Để thực hiện công tác kế toán chi phí sản xuất trong các doanh nghiệp, kế toán cẩn tổ chức tốt hệ thống chứng từ kế toán phản ánh đầy đủ các nghiệp vụ kinh tế phát sinh liên quan đến chi phí sản xuất. Đây là công việc đầu tiên mà kế toán phải thực hiện trước khi tập hợp chi phí sản xuất và tính giá thành sản phẩm. Kế toán sử dụng hệ thống chứng từ như sau: chứng từ phản ánh hao phí về lao động sống: bảng phân bổ tiền lương và bảo hiểm xã hội, phiếu xuất kho, phiếu nhập kho, bảng tính và phân bổ khấu hao TSCĐ, hóa đơn GTGT…..
Để thực hiện hạch toán chi tiết chi phí sản xuất nhằm quản lý và kiểm soát chi phí thực hiện tiết kiệm chi phí và hạ giá thành sản phẩm, kế toán mở sổ chi tiết để theo dõi các khoản mục chi phí sản xuất phát sinh trong kỳ kế toán. Tùy theo yêu cầu và trình độ quản lý của doanh nghiệp mà đơn vị có thể mở các sổ chi tiết chi phí sản xuất cho các TK 621, 622, 623, 142, 242, 154, 631. Mỗi một sổ chi tiết được mở riêng cho một tài khoản và được mở bằng một trang sổ hay sổ riêng tùy theo nghiệp vụ phát sinh nhiều hay ít đồng thời
cũng được mở riêng cho từng phân xưởng trong đó chi tiết theo từng loại sản phẩm, dịch vụ.
Về công tác tổ chức hạch toán tổng hợp chi phí sản xuất: tùy theo từng lựa chọn và đăng ký hình thức ghi sổ kế toán mà mỗi doanh nghiệp tổ chức hệ thống sổ kế toán tổng hợp cho kế toán chi phí sản xuất khác nhau. Sổ kế toán tổng hợp là sổ được dùng để phản ánh số liệu trên TK tổng hợp (TK cấp 1). Trên sổ tổng hợp các đối tượng kế toán phải theo dõi bằng chỉ tiêu giá trị. Dưới đây là tổ chức hệ thống sổ kế toán tổng hợp trên các hình thức ghi sổ kế toán: