhánh.
Khi dịch vụ còn chưa thực sự phát triển, khách hàng sẽ phải đối mặt với nhiều nỗi lo như: có tiền trong tài khoản mà không được tiêu vì máy hết tiền, nghẽn đường truyền, vấn đề bảo mật, làm quen với những quy trình thanh toán trong muasắm… Đó cũng là nguyên nhân nhiều người thường rút hết tiền trong tài khoản thành tiền mặt để tiêuhoặc đi xa phòng trường hợp không tìm được địa điểm đặt máy ATM. Vì vậy công cụ thanh toán trong khu vực còn hạn chế là nguyên nhân chính khiến khách hàng không yên tâm khi sử dụng thẻ.
2.8.. Nguyên nhân dẫn đến hạn chế của chất lượng dịch vụ thanh toán: 2.8.1. Nguyên nhân khách quan:
Thói quen và nhận thức: Tiền mặt hiện vẫn là một công cụ thanh toán không hạn chế đối tượng và phạm vi sử dụng, ưu việt rất lơn là thanh toán tức thời và vô danh, thủ tục đơn giản. Thói quen sử dụng tiền mặt để thanh toán trực tiếp hiện nay là lực cản rất lớn trong việc phát triển các dịch vụ thanh toán thông qua hệ thống Ngân hàng. Mặt khác vẫn chưa có sự đồng bộ trong giao dịch điện tử, chứng từ điện tử giữa các cơ quan quản lý Nhà nước có liên quan. Hệ thống văn bản pháp lý liên quan đến lĩnh vực thanh toán vẫn còn những điểm cần phải tiếp tục chỉnh sửa, thay thế để có thể phù hợp với thông lệ quốc tế và nhu cầu của người sử dụng. Công tác tuyên truyền chưa được quan tâm, chú trọng. Những mục tiêu chiến lược định hướng và các chính sách lớn để phát triển hoạt động chưa được công bố đầy đủ cho công chúng.
Trong những năm qua do tình hình kinh tế vẫn đang trong tình trạng khó khăn xuất phát từ nội tại của nền kinh tế, điều này ảnh hưởng lớn đến tình hình thu nhập của người dân, kết quả hoạt động kinh doanh của các doanh nghiệp do vậy nó tác động không nhỏ đến công tác huy động vốn của ngân hàng nói chung và dịch vụ thanh toán nói riêng.
Hệ thống ngân hàng phát triển mạnh mẽ đặc biệt là khi Việt Nam trở thành thành viên của tổ chức Thương mại Thế giới WTO, lĩnh vực ngân hàng tài chính được mở cửa tạo điều kiện cho rất nhiều hệ thống ngân hàng lớn trên thế giới mở chi nhánh hoạt động tại Việt Nam. Chính điều này đã làm cho sự cạnh tranh của ngân hàng trong hệ thống ngân hàng Việt Nam ngày càng gay gắt.
Số lượng các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực xuất nhập khẩu còn hạn chế, giá trị kim ngạch không cao đã tác động không nhỏ tới hoạt động kinh doanh của Ngân hàng.
Số lượng máy ATM còn hạn chế, chưa tương ứng với số lượng thẻ ATM đã phát hành.Việc kết nối giữa các thành viên còn hạn chế, chưa thông báo cho khách hàng biết để có thể linh hoạt giao dịch ở máy ATM thuộc các Ngân hàng khác cùng tham gia liên minh đã được kết nối. Các công cụ và dịch vụ thanh toán chưa chứng tỏ được lợi ích hơn hẳn về kinh tế.
Công nghệ ngân hàng mặc dù được đầu tư nhiều nhưng ở chừng mức nào đó vẫn chưa đủ đáp ứng được yêu cầu cần thiết cho sự phát triển của các dịch vụ ngân hàng, đặc biệt là các dịch vụ dựa trên nền tảng công nghệ cao, các dịch vụ này thường đòi hỏi chi phí đầu tư rất lớn, bao gồm cả chi phí đầu tư về phần mềm, ứng dụng cũng như cơ sở vật chất
Giao dịch trên ATM khác hệ thống phải tốn phí giao dịch và rất có thể giao dịch sẽ không thành công gây nhiều phiền hà cho khách hàng. Thủ tục tra soát khiếu nại giữa các ngân hàng khác hệ thống lại thường mất thời gian. Bên cạnh đó việc các máy ATM hoạt động khác nhau còn làm cho khách hàng phải lúng túng khi giao dịch. Có ngân hàng thì mã pin 6 số, có ngân hàng mã pin 4 số gây nhầm lẫn cho khách hàng. Trong khi giao dịch thì có máy của ngân hàng này đưa thẻ ra trước tiền đưa sau nhưng cũng có máy của ngân hàng khác lại đưa tiền trước rồi đưa thẻ sau nên thường xảy ra tình trạng là khách hàng quên rút thẻ và kết quả là mất thẻ phải phát hành lại thẻ mới. Do không có định hướng ban đầu nên các Ngân hàng sử dụng những hệ thống khác nhau, tiêu chuẩn kỹ thuật không đồng bộ nên viêc kết nối hệ thống giữa các Ngân hàng còn nhiều hạn chế.
Hiện nay một tình trạng cũng thường hay xãy ra tại các điểm đặt máy rút tiền ATM là tình trạng quá tải người sử dụng. Người muốn rút tiền lại phải chờ đợi quá lâu để có thể tới lượt mình rút tiền vào các giờ cao điểm. Tuy đã trang bị khá nhiều ATM tại nhiều địa điểm khác nhau nhưng vì lượng thẻ phát hành ra nhiều và nhu cầu sử dụng máy của người dân nhiều kéo theo tình trạng là khách hàng phải chờ đợi. Đặc biệt là vào những dịp cuối năm hay những ngày cao điểm lễ Tết.