Khi đã có được chiến lược phát triển dịch vụ thanh toán quốc tế, ngân hàng phải bố trí phân bố các nguồn lực để phục vụ tốt cho chiến lược mình đã đề ra. Dịch vụ thanh toán quốc tế có các quy trình gồm nhiều bước thực hiện, đòi hỏi phải có sự thống nhất chặt chẽ giữa các bước. Yêu cầu đặt ra đối với quy trình là phải hoạt động một cách logic, nhịp nhàng theo thông lệ quốc tế (UCP 600). Phát triển hoạt động thanh toán quốc tế đồng thời phải phát triển các lĩnh vực kinh doanh khác của ngân hàng nhằm hỗ trợ cho cả quy trình, đem lại hiệu quả tốt nhất. Do đó, chuẩn bị và phân bổ nguồn lực chính là công việc quan trọng để định hướng phát triển dịch vụ thanh toán quốc tế.
Năm 2004 và 2005: Ngân hàng TMCP Quân Đội hoàn thiện mô hình quản lý 2 câp, mục đích là tăng quản lý theo chiều sâu, tạo tính lien kết theo chiều dọc giữa Sở giao dịch và các chi nhánh. Trong năm 2004, Ngân hàng TMCP Quân Đội đã thiết lập được quan hệ với 300 ngân hàng trên thế giới, con số này trong năm 2005 là 350. Mục đích là để đảm bảo cho việc xác nhận gián tiếp, đồng thời tạo mối quan hệ tốt với các bạn hàng có mối quan hệ với những ngân hàng này.
Năm 2006, với việc triển khai thành công hệ thống quản lý T24, Ngân hàng TMCP Quân Đội đã có thể đảm bảo được theo tiêu chuẩn quốc tế về công nghệ hỗ trợ dịch vụ thanh toán quốc tế. Ngoài ra, số lượng ngân hàng đại lý được thiết lập đã lên tới
dụng hệ thống quản trị rủi ro do Earnt & Young làm tư vấn, đây cũng là kiểm toán viên độc lập cho Ngân hàng TMCP Quân Đội từ năm 2006 tới nay. Ngoài ra, Ngân hàng TMCP Quân Đội cũng chính thức triển khai dự án cải cách hệ thống ngân hàng do tổ chức CIDA (Canada) tài trợ (Ngân hàng TMCP Quân Đội là một trong 2 ngân hàng Việt Nam được CIDA lựa chọn).
Trong năm 2007 và 2008, Ngân hàng TMCP Quân Đội vẫn chỉ tiếp tục sử dụng các nguồn lực sẵn có từ năm 2006 mà không triển khai thêm một nguồn lực nào khác để phục vụ cho dịch vụ thanh toán quốc tế ngoài việc tiếp tục mở rộng thiết lập quan hệ ngân hàng đại lý với các ngân hàng trên thế giới. Đến hết năm 2008 đã có 900 ngân hàng thiết lập quan hệ với Ngân hàng TMCP Quân Đội.
Về đội ngũ nhân lực, hàng năm Ngân hàng TMCP Quân Đội luôn có những đợt tuyển dụng với yêu cầu về trình độ và kinh nghiệm ngày càng ao nhằm phục vụ cho hoạt động kinh doanh của ngân hàng nói chung và cho dịch vụ thanh toán quốc tế nói riêng. Bên cạnh đó là các chương trình tập huấn cho đội ngũ nhân viên cũng liên tục được thực hiện. Cho tới 31 tháng 12 năm 2009, Ngân hàng TMCP Quân Đội đã có 2.424 cán bộ nhân viên trên toàn hệ thống, ngoài ra ngân hàng đã tổ chức 207 khóa đào tạo trong nước và 27 khóa đào tạo ở nước ngoài với tổng cộng 6.655 lượt người tham gia, chất lượng đào tạo cũng ngày được tăng lên.