Tuy vậy, mô hình cũng có những hạn chế mà khi xây dựng, tôi cũng nhìn nhận được. Đầu tiên, đó là mô hình sử dụng nhiều kênh thông tin, buộc người thực hiện việc tính hệ số tín nhiệm cần phải am hiểu và tìm hiểu kỹ càng về công ty, lấy số liệu khá nhiều, và cần phải phân tích nhiều góc độ. Đôi khi việc lấy số liệu không phải là công việc dễ dang. Thứ hai, mô hình sẽ gặp khá nhiều khó khăn đối với các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực tài chính ngân hàng vì đặc thù ngành này mang lại. Thứ ba, mô hình sử dụng nhiều thông số khác nhau, tỷ trọng của mỗi chỉ tiêu được xây dựng dựa trên việc nghiên cứu, đánh giá chủ quan của các nhà phân tích, các giám đốc tài chính và các nhà báo…Thứ tư, mô hình sử dụng hầu hết các thông tin trên các báo cáo tài chính của các doanh nghiệp, hầu hết đều đã được chỉnh sửa, và số liệu trên đó chứ thật sự chính xác. Điều đó khiến cho các đánh giá mà hệ số tín nhiệm doanh nghiệp mang lại không thật sự ý ngĩa. Cuối cùng là cách tính các chỉ tiêu đôi khi gặp khó khăn với các báo cáo tài chính được công bố từ các công ty. Chẳng hạn như hàng tồn kho của các ngân hàng hầu như không có, nên chỉ tiêu vòng quay hàng tồn khó khó xác định, hệ số điểm của thông số này có ảnh hưởng đến cả chỉ tiêu lớn. Ngoài ra, trong quá trình áp dụng mô hình chắc chắn sẽ phát sinh nhiều hạn chế khác mà hiện tại tác giả chưa nhận ra được.