Về tổ chức: Chi nhánh mới đi vào hoạt động nên trình độ của đội ngũ cán bộ chưa đồng đều, một số vị trí lãnh đạo các phòng còn thiếu, các phòng ban chưa thành lập đầy đủ để hỗ trợ kinh doanh. Cán bộ lãnh đạo thường xuyên phải hướng dẫn quy trình nghiệp vụ cho nhân viên, công tác tuyển dụng cán bộ có kinh nghiệm đặc biệt khó khăn do chất lượng nhân lực trên địa bàn không cao, công tác hỗ trợ cho tuyển dụng từ HO còn chậm trễ. Điều này ảnh hưởng rất nhiều tới chất lượng tín dụng của ngân hàng.
Về cơ chế uỷ quyền: Tổng giám đốc giao quyền phán quyết cho Chi nhánh còn thấp, thời gian trình duyệt hồ sơ qua quản lý tín dụng hội sở còn kéo dài, quản lý tín dụng chưa đưa ra chính sách tín dụng đối với khách hàng, vì vậy hạn chế việc phát triển khách hàng đồng thời khó tăng trưởng tín dụng.
Cơ sở vật chất, phương tiện làm việc: tiền thuê nhà cao ảnh hưởng tới lợi nhuận của Chi nhánh, xe chở tiền chuyên dụng chưa có, chi phí ban đầu của Chi nhánh quá lớn nên mặc dù tăng trưởng cao nhưng chưa phản ánh đúng thực
lực của Ngân hàng. Về công nghệ thông tin: máy móc phục vụ cho công việc đầy đủ song phần mềm ứng dụng còn nhiều bất cập, chưa tự động hoá khi lấy số liệu báo cáo Ngân hàng nhà nước theo công văn 477, chương trình quản lý hạn mức tín dụng, giải ngân theo dự án, chưa có phần mềm dự báo tài chính. Gây khó khăn cho cán bộ tín dụng trong công tác thẩm định và quản lý khách hàng, từ đó ảnh hưởng tới chất lượng tín dụng của ngân hàng.
Đội ngũ cán bộ nhân viên: Một số cán bộ tín dụng còn thiếu kinh nghiệm trong công tác thẩm định dự án, thiếu kinh nghiệm thực tế, đã làm giảm hiệu quả của công tác thẩm định xét duyệt cho vay của Ngân hàng. Từ đó ảnh hưởng chất lượng tín dụng chung của Ngân hàng.