VQG có nhiều lợi thế về cảnh quan thiên nhiên nhưng du lịch sinh thái của Bến En vẫn chưa được quan tâm khai thác đúng mức, cơ sở vật chất phục vụ du lịch sinh thái chưa được đầu tư nhiều, đội ngũ hướng dẫn viên chưa được đào tạo chuyên nghiệp,... Hiện tại, Vườn đã có quy hoạch phát triển du lịch sinh thái giai đoạn 2008- 2020 và đã kêu gọi đối tác để liên kết đầu tư, nhưng tiến độ thực hiện quy hoạch vẫn còn rất chậm do nhiều nguyên nhân khác nhau. Tuy nhiên, từ các chương trình đầu tư, phát triển du lịch sinh thái Bến En cũng đã có khởi sắc, công tác giáo dục môi trường đã được thực hiện thường xuyên, liên tục. Các hoạt động định hướng mang tính phát triển bền vững.
Thông qua hoạt động du lịch sinh thái, giáo dục môi trường đã giới thiệu
được rộng rãi đến mọi tầng lớp nhân dân trong vùng và du khách về giá trị của môi trường sinh thái, vai trò, vị trí của rừng, những lợi ích tiết thực mà rừng mang lại cũng như những giá trị của đa dạng sinh học cần được bảo tồn. Từ đó nâng cao
được nhận thức và ý thức trách nhiệm của mọi người trong việc cộng đồng tham gia bảo vệ rừng, bảo tồn đa dạng sinh học là bảo vệ cho chính mình.
Nguồn thu từ hoạt động du lịch sinh thái góp phần quan trọng cho công tác bảo tồn thiên nhiên và tái đầu tư cho phát triển du lịch sinh thái ở Vườn quốc gia
41
Bến En. Hàng năm, kinh phí thu được từ hoạt động du lịch đã phục vụ tốt cho công tác bảo vệ rừng. Tái đầu tư sửa chữa tàu, xuồng, máy móc, trang thiết bị để phục vụ
cho hoạt động du lịch. Sữa chữa nhà ở cho cán bộ công chức, viên chức và các công trình công cộng khác góp phần ổn định đời sống cho cán bộ làm công tác bảo tồn.
Hoạt động du lịch sinh thái sẽ làm ảnh hưởng đến hoạt động tự nhiên của các loài động vật, đặc biệt là các loài thú lớn, các loài chim nước tại vùng lòng hồ Bến En; chất thải của hoạt động du lịch có thể gây ảnh hướng đến môi trường sinh thái, cần phải được kiểm soát chặt chẻ; ý thức của một số du khách chưa cao có thể tác
động làm mất đi vẻ tự nhiên của cảnh quan thiên nhiên.
Theo kết quả điều tra cho thấy, hiện nay các nhà hàng trong khu vực VQG vẫn chưa có hệ thống xử lý nước thải và rác thải vẫn chưa được xử lý đúng cách. Mặc dù có các thùng rác đặt trên các tuyến đường đi trong khu du lịch sinh thái nhưng hầu hết vẫn không bỏ rác đúng nơi quy định. Do lượng khách đến tham quan du lịch vẫn chưa nhiều nên tác động này là không đáng kể. Nhưng nhất thiết phải có các biện pháp bảo vệ môi trường ngay từ bây giờ nếu không môi trường nơi đây sẽ
nhanh chóng xuống cấp và đe dọa đến các loài.