Vì hợp đồng số 03/PI-PT/08 chưa kết thúc nên quy trình thanh khoản chưa diễn ra, bài báo cáo này nghiên cứu việc thanh khoản dựa trên hợp đồng số 02/PI-PT/07. Theo quy trình thanh khoản của Công ty thì hình thức thanh khoản giống nhau, chỉ khác là hợp đồng 02/PI-PT/07 áp dụng Quyết định 69/QĐ-BTC còn hợp đồng 03/PI-PT/08 áp dụng theo Thông tư 116/2008/TT-BTC và theo đó điểm khác nhau là Thông tư 116/2008/TT-BTC yêu cầu doanh nghiệp phải xuất trình bản thanh toán tiền gia công trong hồ sơ thanh khoản. Cụ thể:
Chậm nhất 45 ngày làm việc, kể từ ngày hợp đồng gia công (hoặc phụ lục hợp đồng gia công) kết thúc hoặc hết hiệu lực, doanh nghiệp phải nộp đầy đủ hồ sơ thanh khoản hợp đồng gia công (bao gồm cả phương án giải quyết nguyên liệu dư, máy móc thiếtt bị tạm nhập, phế liệu, phế phẩm, phế thải) cho Chi cục Hải quan quản lý hợp đồng gia công (theo khoản 2 điều XII Mục I Thông tư 116/2008/TT-BTC).
Hồ sơ thanh khoản chung khi xuất khẩu hàng gia công bao gồm: 1. Hợp đồng gia công và các phụ kiện hợp đồng.
2. Tất cả tờ khai xuất khẩu thuộc hợp đồng này (bao gồm cả tờ khai xuất khẩu tại chỗ, tờ khai giao sản phẩm gia công chuyển tiếp) đảm bảo các quy định hàng hóa đã thực xuất: bản chính (bản người khai Hải quan lưu).
3. Tất cả tờ khai nhập khẩu thuộc hợp đồng này (bao gồm cả tờ khai nhập tại chỗ và nhập chuyển tiếp): bản chính.
4. Bảng tổng hợp nguyên liệu, vật tư nhập khẩu theo mẫu 01/HSTK-GC- Phụ lục II: 01 bản chính.
5. Bảng tổng hợp sản phẩm gia công xuất khẩu theo mẫu 02/HSTK-GC-Phụ lục II: 01 bản chính.
6. Chứng từ thanh toán tiền công của bên thuê gia công: 01 bản sao. 7. Bảng tổng hợp nguyên liệu, vật tư xuất trả ra nước ngoài: 01 bản chính.
8. Bảng tổng hợp nguyên liệu, vật tư đã sử dụng để sản xuất thành phẩm: 01 bản chính.
9. Bảng thanh khoản hợp đồng gia công: 01 bản chính.
10. Bảng tổng hợp máy móc, thiết bị tạm nhập, tái xuất: 01 bản chính.
Sau khi thanh khoản hợp đồng số 02/PI-PT/07, toàn bộ nguyên phụ liệu còn dư sẽ được xuất trả một phần và phần còn lại được chuyển tiếp sang hợp đồng tiếp theo là hợp đồng số 03/PI-PT/08 theo thỏa thuận của cả hai bên. Thanh khoản hợp đồng không những giúp cơ quan Hải quan kiểm soát được nguyên phụ liệu nhập khẩu, thành phẩm xuất khẩu mà còn thể hiện trách nhiệm, đồng thời còn làm tăng uy tín của Công ty đối với cơ quan Hải quan.