Đây là khâu mở đầu của một chu trình ngân sách, nó đặt nền tảng cho các khâu tiếp theo. Lập dự toán ngân sách cho sự nghiệp y tế có vai trò quan trọng trong quá trình quản lý các khoản chi ngân sách nhà nớc cho sự nghiệp y tế. Muốn lập đợc phải dựa vào các căn cứ và phải có phơng pháp lập cụ thể, đồng thời phải nắm đợc trình tự lập các khoản chi cho ngân sách nhà nớc nh thế nào.
Khi lập dự toán ngân sách phải dựa trên các căn cứ sau :
- Phơng hớng phát triển kinh tế - xã hội của thành phố trong năm kế hoạch và những năm tiếp theo
- Dựa vào các chỉ tiêu của kế hoạch phát triển kinh tế - xã hội của thành phố, đặc biệt là các chỉ tiêu có liên quan đến việc cấp phát kinh phí cho sự nghiệp y tế kỳ kế hoạch.
- Dựa vào kết quả phân tích, đánh giá tình hình chi ngân sách cho sự nghiệp y tế các năm trớc, đặc biệt là năm báo cáo.
- Dựa trên thực trạng của ngành y tế và khả năng nguồn kinh phí có thể đáp ứng nhu cầu chi cho sự nghiệp y tế kỳ kế hoạch.
- Dựa trên các chính sách, chế độ, tiêu chuẩn, định mức, các biến động về giá cả, và các nhân tố kinh tế - xã hội khác có liên quan đến y tế.
* Quy trình lập dự toán:
- Các đơn vị dự toán là đơn vị trực tiếp thụ hởng ngân sách có trách nhiệm xây dựng dự toán năm kế hoạch của mình dựa trên những căn cứ nhất định gửi lên Sở Y tế xem xét.
- Sở Y tế tổng hợp kế hoạch thu - chi của toàn ngành ( gồm chi quản lý nhà nớc và chi sự nghiệp y tế ). Sau đó, Sở Y tế gửi cả dự toán tổng hợp và chi tiết sang Sở Tài chính vật giá để Sở Tài chính vật giá bố trí kế hoạch thu chi vào khối hành chính sự nghiệp toàn thành phố và trình lên HĐND thành phố phê chuẩn.
- Căn cứ vào dự toán năm đã đợc HĐND thành phố phê duyệt, Sở Tài chính vật giá cùng với Sở Y tế tiến hành phân bổ dự toán thu chi cho từng đơn vị.
- Các đơn vị (gồm các bệnh viện, các đơn vị thuộc khối phòng bệnh và khối y tế cơ sở) căn cứ vào dự toán năm đợc duyệt để lập kế hoạch thu chi hàng quý gửi Sở Tài chính vật giá.
* Nôi dung dự toán: Dự toán đợc xây dựng gồm hai phần:
- Đánh giá tình hình thực hiện thu chi ngân sách của năm thực hiện (phân tích nguyên nhân ảnh hởng đến tình hình thực hiện, những tồn tại để bổ sung, sửa đổi)
- Lập dự toán chi ngân sách cho năm kế hoạch đợc xác định theo mục lục ngân sách với những nội dung :
+ Kế hoạch chi mua sắm sửa chữa nhỏ
Việc lập kế hoạch phải căn cứ vào mục đích, phơng hớng chủ trơng phát triển ngành y tế của Đảng, Nhà nớc và của thành phố. Dự toán xác định bằng công thức :
Dự toán = Đối tợng x Mức chi x Thời gian chi
Việc lập dự toán chi mua sắm sữa chữa có định hớng đơn giá cụ thể, Sở Y tế có trách nhiệm tổng hợp kế hoạch ngân sách, chi NS chung của ngành gửi lên Sở tài chính vất giá và UBND thành phố. Sở tài chính vật giá phối hợp với Sở kế hoạch đầu t tổng hợp cân đối số liệu dự toán chi tiêu của ngành y tế trình lên UBND thành phố phê duyệt làm cơ sở xây dựng kế hoạch trình lên Chính phủ quyết định. Chính phủ thông qua Bộ tài chính, Bộ Y tế, Bộ Kế hoạch đầu t và các bộ ngành có liên quan đến Chính phủ xem xét, phê chuẩn.