Hệ thống bộ máy quản lý của Công ty cổ phần phát triển và xuất nhập khẩu Sông Hồng được tổ chức rất khoa học, giúp cho nhà lãnh đạo Công ty nắm bắt thông tin một cách nhanh chóng, từ đó đưa ra quyết định chính xác và kịp thời. Là Công ty cổ phần hạch toán kinh tế độc lập, Công ty tổ chức bộ máy quản lý theo cơ cấu trực tuyến chức năng: Đứng đầu là Chủ tịch hội đồng quản trị, Giám đốc, tiếp theo là phó Giám đốc, dưới là các phòng ban, dưới nữa là chi nhánh, xí nghiệp. Đây là một cơ cấu tối ưu hạn chế được những nhược điểm trong quản lý điều hành
Giám đốc là người chịu trách nhiệm chung toàn Công ty, chịu trách nhiệm chỉ đạo, hướng dẫn các Giám đốc xí nghiệp và trưởn các phòng ban các đơn vị trực thuộc có trách nhiệm phối hợp nghiên cứu và đề xuất biện pháp giải quyết.
Quan hệ giữa các phòng nghiệp vụ Công ty là quan hệ hướng dẫn thực hiện trong phạm vi chức năng, quyền hạn đã quy định.
Các bộ phận trong Công ty có trách nhiệm phối hợp, đề xuất biện pháp giải quyết cho Giám đốc, phó Giám đốc Công ty nếu vấn đề có liên quan giữa
các phòng, không đùn đẩy công việc hay trách nhiệm cho phòng khác khi vấn đề giải quyết vượt quá phạm vi chuyên môn của mình.
- Các máy móc trang thiết bị chuyên dụng được sử dụng với hiệu quả cao. Bộ máy quản lý của Công ty được xây dựng theo kiểu quản lý trực tuyến trên 2 cấp độ: Cấp công ty, cấp chi nhánh; cấp xí nghiệp