Cluster of Orthologous Groups (COGs): Một hệ thống của cỏc họ gen từ cỏc genom hoàn chỉnh.
Gene Expression Omnibus (GEO): Kho dữ liệu gen biểu hiện và cỏc nguồn trực tuyến cho việc thu nhận cỏc dữ liệu gen biểu hiện.
HomoloGene: So sỏnh cỏc trỡnh tự nucleotide giữa cỏc cặp sinh vật để xỏc định cỏc gen ở cỏc loài khỏc nhau được tiến húa từ một gen tổ tiờn chung do quỏ trỡnh phõn loài và chỳng thường vẫn giữ được nguyờn chức năng trong quỏ
CSDL cỏc vựng bảo thủ (
Conserved Domain Database CDD): Tập hợp cỏc bản
so sỏnh trỡnh tự (sequence alignment) và cỏc profile của cỏc vựng bảo thủ của cỏc phõn tử protein trong quỏ trỡnh tiến húa phõn tử.
Tập hợp cỏc gen động vật cú vỳ (
Mammalian Gene Collection MGC): Một nỗ lực mới
của NIH để thu được cỏc nguồn cDNA với chiều dài đầy đủ.
Clone Registry: Một CSDL được sử dụng bởi sự tham gia của cỏc trung tõm trỡnh tự genom người và chuột để lưu giữ những dũng được lựa chọn từ việc đọc trỡnh tự, cỏc dũng đang được đọc trỡnh tự và cỏc dũng đó hoàn tất và
Trace Archive: Được phỏt triển để lưu giữ cỏc dữ liệu trỡnh tự thụ được tạo ra từ cỏc dự ỏn xỏc định trỡnh tự.
Tỡm khung đọc mở (ORF Finder): Một cụng cụ phõn tớch hiện thị dưới dạng đồ hoạ cho phộp tỡm cỏc khung đọc mở của một đoạn trỡnh tự hoặc một trỡnh tự cú trong CSDL.
VecScreen: Một cụng cụ cho phộp xỏc định cỏc đoạn trỡnh tự nucleotide mà cú thể là của vector, cỏc vựng linker hoặc cỏc điểm khởi đầu sao chộp (origin) trước khi sử dụng cỏc cụng cụ phõn tớch trỡnh tự hoặc đăng ký trỡnh tự.
Electronic-PCR (e-PCR): Cú thể được sử dụng để so sỏnh một trỡnh tự truy vấn (query sequence) với cỏc vị trớ trong trỡnh tự đỏnh dấu (sequence-tagged sites) để tỡm ra một vị trớ bản đồ cú thể cho trỡnh tự truy vấn.